More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3556 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_3556  putative O-antigen acetylase  100 
 
 
658 aa  1322  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000981917  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5981  putative O-antigen acetylase  36.24 
 
 
662 aa  313  9e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1265  putative membrane-located cell surface saccharide acetylase  31.21 
 
 
660 aa  300  7e-80  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0870  acyltransferase 3  34.94 
 
 
695 aa  298  2e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5455  acyltransferase 3  38.28 
 
 
665 aa  298  3e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5014  acyltransferase 3  32.94 
 
 
695 aa  289  1e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.21213 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69170  putative O-antigen acetylase  35.67 
 
 
662 aa  279  1e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4448  acyltransferase 3  34.95 
 
 
679 aa  271  2e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00871902  normal  0.076246 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2505  acyltransferase 3  34.82 
 
 
665 aa  270  7e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.354964  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4615  acyltransferase 3  36.02 
 
 
630 aa  268  2e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0173701  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0997  acyltransferase family protein  33.53 
 
 
667 aa  259  8e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.378364  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1084  acyltransferase 3  30.56 
 
 
635 aa  259  8e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.87667  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0862  acyltransferase 3  32.21 
 
 
673 aa  255  2e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1981  acyltransferase 3  34.68 
 
 
671 aa  253  6e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.158164  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3871  acyltransferase 3  31.56 
 
 
690 aa  253  1e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.127096 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1947  acyltransferase 3  31.03 
 
 
642 aa  249  1e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5647  putative acyltransferase, group 3  32.62 
 
 
654 aa  246  8e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1233  acyltransferase 3  34.45 
 
 
656 aa  246  8e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00523739  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1762  acyltransferase 3  32.38 
 
 
662 aa  244  3e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.127648 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1772  acyltransferase 3  36.52 
 
 
683 aa  244  4e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.415848  normal  0.0191672 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1946  acyltransferase 3  35.31 
 
 
632 aa  240  5e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.63132 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5645  putative acyltransferase, group 3  32.77 
 
 
634 aa  238  3e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0770  acyltransferase 3  34.95 
 
 
684 aa  238  4e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1138  acyltransferase 3  30.31 
 
 
629 aa  236  8e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.725287  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2428  acyltransferase 3  38.31 
 
 
637 aa  234  5e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000222239  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5130  putative acyltransferase 3  37.07 
 
 
647 aa  233  6e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.13544  normal  0.266288 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1117  acyltransferase 3  31.6 
 
 
645 aa  233  1e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4447  acyltransferase 3  30.66 
 
 
695 aa  233  1e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0974085  normal  0.0718898 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0464  acyltransferase 3  31.4 
 
 
660 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.804151  normal  0.342656 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1349  acyltransferase 3  34.96 
 
 
629 aa  231  4e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0292256 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0265  acyltransferase 3  34.93 
 
 
645 aa  230  6e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.796474  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000263  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  30.58 
 
 
616 aa  229  1e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0069  acyltransferase 3  31.94 
 
 
652 aa  228  2e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000569017 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0337  acyltransferase 3  35.74 
 
 
690 aa  228  3e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1872  acyltransferase 3  35.55 
 
 
629 aa  224  5e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.642585 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1858  acyltransferase family protein  31.55 
 
 
636 aa  223  9e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.772864  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2692  acyltransferase domain-containing protein  34.44 
 
 
647 aa  222  2e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1561  acyltransferase 3  38.3 
 
 
643 aa  221  3e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1909  acyltransferase 3  36.34 
 
 
675 aa  221  3e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5009  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  29.12 
 
 
656 aa  219  9e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131159  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05637  acyltransferase  29.56 
 
 
615 aa  219  1e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0040  acyltransferase 3  32.87 
 
 
635 aa  216  7e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.578182  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2751  acyltransferase family protein  35.94 
 
 
640 aa  215  2e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0222973  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4561  acyltransferase 3  32.61 
 
 
626 aa  214  3e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.064478  normal  0.244827 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1096  acyltransferase 3  33.06 
 
 
614 aa  213  6e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5547  acyltransferase family protein  36.22 
 
 
628 aa  213  9e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4228  acyltransferase 3  32.06 
 
 
651 aa  213  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0660245  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0821  hypothetical protein  28.02 
 
 
660 aa  209  1e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02452  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  31.89 
 
 
639 aa  209  1e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.102125  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2758  O-antigen acetylase  42.52 
 
 
691 aa  209  2e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5087  acyltransferase 3  36.5 
 
 
627 aa  208  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2523  hypothetical protein  26.1 
 
 
657 aa  207  3e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0302  acyltransferase 3  30.21 
 
 
660 aa  207  5e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.183552 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2653  hypothetical protein  29 
 
 
657 aa  206  8e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011315  VSAL_p54_03  acyltransferase  30.41 
 
 
642 aa  206  9e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.362945  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0846  hypothetical protein  27.87 
 
 
660 aa  205  2e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26510  predicted acyltransferase  30.71 
 
 
681 aa  202  1e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0638  acyltransferase family protein  28.44 
 
 
647 aa  202  2e-50  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.482151 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0963  acyltransferase family protein  32.11 
 
 
759 aa  202  2e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.284523  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5132  putative acyltransferase  29.32 
 
 
638 aa  201  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0874375 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0435  acyltransferase 3  33.64 
 
 
679 aa  200  9e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.81712 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5281  hypothetical protein  33.48 
 
 
644 aa  199  1e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.458254  normal  0.151011 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0685  acyltransferase 3  29.83 
 
 
658 aa  198  2e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1310  acyltransferase 3  40.76 
 
 
621 aa  195  3e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.502976  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1701  hypothetical protein  30.42 
 
 
690 aa  194  5e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.205815  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0761  acyltransferase 3  30 
 
 
690 aa  193  8e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2845  hypothetical protein  25.88 
 
 
658 aa  192  1e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2714  hypothetical protein  26.45 
 
 
658 aa  192  2e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0544  acyltransferase 3  39.18 
 
 
675 aa  188  3e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0485  acyltransferase 3  27.69 
 
 
777 aa  187  7e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.712131  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0443  acyltransferase 3  28.51 
 
 
625 aa  186  1e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0119902 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2690  acyltransferase 3  29.91 
 
 
715 aa  183  1e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.208976  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08830  predicted acyltransferase  36.8 
 
 
711 aa  182  2e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.63777 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27650  predicted acyltransferase  29.14 
 
 
682 aa  181  4e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5131  putative acyltransferase  29.15 
 
 
632 aa  180  7e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0498038  normal  0.0856851 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1409  acyltransferase 3  24.04 
 
 
695 aa  177  4e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000344331  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2606  acyltransferase 3  28.4 
 
 
603 aa  177  5e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00250155  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0121  acyltransferase 3  40 
 
 
726 aa  175  2e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.695544  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0140  acyltransferase 3  40 
 
 
726 aa  175  3e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.939637 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0131  acyltransferase 3  40 
 
 
726 aa  175  3e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.971187  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26700  predicted acyltransferase  37.54 
 
 
718 aa  173  8e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1922  acyltransferase 3  39.03 
 
 
685 aa  173  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2824  acyltransferase 3  29.48 
 
 
598 aa  171  3e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26820  predicted acyltransferase  35.16 
 
 
720 aa  169  1e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1241  hypothetical protein  25.29 
 
 
675 aa  170  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3904  putative acyltransferase  32.57 
 
 
678 aa  167  6e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0525  acyltransferase 3  33.72 
 
 
583 aa  166  1e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0373578  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2396  acyltransferase 3  34.32 
 
 
716 aa  164  4e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0132066 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3189  acyltransferase 3  26.46 
 
 
688 aa  164  5e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00401  acyltransferase  25.9 
 
 
696 aa  164  7e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.8971  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6545  acyltransferase 3  31.68 
 
 
675 aa  162  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000351967 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00411  hypothetical protein  25.15 
 
 
622 aa  158  4e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.258731  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2687  acyltransferase 3  37.22 
 
 
734 aa  155  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.231986  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0955  acyltransferase 3  34.08 
 
 
710 aa  151  3e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.41733  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26680  predicted acyltransferase  35.76 
 
 
679 aa  151  3e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1902  acyltransferase 3  27.64 
 
 
742 aa  152  3e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.73797  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0938  acyltransferase 3  34.08 
 
 
710 aa  151  3e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0213168  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1805  O-antigen acetylase  37.82 
 
 
728 aa  150  7e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2108  putative O-antigen acetylase  37.97 
 
 
727 aa  150  8e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.665251  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0375  putative acyltransferase  37.82 
 
 
702 aa  150  9e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.020751  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>