More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0094 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_0109  AMP-dependent synthetase and ligase  66.6 
 
 
516 aa  707    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.685068  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0094  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
519 aa  1071    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1424  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  31.26 
 
 
504 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1487  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  31.06 
 
 
504 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1092  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  30.32 
 
 
504 aa  244  3e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1261  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  31.06 
 
 
504 aa  243  7e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.242821  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1530  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  30.86 
 
 
504 aa  243  7e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3920  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  31.06 
 
 
504 aa  243  7.999999999999999e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1259  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  31.06 
 
 
504 aa  242  9e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1461  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  31.06 
 
 
504 aa  242  9e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0165  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  31.29 
 
 
506 aa  242  1e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000579194  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1294  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  31.06 
 
 
504 aa  242  1e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.711083  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1287  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  31.06 
 
 
503 aa  238  2e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1389  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  31.06 
 
 
503 aa  238  2e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0518  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  29.41 
 
 
485 aa  227  5.0000000000000005e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0932  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  30.52 
 
 
485 aa  226  9e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.210053  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0951  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  30.52 
 
 
485 aa  226  9e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0952  AMP-dependent synthetase and ligase  33.59 
 
 
478 aa  221  3e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.728671  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1365  AMP-dependent synthetase and ligase  32.64 
 
 
477 aa  221  3e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1374  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  30.65 
 
 
499 aa  220  3.9999999999999997e-56  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0940  AMP-dependent synthetase and ligase  32.8 
 
 
478 aa  219  7e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2910  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 
477 aa  219  1e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2937  AMP-dependent synthetase and ligase  32.16 
 
 
494 aa  216  5.9999999999999996e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.603503 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1793  amino acid adenylation domain protein  34.59 
 
 
516 aa  216  8e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.787997  normal  0.406498 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1818  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  29.76 
 
 
502 aa  211  2e-53  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000381678  hitchhiker  0.00010447 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0252  D-alanine-activating enzyme  31.81 
 
 
508 aa  210  6e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1817  D-alanine-activating enzyme  28.75 
 
 
509 aa  201  1.9999999999999998e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.493619  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1790  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  31.33 
 
 
511 aa  199  7e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0802  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  27.88 
 
 
516 aa  176  6e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2030  amino acid adenylation domain-containing protein  31.08 
 
 
550 aa  169  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03120  putative peptide synthetase protein  30.23 
 
 
1418 aa  161  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2036  non-ribosomal peptide synthase amino acid adenylation subunit  32.97 
 
 
541 aa  161  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.481352 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2774  AMP-dependent synthetase and ligase  30.56 
 
 
514 aa  159  1e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.149063  decreased coverage  0.000872135 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0093  AMP-dependent synthetase and ligase  29.49 
 
 
510 aa  159  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0108  AMP-dependent synthetase and ligase  30.18 
 
 
506 aa  158  2e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4121  amino acid adenylation domain protein  31.61 
 
 
1583 aa  154  5e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.183322  normal  0.106605 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1182  enterobactin synthetase component F-related protein  25.92 
 
 
556 aa  153  5.9999999999999996e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1151  amino acid adenylation domain-containing protein  28.48 
 
 
496 aa  153  8e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1879  amino acid adenylation domain-containing protein  27.82 
 
 
2419 aa  153  8e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  28.43 
 
 
9498 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2576  amino acid adenylation  29.84 
 
 
3165 aa  150  4e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3052  amino acid adenylation domain-containing protein  33.33 
 
 
524 aa  150  4e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0113678 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  27.94 
 
 
13537 aa  150  5e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0073  amino acid adenylation domain protein  28.92 
 
 
1439 aa  150  5e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.236187  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3418  amino acid adenylation domain protein  26 
 
 
4354 aa  150  7e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.696209 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3675  amino acid adenylation domain protein  28.85 
 
 
2619 aa  149  9e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0009  amino acid adenylation  32.15 
 
 
2791 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0712365 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3532  amino acid adenylation  25.87 
 
 
3718 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2526  amino acid adenylation domain protein  28.67 
 
 
535 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0452126 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1698  amino acid adenylation domain-containing protein  29.93 
 
 
1278 aa  147  4.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.123455 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3408  amino acid adenylation domain protein  26.18 
 
 
3207 aa  147  5e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1829  amino acid adenylation  27.78 
 
 
4037 aa  147  5e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2579  amino acid adenylation domain-containing protein  29.83 
 
 
649 aa  147  5e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.947565  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3335  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  30.63 
 
 
1617 aa  147  6e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0388415  normal  0.286594 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1749  amino acid adenylation domain protein  30.21 
 
 
1199 aa  147  6e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.82306  normal  0.0351239 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2150  pyoverdine sidechain peptide synthetase IV, D-Asp-L-Ser component  29.47 
 
 
2875 aa  145  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2829  non-ribosomal peptide synthetase SyfA  29.22 
 
 
3168 aa  144  3e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  27.51 
 
 
4968 aa  144  5e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0670  amino acid adenylation domain-containing protein  28.63 
 
 
517 aa  144  5e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9641  peptide synthetase  29.58 
 
 
3761 aa  144  6e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1745  amino acid adenylation domain protein  30.6 
 
 
625 aa  144  6e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.825969 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2390  amino acid adenylation domain protein  28.35 
 
 
1490 aa  143  7e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.215425  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0188  amino acid adenylation domain-containing protein  29.3 
 
 
1638 aa  143  9e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2689  AMP-dependent synthetase and ligase  29.08 
 
 
507 aa  142  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2723  amino acid adenylation domain protein  28.03 
 
 
591 aa  142  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2149  pyoverdine sidechain peptide synthetase III, L-Thr-L-Ser component  27.98 
 
 
2151 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2735  bacitracin synthetase 1  27.27 
 
 
2336 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.56804e-17 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6298  amino acid adenylation domain protein  29.22 
 
 
893 aa  141  3e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.620123 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2615  amino acid adenylation  27.82 
 
 
5469 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.301045 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18410  non-ribosomal peptide synthase/amino acid adenylation enzyme  30.41 
 
 
7310 aa  140  7e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0798  amino acid adenylation domain protein  28.52 
 
 
4183 aa  140  7e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6473  amino acid adenylation domain-containing protein  29.53 
 
 
8915 aa  140  7e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.47545 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  29.78 
 
 
8914 aa  140  7.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2830  non-ribosomal peptide synthetase SyfB  28.4 
 
 
5929 aa  139  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2540  AMP-binding enzyme  27.07 
 
 
2345 aa  139  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1659  linear gramicidin synthetase subunit C  30.94 
 
 
505 aa  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0625323  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4746  amino acid adenylation  25.69 
 
 
983 aa  139  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0687  amino acid adenylation domain-containing protein  28.49 
 
 
521 aa  139  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5750  amino acid adenylation domain protein  26.46 
 
 
1454 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2554  bacitracin synthetase 1  27.07 
 
 
2338 aa  139  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000340307 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2463  bacitracin synthetase 1  27.2 
 
 
4960 aa  138  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3562  peptide synthase  28.11 
 
 
4317 aa  138  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1578  linear gramicidin synthetase subunit C  30.94 
 
 
505 aa  139  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2413  amino acid adenylation domain-containing protein  27.57 
 
 
1569 aa  139  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0846  amino acid adenylation domain-containing protein  27.25 
 
 
2710 aa  138  3.0000000000000003e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2131  hypothetical protein  25.25 
 
 
1439 aa  138  3.0000000000000003e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3788  non-ribosomal peptide synthetase, putative  27.69 
 
 
517 aa  137  4e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0278843 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6901  amino acid adenylation domain protein  27.35 
 
 
2273 aa  137  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1956  non-ribosomal peptide synthetase, putative  29.3 
 
 
2967 aa  137  4e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2421  non-ribosomal peptide synthetase/polyketide synthase  29.63 
 
 
1044 aa  137  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.232071  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0191  amino acid adenylation domain-containing protein  31.2 
 
 
1071 aa  137  5e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604981  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0146  nonribosomal peptide synthetase  30.94 
 
 
505 aa  137  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.119564  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3744  amino acid adenylation domain protein  27.38 
 
 
1110 aa  137  5e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.696362  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4756  amino acid adenylation domain-containing protein  28.49 
 
 
1789 aa  137  5e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171459  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3874  amino acid adenylation domain protein  32.5 
 
 
1665 aa  137  6.0000000000000005e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0218124 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0572  amino acid adenylation domain protein  29.53 
 
 
1357 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2522  non-ribosomal peptide synthase  29.74 
 
 
2979 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.207691  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0965  amino acid adenylation domain protein  26.14 
 
 
1506 aa  137  6.0000000000000005e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6287  amino acid adenylation domain protein  27.78 
 
 
1344 aa  136  7.000000000000001e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1921  hypothetical protein  27.13 
 
 
507 aa  136  8e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>