More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2910 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2910  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 477 aa  988    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0940  AMP-dependent synthetase and ligase  89.73 
 
 		 478 aa  891    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1365  AMP-dependent synthetase and ligase  95.18 
 
 		 477 aa  946    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0952  AMP-dependent synthetase and ligase  88.89 
 
 		 478 aa  885    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.728671  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2937  AMP-dependent synthetase and ligase  40.3 
 
 		 494 aa  330  3e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.603503 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1092  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  36.27 
 
 		 504 aa  279  1e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3920  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  36.27 
 
 		 504 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0165  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  35.99 
 
 		 506 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000579194  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1530  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  35.86 
 
 		 504 aa  274  3e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1287  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  36.14 
 
 		 503 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1424  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  36.27 
 
 		 504 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1389  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  36.14 
 
 		 503 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1487  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  35.86 
 
 		 504 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1294  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  36.48 
 
 		 504 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.711083  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1261  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  35.86 
 
 		 504 aa  273  7e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.242821  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1259  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  36.07 
 
 		 504 aa  271  1e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1461  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  36.07 
 
 		 504 aa  271  1e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0951  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  37.15 
 
 		 485 aa  271  2e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0932  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  37.15 
 
 		 485 aa  271  2e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.210053  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0518  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  36.94 
 
 		 485 aa  265  1e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1817  D-alanine-activating enzyme  33.87 
 
 		 509 aa  256  6e-67  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.493619  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1818  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  33.61 
 
 		 502 aa  253  7e-66  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000381678  hitchhiker  0.00010447 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1374  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  33.13 
 
 		 499 aa  245  9.999999999999999e-64  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0252  D-alanine-activating enzyme  34.37 
 
 		 508 aa  243  7e-63  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0802  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  31.98 
 
 		 516 aa  234  2.0000000000000002e-60  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1790  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  34.03 
 
 		 511 aa  233  8.000000000000001e-60  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1793  amino acid adenylation domain protein  34.62 
 
 		 516 aa  228  2e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.787997  normal  0.406498 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0109  AMP-dependent synthetase and ligase  33.93 
 
 		 516 aa  228  2e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.685068  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0094  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 519 aa  219  1e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2554  bacitracin synthetase 1  31.08 
 
 		 2338 aa  203  5e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000340307 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2735  bacitracin synthetase 1  31.06 
 
 		 2336 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.56804e-17 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2540  AMP-binding enzyme  30.66 
 
 		 2345 aa  196  6e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0093  AMP-dependent synthetase and ligase  32.1 
 
 		 510 aa  183  5.0000000000000004e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25650  peptide synthase  28.63 
 
 		 4318 aa  182  9.000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2131  hypothetical protein  30.08 
 
 		 1439 aa  180  4e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1335  amino acid adenylation domain protein  29.53 
 
 		 1104 aa  180  5.999999999999999e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5870  amino acid adenylation domain protein  30.3 
 
 		 2164 aa  179  7e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2212  amino acid adenylation  30.1 
 
 		 5422 aa  179  7e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0108  AMP-dependent synthetase and ligase  31.81 
 
 		 506 aa  178  2e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1609  amino acid adenylation  29.34 
 
 		 3252 aa  178  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  31.25 
 
 		 5953 aa  177  3e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  29.45 
 
 		 6889 aa  177  4e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0833  peptide synthetase  27.94 
 
 		 514 aa  177  5e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2150  pyoverdine sidechain peptide synthetase IV, D-Asp-L-Ser component  29.53 
 
 		 2875 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18410  non-ribosomal peptide synthase/amino acid adenylation enzyme  30.7 
 
 		 7310 aa  176  9.999999999999999e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1959  amino acid adenylation  30.16 
 
 		 2154 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.992857 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1162  AMP-binding domain-containing protein  27.73 
 
 		 514 aa  175  1.9999999999999998e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1758  amino acid adenylation domain-containing protein  29.8 
 
 		 2386 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3730  amino acid adenylation domain-containing protein  30.95 
 
 		 2651 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.390082 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7298  peptide synthetase  32.79 
 
 		 2573 aa  174  2.9999999999999996e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34810  putative non-ribosomal peptide synthetase  31.67 
 
 		 1249 aa  172  9e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0377167  normal  0.0213793 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3743  amino acid adenylation domain protein  29.59 
 
 		 2626 aa  172  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2149  pyoverdine sidechain peptide synthetase III, L-Thr-L-Ser component  28.6 
 
 		 2151 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2462  linear gramicidin synthetase subunit D  29.12 
 
 		 2156 aa  171  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  30.59 
 
 		 6676 aa  171  3e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1832  amino acid adenylation  28.43 
 
 		 1801 aa  171  3e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2874  non-ribosomal peptide synthase  28.71 
 
 		 2156 aa  171  3e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  28.52 
 
 		 8914 aa  171  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1958  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  29.61 
 
 		 2666 aa  170  4e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.815513 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4753  amino acid adenylation domain-containing protein  29.96 
 
 		 6176 aa  170  6e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.86552 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1829  amino acid adenylation  28.51 
 
 		 4037 aa  170  6e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2089  amino acid adenylation domain-containing protein  29.9 
 
 		 2138 aa  169  7e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4518  non-ribosomal peptide synthetase, initiating component  28.78 
 
 		 1753 aa  169  8e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0695  non-ribosomal peptide synthetase  28.57 
 
 		 3291 aa  169  8e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.622014  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0465  amino acid adenylation domain protein  28.54 
 
 		 1047 aa  169  8e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.774823  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1938  putative peptide synthetase  28.71 
 
 		 1520 aa  169  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1646  putative peptide synthetase  28.71 
 
 		 1483 aa  169  1e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1733  putative peptide synthetase  28.71 
 
 		 1528 aa  169  1e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4083  amino acid adenylation domain-containing protein  27.55 
 
 		 3942 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223479 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0618  putative peptide synthetase  28.71 
 
 		 1483 aa  169  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.099304  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  29.95 
 
 		 4317 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2137  linear gramicidin synthetase subunit C  29.51 
 
 		 1719 aa  168  2e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2576  amino acid adenylation  31.5 
 
 		 3165 aa  168  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  31.1 
 
 		 9498 aa  168  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2615  amino acid adenylation  28.74 
 
 		 5469 aa  168  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.301045 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3545  amino acid adenylation domain-containing protein  29.53 
 
 		 1029 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1411  linear gramicidin synthetase subunit C  29.51 
 
 		 1719 aa  168  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.750656  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1676  amino acid adenylation domain-containing protein  29.01 
 
 		 3432 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.602072 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3345  non-ribosomal peptide synthetase  28.37 
 
 		 1059 aa  168  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0251 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3177  nonribosomal peptide synthetase  29.51 
 
 		 1719 aa  168  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2829  non-ribosomal peptide synthetase SyfA  28.99 
 
 		 3168 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6473  amino acid adenylation domain-containing protein  29.24 
 
 		 8915 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.47545 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  28.22 
 
 		 4531 aa  167  4e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2214  syringomycin synthetase  28.37 
 
 		 3348 aa  167  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1956  non-ribosomal peptide synthetase, putative  29.51 
 
 		 2967 aa  167  4e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3744  amino acid adenylation domain protein  29.76 
 
 		 1110 aa  167  4e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.696362  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2030  amino acid adenylation domain-containing protein  32.69 
 
 		 550 aa  167  5e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2102  amino acid adenylation domain-containing protein  28.27 
 
 		 1481 aa  166  6.9999999999999995e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.73819  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2265  amino acid adenylation  29.61 
 
 		 3002 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.580207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1312  amino acid adenylation domain protein  30.35 
 
 		 1225 aa  165  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5618  amino acid adenylation domain-containing protein  28.8 
 
 		 2156 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1960  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  28.73 
 
 		 2883 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.77716 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4099  non-ribosomal peptide synthase  28.92 
 
 		 2033 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.908444 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2663  nonribosomal peptide synthetase  29.49 
 
 		 2979 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2420  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  29.65 
 
 		 1839 aa  165  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452144  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0576  amino acid adenylation domain protein  28.92 
 
 		 503 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1861  amino acid adenylation domain-containing protein  29.38 
 
 		 2883 aa  165  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25570  peptide synthase  28.51 
 
 		 5213 aa  166  1.0000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1066  AMP-dependent synthetase and ligase  33.06 
 
 		 539 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5753  amino acid adenylation domain protein  32.16 
 
 		 1525 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>