More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1374 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_1374  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  100 
 
 
499 aa  1024    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1790  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  43.22 
 
 
511 aa  409  1e-113  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0802  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  42.8 
 
 
516 aa  398  1e-109  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1817  D-alanine-activating enzyme  41.28 
 
 
509 aa  394  1e-108  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.493619  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0252  D-alanine-activating enzyme  42.43 
 
 
508 aa  390  1e-107  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1818  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  42.46 
 
 
502 aa  390  1e-107  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000381678  hitchhiker  0.00010447 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1424  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  39.8 
 
 
504 aa  356  5e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1261  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  39.8 
 
 
504 aa  355  6.999999999999999e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.242821  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1530  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  39.8 
 
 
504 aa  355  1e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1487  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  39.8 
 
 
504 aa  354  2e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1287  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  40.04 
 
 
503 aa  354  2e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1259  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  39.96 
 
 
504 aa  354  2e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1461  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  39.96 
 
 
504 aa  354  2e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1389  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  40.04 
 
 
503 aa  354  2e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3920  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  39.77 
 
 
504 aa  350  2e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1294  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  38.89 
 
 
504 aa  349  7e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.711083  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1092  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  38.89 
 
 
504 aa  348  9e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0951  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  39.3 
 
 
485 aa  344  2e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0932  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  39.3 
 
 
485 aa  344  2e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.210053  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0518  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  37.91 
 
 
485 aa  342  1e-92  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1793  amino acid adenylation domain protein  37.5 
 
 
516 aa  327  2.0000000000000001e-88  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.787997  normal  0.406498 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0165  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  37.7 
 
 
506 aa  319  7.999999999999999e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000579194  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0952  AMP-dependent synthetase and ligase  32.99 
 
 
478 aa  248  2e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.728671  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2910  AMP-dependent synthetase and ligase  33.13 
 
 
477 aa  245  9.999999999999999e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0940  AMP-dependent synthetase and ligase  33.54 
 
 
478 aa  245  1.9999999999999999e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1365  AMP-dependent synthetase and ligase  32.58 
 
 
477 aa  242  9e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2937  AMP-dependent synthetase and ligase  31.13 
 
 
494 aa  240  4e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.603503 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0109  AMP-dependent synthetase and ligase  29.69 
 
 
516 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.685068  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0094  AMP-dependent synthetase and ligase  30.65 
 
 
519 aa  220  3.9999999999999997e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0833  peptide synthetase  31.17 
 
 
514 aa  217  4e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1162  AMP-binding domain-containing protein  30.27 
 
 
514 aa  213  7e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0846  amino acid adenylation domain-containing protein  31.04 
 
 
2710 aa  206  6e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0425  amino acid adenylation domain-containing protein  27.22 
 
 
1405 aa  203  4e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.939372 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1845  peptide synthase  28.21 
 
 
5654 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  28.29 
 
 
4502 aa  201  3e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0576  amino acid adenylation domain protein  30.06 
 
 
503 aa  200  6e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2338  peptide synthetase  30.49 
 
 
2387 aa  198  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1676  amino acid adenylation domain-containing protein  29.66 
 
 
3432 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.602072 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17200  non-ribosomal peptide synthase  28.13 
 
 
504 aa  198  2.0000000000000003e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.699646  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3342  peptide synthetase  31.09 
 
 
1334 aa  196  7e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2420  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  30.42 
 
 
1839 aa  196  8.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452144  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5870  amino acid adenylation domain protein  29.79 
 
 
2164 aa  196  8.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0824  amino acid adenylation domain protein  31.62 
 
 
1449 aa  196  9e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0591001 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2735  bacitracin synthetase 1  29.07 
 
 
2336 aa  196  9e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.56804e-17 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0415  amino acid adenylation domain-containing protein  30.37 
 
 
502 aa  196  1e-48  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2213  amino acid adenylation  30.04 
 
 
4882 aa  196  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2540  AMP-binding enzyme  29.07 
 
 
2345 aa  195  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1496  amino acid adenylation domain-containing protein  30.85 
 
 
502 aa  194  3e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.283025  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2093  amino acid adenylation domain-containing protein  31.77 
 
 
2410 aa  194  4e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2386  amino acid adenylation domain protein  29.7 
 
 
1893 aa  194  4e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3702  non ribosomal peptide synthase  29.01 
 
 
1134 aa  194  4e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0163021  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2554  bacitracin synthetase 1  29.07 
 
 
2338 aa  193  5e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000340307 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3744  amino acid adenylation domain protein  29.13 
 
 
1110 aa  193  5e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.696362  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9643  peptide synthetase  30.34 
 
 
2561 aa  192  8e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2402  nonribosomal peptide synthetase DhbF  30.65 
 
 
2385 aa  192  9e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.777196  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1758  amino acid adenylation domain-containing protein  31.17 
 
 
2386 aa  192  1e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7298  peptide synthetase  31.24 
 
 
2573 aa  191  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4085  amino acid adenylation domain-containing protein  29.08 
 
 
2606 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2147  nonribosomal peptide synthetase  29.77 
 
 
2385 aa  191  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.633458  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2830  non-ribosomal peptide synthetase SyfB  29.96 
 
 
5929 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4658  amino acid adenylation domain-containing protein  28.92 
 
 
1449 aa  191  2.9999999999999997e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.702591  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2337  nonribosomal peptide synthetase DhbF  30.02 
 
 
2385 aa  190  4e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2577  amino acid adenylation  28.87 
 
 
5926 aa  190  5e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1574  amino acid adenylation domain-containing protein  28.69 
 
 
1714 aa  190  5e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2378  amino acid adenylation domain protein  32.02 
 
 
3695 aa  190  5e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2390  nonribosomal peptide synthetase DhbF  29.96 
 
 
2385 aa  189  7e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2472  nonribosomal peptide synthetase DhbF  30.02 
 
 
2385 aa  189  7e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2869  amino acid adenylation domain-containing protein  28.4 
 
 
5328 aa  189  9e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.127211 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4746  amino acid adenylation  28.04 
 
 
983 aa  189  9e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1965  amino acid adenylation domain-containing protein  27.61 
 
 
2439 aa  189  1e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.229236 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0188  amino acid adenylation domain-containing protein  29.08 
 
 
1638 aa  188  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1877  amino acid adenylation domain-containing protein  27.69 
 
 
1525 aa  188  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2381  amino acid adenylation domain protein  29.56 
 
 
4196 aa  188  2e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1907  amino acid adenylation domain-containing protein  28.6 
 
 
625 aa  188  2e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6814  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  29.55 
 
 
8646 aa  187  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1874  amino acid adenylation domain-containing protein  30.38 
 
 
1553 aa  187  3e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01401  enterobactin synthase subunit F  29.44 
 
 
1317 aa  187  3e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2149  pyoverdine sidechain peptide synthetase III, L-Thr-L-Ser component  30.65 
 
 
2151 aa  187  4e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3731  amino acid adenylation domain-containing protein  28.74 
 
 
1130 aa  187  4e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0201667  normal  0.167868 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1494  amino acid adenylation domain protein  28.16 
 
 
2846 aa  187  5e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2988  nonribosomal peptide synthetase DhbF  29.24 
 
 
2385 aa  186  6e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1882  amino acid adenylation domain-containing protein  27.67 
 
 
5596 aa  186  6e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2208  nonribosomal peptide synthetase DhbF  29.77 
 
 
2385 aa  186  7e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2372  nonribosomal peptide synthetase DhbF  29.77 
 
 
2385 aa  186  7e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3733  amino acid adenylation domain protein  28.38 
 
 
2855 aa  186  9e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2329  amino acid adenylation domain protein  30.8 
 
 
2752 aa  185  1.0000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0024  linear gramicidin synthetase subunit D  28.07 
 
 
3374 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3984  amino acid adenylation  26.47 
 
 
1643 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.585972 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2212  amino acid adenylation  28.4 
 
 
5422 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  27.48 
 
 
4342 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1615  amino acid adenylation domain-containing protein  29.31 
 
 
3221 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0566356 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1717  multifunctional nonribosomal peptide synthetase (mycosubtilin synthetase)  31.77 
 
 
2295 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4985  amino acid adenylation domain protein  28.18 
 
 
1336 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.247998 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2874  non-ribosomal peptide synthase  28.74 
 
 
2156 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3092  amino acid adenylation domain protein  28.77 
 
 
1533 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6813  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase  27.24 
 
 
4383 aa  184  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  28.21 
 
 
6889 aa  184  3e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2131  nonribosomal peptide synthetase  29.26 
 
 
2385 aa  184  3e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1959  amino acid adenylation  30.61 
 
 
2154 aa  184  3e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.992857 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3416  amino acid adenylation domain protein  29.67 
 
 
1020 aa  184  3e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0257508  normal  0.239752 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>