More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0952 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012917  PC1_2910  AMP-dependent synthetase and ligase  88.89 
 
 
477 aa  885    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0940  AMP-dependent synthetase and ligase  90.17 
 
 
478 aa  904    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0952  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
478 aa  994    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.728671  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1365  AMP-dependent synthetase and ligase  89.31 
 
 
477 aa  891    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2937  AMP-dependent synthetase and ligase  40.6 
 
 
494 aa  334  3e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.603503 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1092  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  35.63 
 
 
504 aa  277  3e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1530  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  35.63 
 
 
504 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1261  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  35.63 
 
 
504 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.242821  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1294  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  36.44 
 
 
504 aa  273  3e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.711083  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1487  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  35.43 
 
 
504 aa  274  3e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3920  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  35.63 
 
 
504 aa  273  3e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1424  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  35.43 
 
 
504 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1287  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  35.43 
 
 
503 aa  273  6e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1389  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  35.43 
 
 
503 aa  273  6e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1461  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  35.43 
 
 
504 aa  273  7e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1259  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  35.43 
 
 
504 aa  273  7e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0165  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  34.81 
 
 
506 aa  272  1e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000579194  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0518  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  36.52 
 
 
485 aa  269  7e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0932  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  35.88 
 
 
485 aa  265  1e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.210053  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0951  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  35.88 
 
 
485 aa  265  1e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1818  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  33.33 
 
 
502 aa  249  7e-65  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000381678  hitchhiker  0.00010447 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1374  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  32.99 
 
 
499 aa  248  2e-64  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1817  D-alanine-activating enzyme  33.2 
 
 
509 aa  248  2e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.493619  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0802  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  33.2 
 
 
516 aa  238  3e-61  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1790  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  34.22 
 
 
511 aa  234  4.0000000000000004e-60  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0252  D-alanine-activating enzyme  32.19 
 
 
508 aa  232  1e-59  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0109  AMP-dependent synthetase and ligase  32.72 
 
 
516 aa  225  1e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.685068  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1793  amino acid adenylation domain protein  34.2 
 
 
516 aa  224  2e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.787997  normal  0.406498 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0094  AMP-dependent synthetase and ligase  33.59 
 
 
519 aa  221  3e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2554  bacitracin synthetase 1  31.04 
 
 
2338 aa  209  6e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000340307 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2735  bacitracin synthetase 1  30.77 
 
 
2336 aa  207  3e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.56804e-17 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2540  AMP-binding enzyme  30.37 
 
 
2345 aa  203  5e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1609  amino acid adenylation  30.35 
 
 
3252 aa  189  8e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2131  hypothetical protein  29.1 
 
 
1439 aa  189  1e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2212  amino acid adenylation  30.37 
 
 
5422 aa  188  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25650  peptide synthase  29.48 
 
 
4318 aa  186  5e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0093  AMP-dependent synthetase and ligase  32.3 
 
 
510 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5870  amino acid adenylation domain protein  31.03 
 
 
2164 aa  184  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3743  amino acid adenylation domain protein  30.41 
 
 
2626 aa  184  3e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1335  amino acid adenylation domain protein  29.08 
 
 
1104 aa  183  5.0000000000000004e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34810  putative non-ribosomal peptide synthetase  32.3 
 
 
1249 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0377167  normal  0.0213793 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  29.9 
 
 
6889 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4753  amino acid adenylation domain-containing protein  29.61 
 
 
6176 aa  180  5.999999999999999e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.86552 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5872  amino acid adenylation domain protein  29.35 
 
 
1550 aa  179  7e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00539466 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1959  amino acid adenylation  30.28 
 
 
2154 aa  179  7e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.992857 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18410  non-ribosomal peptide synthase/amino acid adenylation enzyme  29.96 
 
 
7310 aa  178  2e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  31.57 
 
 
5953 aa  177  3e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0009  amino acid adenylation  29.27 
 
 
2791 aa  177  4e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0712365 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1958  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  30.08 
 
 
2666 aa  176  6e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.815513 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2211  amino acid adenylation  30.22 
 
 
2136 aa  176  7e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2150  pyoverdine sidechain peptide synthetase IV, D-Asp-L-Ser component  30.87 
 
 
2875 aa  176  8e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  31.3 
 
 
9498 aa  176  8e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2462  linear gramicidin synthetase subunit D  29.74 
 
 
2156 aa  176  8e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2149  pyoverdine sidechain peptide synthetase III, L-Thr-L-Ser component  29.41 
 
 
2151 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7298  peptide synthetase  33.18 
 
 
2573 aa  175  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  30.59 
 
 
6676 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1829  amino acid adenylation  28.75 
 
 
4037 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0833  peptide synthetase  27.82 
 
 
514 aa  174  2.9999999999999996e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0108  AMP-dependent synthetase and ligase  32.02 
 
 
506 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3090  amino acid adenylation domain protein  28.15 
 
 
1466 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4518  non-ribosomal peptide synthetase, initiating component  28.37 
 
 
1753 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4120  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  30.02 
 
 
2720 aa  173  5.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0715236 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1758  amino acid adenylation domain-containing protein  31.1 
 
 
2386 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1608  amino acid adenylation  27.51 
 
 
3194 aa  172  9e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3345  non-ribosomal peptide synthetase  28.86 
 
 
1059 aa  172  9e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0251 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  30.69 
 
 
4336 aa  172  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1162  AMP-binding domain-containing protein  27.62 
 
 
514 aa  172  1e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2089  amino acid adenylation domain-containing protein  31.13 
 
 
2138 aa  172  1e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5618  amino acid adenylation domain-containing protein  28.14 
 
 
2156 aa  171  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2615  amino acid adenylation  29.18 
 
 
5469 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.301045 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2874  non-ribosomal peptide synthase  29.34 
 
 
2156 aa  172  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2265  amino acid adenylation  30.51 
 
 
3002 aa  172  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.580207  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1558  amino acid adenylation domain-containing protein  29.96 
 
 
3227 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.765691 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5750  amino acid adenylation domain protein  28.11 
 
 
1454 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1861  amino acid adenylation domain-containing protein  27.7 
 
 
2883 aa  171  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3973  amino acid adenylation domain-containing protein  30.18 
 
 
6661 aa  171  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3031  amino acid adenylation domain protein  28.15 
 
 
1466 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3545  amino acid adenylation domain-containing protein  29.09 
 
 
1029 aa  171  3e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  29.11 
 
 
4336 aa  171  3e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0695  non-ribosomal peptide synthetase  30.41 
 
 
3291 aa  171  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.622014  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0576  amino acid adenylation domain protein  29.53 
 
 
503 aa  171  4e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2655  amino acid adenylation domain-containing protein  29.23 
 
 
1321 aa  170  4e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.326084  normal  0.533247 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1676  amino acid adenylation domain-containing protein  29.76 
 
 
3432 aa  171  4e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.602072 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  31.37 
 
 
8914 aa  170  5e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0465  amino acid adenylation domain protein  28.87 
 
 
1047 aa  170  5e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.774823  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1845  peptide synthase  29.28 
 
 
5654 aa  170  5e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1858  amino acid adenylation domain-containing protein  28.83 
 
 
1528 aa  170  5e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2214  syringomycin synthetase  30.15 
 
 
3348 aa  170  5e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1733  putative peptide synthetase  30.56 
 
 
1528 aa  170  5e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1938  putative peptide synthetase  30.56 
 
 
1520 aa  170  5e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1646  putative peptide synthetase  30.56 
 
 
1483 aa  170  6e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0618  putative peptide synthetase  30.56 
 
 
1483 aa  170  6e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.099304  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18400  non-ribosomal peptide synthase/amino acid adenylation enzyme  31.05 
 
 
5750 aa  169  7e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4754  amino acid adenylation domain-containing protein  30.68 
 
 
3331 aa  169  8e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3742  amino acid adenylation domain protein  29.38 
 
 
1358 aa  169  8e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.798811  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3419  amino acid adenylation domain protein  31.01 
 
 
3453 aa  169  8e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4588  amino acid adenylation domain protein  31.03 
 
 
1925 aa  169  9e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1434  amino acid adenylation domain protein  28.94 
 
 
877 aa  169  9e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5753  amino acid adenylation domain protein  28.02 
 
 
1525 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4786  non-ribosomal peptide synthase  30.22 
 
 
3219 aa  169  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303001  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>