221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1975 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1975  hypothetical protein  100 
 
 
394 aa  790    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000141125  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0626  hypothetical protein  51.46 
 
 
356 aa  252  9.000000000000001e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2818  hypothetical protein  52.45 
 
 
350 aa  249  4e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2342  protein of unknown function DUF81  48.04 
 
 
350 aa  238  2e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1641  protein of unknown function DUF81  50.36 
 
 
354 aa  237  2e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.407514  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1316  hypothetical protein  45.12 
 
 
339 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.919916  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0638  hypothetical protein  43.77 
 
 
355 aa  194  3e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.328833  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0264  protein of unknown function DUF81  37.37 
 
 
345 aa  162  1e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4296  protein of unknown function DUF81  36.9 
 
 
346 aa  160  4e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0285  protein of unknown function DUF81  34.81 
 
 
350 aa  158  2e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0253252 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1905  protein of unknown function DUF81  32.63 
 
 
305 aa  145  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2258  hypothetical protein  33.33 
 
 
296 aa  139  6e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1353  hypothetical protein  32.86 
 
 
427 aa  139  7.999999999999999e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000251364  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1425  hypothetical protein  32.97 
 
 
426 aa  139  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0163769  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1011  protein of unknown function DUF81  32.78 
 
 
362 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0652909 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0315  protein of unknown function DUF81  35.38 
 
 
415 aa  137  5e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.24542  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2847  hypothetical protein  32.64 
 
 
306 aa  133  5e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.258589  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1427  hypothetical protein  34.18 
 
 
428 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000425148  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0843  hypothetical protein  32.75 
 
 
307 aa  130  3e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.226682 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3721  protein of unknown function DUF81  32.87 
 
 
346 aa  130  4.0000000000000003e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.766072  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1799  protein of unknown function DUF81  31.32 
 
 
356 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1032  protein of unknown function DUF81  34.69 
 
 
329 aa  129  9.000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1984  protein of unknown function DUF81  33.21 
 
 
415 aa  127  3e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0026  hypothetical protein  29.5 
 
 
305 aa  126  6e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25228  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1512  hypothetical protein  32.87 
 
 
360 aa  125  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.864681  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1044  protein of unknown function DUF81  32.3 
 
 
349 aa  124  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.161703  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0357  protein of unknown function DUF81  32.98 
 
 
420 aa  123  6e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.968564  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3160  protein of unknown function DUF81  33.45 
 
 
443 aa  122  8e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0095  hypothetical protein  29.47 
 
 
356 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.571557  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0703  protein of unknown function DUF81  31.36 
 
 
312 aa  120  3e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.619223 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3098  hypothetical protein  31.82 
 
 
330 aa  119  7e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.075635  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2833  hypothetical protein  33.58 
 
 
415 aa  119  9e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.260143  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0534  hypothetical protein  30.31 
 
 
310 aa  117  3.9999999999999997e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.736309  normal  0.683051 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0881  hypothetical protein  29.81 
 
 
306 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0644  hypothetical protein  32.97 
 
 
417 aa  116  6.9999999999999995e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2206  hypothetical protein  29.43 
 
 
306 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.767696  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4256  protein of unknown function DUF81  31.94 
 
 
330 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2613  hypothetical protein  31.8 
 
 
361 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.303309 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1793  protein of unknown function DUF81  31.77 
 
 
348 aa  113  5e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2103  protein of unknown function DUF81  28.47 
 
 
352 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2732  hypothetical protein  31.58 
 
 
307 aa  112  8.000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.990455  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0603  hypothetical protein  28.23 
 
 
315 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117453  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2287  hypothetical protein  30.19 
 
 
306 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.733159  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0237  protein of unknown function DUF81  27.44 
 
 
307 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.455283  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0457  hypothetical protein  27.14 
 
 
307 aa  110  6e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0807  putative permease  32 
 
 
308 aa  110  6e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0899504 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0967  protein of unknown function DUF81  29.88 
 
 
303 aa  109  7.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000092207  normal  0.442745 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0208  protein of unknown function DUF81  27.44 
 
 
307 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.61262  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2673  protein of unknown function DUF81  27.96 
 
 
349 aa  108  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.970315  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0148  hypothetical protein  27.6 
 
 
308 aa  107  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.171694 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0184  hypothetical protein  29.2 
 
 
343 aa  106  8e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.249656  normal  0.93927 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0741  hypothetical protein  29.09 
 
 
308 aa  104  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.610206  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2642  hypothetical protein  27.65 
 
 
304 aa  103  4e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0881  protein of unknown function DUF81  28.36 
 
 
320 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2487  hypothetical protein  32.21 
 
 
307 aa  103  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.741718 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0800  hypothetical protein  28.31 
 
 
307 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.979856  normal  0.617739 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4610  hypothetical protein  27.76 
 
 
307 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.427893  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0823  hypothetical protein  28.83 
 
 
316 aa  95.9  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.580669  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4039  hypothetical protein  28.3 
 
 
306 aa  94.4  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.995552  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0772  hypothetical protein  28.47 
 
 
316 aa  94  4e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000254854  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2100  hypothetical protein  31.38 
 
 
307 aa  94  5e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3097  hypothetical protein  30.08 
 
 
307 aa  93.6  6e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0521383  normal  0.0206179 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0602  hypothetical protein  26.22 
 
 
307 aa  92.4  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.116643  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5288  protein of unknown function DUF81  31.2 
 
 
307 aa  92  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000586578  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3547  hypothetical protein  29.92 
 
 
304 aa  90.9  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0529  protein of unknown function DUF81  31.54 
 
 
301 aa  85.1  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.639681  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0758  protein of unknown function DUF81  28.97 
 
 
342 aa  82.8  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.154844  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0245  hypothetical protein  29.56 
 
 
308 aa  80.5  0.00000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.176673  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1150  hypothetical protein  27.31 
 
 
275 aa  80.1  0.00000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0240  hypothetical protein  25 
 
 
313 aa  78.2  0.0000000000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0364801  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0075  protein of unknown function DUF81  29.93 
 
 
276 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.393989  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1649  protein of unknown function DUF81  26.8 
 
 
277 aa  66.6  0.0000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.641158  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1197  hypothetical protein  29.15 
 
 
277 aa  64.7  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5534  protein of unknown function DUF81  40.43 
 
 
309 aa  61.6  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.511417 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3708  hypothetical protein  23.23 
 
 
251 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18800  predicted permease  26.92 
 
 
323 aa  60.8  0.00000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1843  permease  24.22 
 
 
283 aa  60.8  0.00000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  24.8 
 
 
266 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0555  protein of unknown function DUF81  27.16 
 
 
408 aa  59.7  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.589078 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3139  protein of unknown function DUF81  23.27 
 
 
280 aa  58.9  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1910  hypothetical protein  24.91 
 
 
283 aa  58.9  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.199806  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3359  hypothetical protein  23.89 
 
 
251 aa  59.3  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.123305  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  23.79 
 
 
2798 aa  58.5  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1182  hypothetical protein  25.99 
 
 
283 aa  58.2  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.801171  normal  0.428536 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0040  protein of unknown function DUF81  23.42 
 
 
309 aa  58.2  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2118  protein of unknown function DUF81  27.11 
 
 
324 aa  57.8  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00152804  normal  0.375775 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3714  hypothetical protein  22.92 
 
 
251 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.313517  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3428  permease  23.81 
 
 
251 aa  57.4  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.392516  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1375  hypothetical protein  29.57 
 
 
266 aa  57  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1533  permease  23.26 
 
 
251 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0311144 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0600  protein of unknown function DUF81  25.93 
 
 
278 aa  56.6  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1575  hypothetical protein  30.36 
 
 
266 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.02028  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1334  hypothetical protein  30.36 
 
 
266 aa  55.1  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00153027  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1333  hypothetical protein  30.36 
 
 
262 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.105686  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1543  hypothetical protein  30.36 
 
 
139 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000133691 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1725  protein of unknown function DUF81  28.29 
 
 
242 aa  55.5  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3781  permease  22.87 
 
 
251 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1613  hypothetical protein  30.36 
 
 
266 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000897265  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3690  hypothetical protein  23.02 
 
 
267 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.113603 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0087  protein of unknown function DUF81  39.77 
 
 
293 aa  53.9  0.000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>