More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2451 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2451  ribosome-binding factor A  100 
 
 		 123 aa  249  8.000000000000001e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0315755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1693  ribosome-binding factor A  63.96 
 
 		 141 aa  147  5e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0101873  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1863  ribosome-binding factor A  56.2 
 
 		 126 aa  135  2e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1004  ribosome-binding factor A  56.64 
 
 		 129 aa  133  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.439697  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0726  ribosome-binding factor A  57.14 
 
 		 147 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.237747  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2749  ribosome-binding factor A  53.51 
 
 		 123 aa  126  9.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1633  ribosome-binding factor A  52.63 
 
 		 121 aa  126  9.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.100642  hitchhiker  0.000771704 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2991  ribosome-binding factor A  52.46 
 
 		 123 aa  125  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0708502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2135  ribosome-binding factor A  54.39 
 
 		 122 aa  124  3e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0168697  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2819  ribosome-binding factor A  51.75 
 
 		 121 aa  125  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00171915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2560  ribosome-binding factor A  54.39 
 
 		 125 aa  122  1e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00880777 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1920  ribosome-binding factor A  56.88 
 
 		 130 aa  122  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0348034  normal  0.0643403 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1728  ribosome-binding factor A  51.75 
 
 		 143 aa  122  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.403197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1754  ribosome-binding factor A  49.12 
 
 		 132 aa  122  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0297721 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1060  ribosome-binding factor A  49.12 
 
 		 122 aa  121  3e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00435559  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1916  ribosome-binding factor A  49.12 
 
 		 122 aa  121  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.24329  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2563  ribosome-binding factor A  49.12 
 
 		 122 aa  121  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.240841  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1248  ribosome-binding factor A  55.05 
 
 		 125 aa  121  4e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0261774  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3382  ribosome-binding factor A  54.13 
 
 		 125 aa  120  4e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0271741  normal  0.693723 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0992  ribosome-binding factor A  49.12 
 
 		 138 aa  120  6e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.197459  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0174  ribosome-binding factor A  49.12 
 
 		 138 aa  120  6e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0246509  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1506  ribosome-binding factor A  49.12 
 
 		 138 aa  120  6e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1741  ribosome-binding factor A  49.12 
 
 		 138 aa  120  6e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0087071  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1763  ribosome-binding factor A  49.12 
 
 		 138 aa  120  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492617  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1702  ribosome-binding factor A  54.13 
 
 		 123 aa  120  8e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000429225 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1290  ribosome-binding factor A  52.78 
 
 		 123 aa  120  9e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0532539  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0068  ribosome-binding factor A  50.45 
 
 		 125 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00108757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2427  ribosome-binding factor A  53.04 
 
 		 122 aa  118  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.224227  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1021  ribosome-binding factor A  47.37 
 
 		 132 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1477  ribosome-binding factor A  47.37 
 
 		 132 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1501  ribosome-binding factor A  47.37 
 
 		 132 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236636  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2010  ribosome-binding factor A  52.17 
 
 		 122 aa  117  4.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.142179  normal  0.57147 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1092  ribosome-binding factor A  51.64 
 
 		 122 aa  117  4.9999999999999996e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.378347  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1211  ribosome-binding factor A  52.29 
 
 		 123 aa  117  7e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0722597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1118  ribosome-binding factor A  52.29 
 
 		 123 aa  117  7e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.614248  normal  0.630529 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4642  ribosome-binding factor A  46.49 
 
 		 132 aa  115  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0378959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1423  ribosome-binding factor A  45.61 
 
 		 132 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.02264 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1226  ribosome-binding factor A  50.82 
 
 		 122 aa  116  9.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.333897  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1383  ribosome-binding factor A  45.61 
 
 		 132 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2748  ribosome-binding factor A  49.59 
 
 		 120 aa  114  3e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.131099  normal  0.170197 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2030  ribosome-binding factor A  47.86 
 
 		 123 aa  114  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0111953  normal  0.0437908 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2027  ribosome-binding factor A  48.31 
 
 		 122 aa  114  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.373244  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0780  ribosome-binding factor A  43.7 
 
 		 133 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000489115  normal  0.0558247 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42810  ribosome-binding factor A  47.41 
 
 		 129 aa  111  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4179  ribosome-binding factor A  43.44 
 
 		 138 aa  110  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.308306  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4489  ribosome-binding factor A  42.62 
 
 		 138 aa  110  6e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0856583  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0696  ribosome-binding factor A  46.72 
 
 		 124 aa  110  7.000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.146266  normal  0.222032 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5461  ribosome-binding factor A  46.09 
 
 		 128 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.74875  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4711  ribosome-binding factor A  44.35 
 
 		 132 aa  106  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165962  hitchhiker  0.00698134 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0722  ribosome-binding factor A  44.35 
 
 		 132 aa  106  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.041956 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4576  ribosome-binding factor A  44.35 
 
 		 132 aa  106  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.63413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4711  ribosome-binding factor A  44.35 
 
 		 132 aa  106  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.31631 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0990  ribosome-binding factor A  43.75 
 
 		 123 aa  105  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.645083  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3607  ribosome-binding factor A  44.83 
 
 		 129 aa  105  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.858095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1947  ribosome-binding factor A  47.79 
 
 		 130 aa  104  4e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0382472 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62740  ribosome-binding factor A  44.35 
 
 		 129 aa  104  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.232446  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2688  ribosome-binding factor A  45.13 
 
 		 123 aa  102  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1466  ribosome-binding factor A  43.93 
 
 		 139 aa  102  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2819  ribosome-binding factor A  45.54 
 
 		 123 aa  102  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1230  ribosome-binding factor A  45.45 
 
 		 117 aa  101  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.644207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1599  ribosome-binding factor A  43.93 
 
 		 119 aa  99.4  1e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00660683  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0564  ribosome-binding factor A  43.93 
 
 		 119 aa  99.4  1e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3675  ribosome-binding factor A  45.19 
 
 		 125 aa  99.8  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0818  ribosome-binding factor A  40.18 
 
 		 133 aa  97.8  4e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0100863 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1330  ribosome-binding factor A  43.27 
 
 		 130 aa  97.8  5e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.285304  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1356  ribosome-binding factor A  43.27 
 
 		 116 aa  97.4  6e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.348543  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2204  ribosome-binding factor A  40.71 
 
 		 142 aa  96.3  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3464  ribosome-binding factor A  42.73 
 
 		 133 aa  96.3  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0837  ribosome-binding factor A  39.62 
 
 		 116 aa  95.5  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1445  ribosome-binding factor A  38.46 
 
 		 131 aa  95.5  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000145103  normal  0.2265 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3073  ribosome-binding factor A  41.59 
 
 		 131 aa  95.1  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.729556  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1956  ribosome-binding factor A  38.18 
 
 		 120 aa  94.7  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0809  ribosome-binding factor A  40 
 
 		 132 aa  94.4  5e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3345  ribosome-binding factor A  40.74 
 
 		 132 aa  94  6e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.970615  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2119  ribosome-binding factor A  44.95 
 
 		 127 aa  92.8  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.328304  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2707  ribosome-binding factor A  38.84 
 
 		 128 aa  92.4  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.150572 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0822  ribosome-binding factor A  37.96 
 
 		 126 aa  92  2e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.329178  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1157  ribosome-binding factor A  40.37 
 
 		 126 aa  92.4  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000826248  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1052  ribosome-binding factor A  38.94 
 
 		 132 aa  91.7  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164371  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0586  ribosome-binding factor A  40 
 
 		 132 aa  91.7  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.309895  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1939  ribosome-binding factor A  40.74 
 
 		 116 aa  91.7  3e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1657  ribosome-binding factor A  40.74 
 
 		 116 aa  91.7  3e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2773  ribosome-binding factor A  41.6 
 
 		 136 aa  90.9  5e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07850  ribosome-binding factor A  38.53 
 
 		 122 aa  90.9  6e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1589  ribosome-binding factor A  40.74 
 
 		 118 aa  90.1  9e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00426148  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1335  ribosome-binding factor A  37.96 
 
 		 118 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0231832  hitchhiker  0.00144693 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3909  ribosome-binding factor A  37.96 
 
 		 118 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.391027  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3187  ribosome-binding factor A  40.38 
 
 		 119 aa  89.7  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.11601  normal  0.332882 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3552  ribosome-binding factor A  38.89 
 
 		 118 aa  89.7  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3570  ribosome-binding factor A  38.89 
 
 		 118 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3633  ribosome-binding factor A  37.96 
 
 		 118 aa  89.7  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0539851  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1748  ribosome-binding factor A  40.65 
 
 		 126 aa  89.4  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0187668  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0927  ribosome-binding factor A  42.31 
 
 		 119 aa  88.6  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.100451  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2049  ribosome-binding factor A  39.13 
 
 		 127 aa  89  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3822  ribosome-binding factor A  37.96 
 
 		 118 aa  88.2  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.3299500000000005e-63 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0458  ribosome-binding factor A  39.05 
 
 		 117 aa  88.6  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3604  ribosome-binding factor A  40.54 
 
 		 133 aa  88.2  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0265365 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3474  ribosome-binding factor A  40.54 
 
 		 133 aa  88.2  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1644  ribosome-binding factor A  40.37 
 
 		 119 aa  88.6  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2463  ribosome-binding factor A  37.96 
 
 		 118 aa  87.8  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0350107  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>