More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1401 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1401  2-nitropropane dioxygenase NPD  100 
 
 		 324 aa  658    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3013  2-nitropropane dioxygenase NPD  91.67 
 
 		 324 aa  614  1e-175  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.95223  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3732  2-nitropropane dioxygenase, NPD  91.36 
 
 		 324 aa  612  9.999999999999999e-175  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1554  2-nitropropane dioxygenase, NPD  79.88 
 
 		 324 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.510846  normal  0.493902 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5355  2-nitropropane dioxygenase NPD  79.5 
 
 		 328 aa  536  1e-151  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.660089  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6053  2-nitropropane dioxygenase, NPD  76.09 
 
 		 335 aa  517  1.0000000000000001e-145  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.483236  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0363  2-nitropropane dioxygenase NPD  75.78 
 
 		 325 aa  513  1e-144  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1075  2-nitropropane dioxygenase, NPD  74.84 
 
 		 328 aa  507  1e-143  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.192705  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3001  2-nitropropane dioxygenase, NPD  74.53 
 
 		 328 aa  504  9.999999999999999e-143  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.152083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5146  putative 2-nitropropane dioxygenase  75.16 
 
 		 334 aa  488  1e-137  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.199752  normal  0.0588296 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6828  2-nitropropane dioxygenase NPD  62.04 
 
 		 325 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.670939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4367  2-nitropropane dioxygenase NPD  62.54 
 
 		 325 aa  394  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2151  2-nitropropane dioxygenase NPD  59.13 
 
 		 332 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.64006  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28800  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  59.19 
 
 		 324 aa  387  1e-106  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.135482 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4142  2-nitropropane dioxygenase, NPD  57.23 
 
 		 332 aa  387  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.480237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3433  2-nitropropane dioxygenase, NPD  59.69 
 
 		 331 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.995497  normal  0.0477625 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2021  2-nitropropane dioxygenase, NPD  57.59 
 
 		 331 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.01256  normal  0.586253 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4296  2-nitropropane dioxygenase, NPD  57.23 
 
 		 332 aa  387  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.458916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4067  2-nitropropane dioxygenase, NPD  57.23 
 
 		 332 aa  387  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0738  2-nitropropane dioxygenase NPD  60 
 
 		 325 aa  387  1e-106  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.11052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3609  2-nitropropane dioxygenase, NPD  60.46 
 
 		 323 aa  379  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0826  2-nitropropane dioxygenase NPD  58.02 
 
 		 332 aa  381  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.289165  normal  0.500407 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2031  2-nitropropane dioxygenase, NPD  60.37 
 
 		 342 aa  380  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4186  2-nitropropane dioxygenase NPD  56.35 
 
 		 329 aa  377  1e-103  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.330981  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1638  2-nitropropane dioxygenase, NPD  58.1 
 
 		 326 aa  377  1e-103  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.397206  normal  0.560122 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4576  2-nitropropane dioxygenase, NPD  56.88 
 
 		 330 aa  374  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.403113  normal  0.255193 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1248  2-nitropropane dioxygenase, NPD  57.85 
 
 		 326 aa  372  1e-102  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.955135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4359  2-nitropropane dioxygenase, NPD  59.13 
 
 		 328 aa  366  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.255712  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5534  2-nitropropane dioxygenase NPD  61.31 
 
 		 323 aa  364  1e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3073  2-nitropropane dioxygenase, NPD  56.92 
 
 		 327 aa  362  6e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.479839  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1008  2-nitropropane dioxygenase, NPD  57.83 
 
 		 323 aa  361  1e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51080  putative dioxygenase  58.51 
 
 		 328 aa  361  1e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000609604 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5434  2-nitropropane dioxygenase NPD  57.91 
 
 		 323 aa  360  2e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.295794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3599  2-nitropropane dioxygenase, NPD  58.82 
 
 		 334 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.465464 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0800  2-nitropropane dioxygenase NPD  55.76 
 
 		 325 aa  357  1.9999999999999998e-97  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2128  2-nitropropane dioxygenase, NPD  56.97 
 
 		 330 aa  356  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.259631  normal  0.254711 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3833  2-nitropropane dioxygenase, NPD  60.13 
 
 		 324 aa  355  5e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4180  2-nitropropane dioxygenase, NPD  56.04 
 
 		 339 aa  340  2e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.25904 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1855  2-nitropropane dioxygenase, NPD  53.58 
 
 		 327 aa  329  5.0000000000000004e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.798128  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6901  2-nitropropane dioxygenase NPD  52.52 
 
 		 328 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4138  2-nitropropane dioxygenase, NPD  56.19 
 
 		 324 aa  323  2e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29975  predicted protein  50 
 
 		 346 aa  281  1e-74  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.448266  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08801  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G09600)  55.08 
 
 		 269 aa  264  1e-69  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.196554  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03300  2-nitropropane dioxygenase, putative  46.43 
 
 		 340 aa  250  2e-65  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0964  2-nitropropane dioxygenase NPD  43.49 
 
 		 319 aa  245  6e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0729206  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1182  2-nitropropane dioxygenase NPD  42.22 
 
 		 322 aa  241  9e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1839  2-nitropropane dioxygenase NPD  44.44 
 
 		 319 aa  235  7e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0098  2-nitropropane dioxygenase NPD  42.3 
 
 		 313 aa  210  3e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.718222  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7295  2-nitropropane dioxygenase NPD  41.54 
 
 		 311 aa  209  5e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00985  putative dioxygenase  39.23 
 
 		 314 aa  206  6e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0922  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.84 
 
 		 319 aa  203  3e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0612  2-nitropropane dioxygenase NPD  40.65 
 
 		 323 aa  201  9.999999999999999e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000694328  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2074  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.56 
 
 		 315 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000655776  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1358  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  37.7 
 
 		 316 aa  200  3e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000252963  normal  0.0405419 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1725  2-nitropropane dioxygenase, NPD  40.38 
 
 		 313 aa  196  3e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000021316  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1099  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  39.08 
 
 		 326 aa  196  6e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000664093  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04811  conserved hypothetical protein  38.78 
 
 		 278 aa  195  9e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.336266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1587  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.12 
 
 		 309 aa  194  2e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000431839  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1035  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.99 
 
 		 317 aa  193  4e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0997484  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1852  2-nitropropane dioxygenase-like protein  37.66 
 
 		 317 aa  189  5.999999999999999e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00272263  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1178  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  36.34 
 
 		 316 aa  187  3e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000736816  hitchhiker  0.00901561 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2356  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.96 
 
 		 386 aa  186  4e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0726815 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3672  2-nitropropane dioxygenase  37.1 
 
 		 311 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0126  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  39.25 
 
 		 314 aa  183  3e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0317277  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0128  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.25 
 
 		 314 aa  183  3e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0565011  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2390  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.81 
 
 		 314 aa  183  3e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0521943  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0431  trans-2-enoyl-ACP reductase II  38.01 
 
 		 321 aa  183  3e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0346  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  38.61 
 
 		 319 aa  183  4.0000000000000006e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.182837  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3819  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  38.17 
 
 		 315 aa  179  7e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000661973  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0311  dioxygenase  37.42 
 
 		 321 aa  179  8e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11150  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  36.73 
 
 		 323 aa  175  9.999999999999999e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2858  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.44 
 
 		 316 aa  170  3e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0580  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.02 
 
 		 312 aa  170  3e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1416  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  37.46 
 
 		 313 aa  169  4e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.578712 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1989  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.25 
 
 		 325 aa  169  4e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6837  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.76 
 
 		 330 aa  169  6e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.670939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1222  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.2 
 
 		 305 aa  169  8e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.925622 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5586  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.2 
 
 		 305 aa  168  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.658342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10270  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  37.5 
 
 		 320 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0212117  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2062  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.6 
 
 		 369 aa  166  5e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0640  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.14 
 
 		 316 aa  166  5e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000697959  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2734  putative 2-nitropropane dioxygenase  35.93 
 
 		 319 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1526  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.73 
 
 		 355 aa  162  8.000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.172251  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2605  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.44 
 
 		 342 aa  162  8.000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.152274  normal  0.24366 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0946  2-nitropropane dioxygenase, NPD  41.95 
 
 		 313 aa  161  1e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00349563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3064  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.85 
 
 		 311 aa  161  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2806  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.36 
 
 		 353 aa  160  4e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.180087  decreased coverage  0.0002175 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2965  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.3 
 
 		 338 aa  153  4e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.752049  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2607  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.55 
 
 		 353 aa  151  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3844  2-nitropropane dioxygenase NPD  40.52 
 
 		 315 aa  150  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1591  dioxygenase  32.15 
 
 		 318 aa  150  3e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.600793  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5071  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.2 
 
 		 356 aa  149  5e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.615847  normal  0.587247 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4686  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.2 
 
 		 356 aa  149  5e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.989955  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4772  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.2 
 
 		 356 aa  149  5e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.829067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01050  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  33.54 
 
 		 314 aa  149  9e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.250641 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13586  oxidoreductase  33.43 
 
 		 355 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00804869  normal  0.19405 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1487  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.67 
 
 		 356 aa  147  3e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5269  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.38 
 
 		 356 aa  146  5e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.353912 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3754  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.71 
 
 		 354 aa  146  5e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3984  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.55 
 
 		 361 aa  145  9e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>