More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0205 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0205  D-glycero-D-manno-heptose 1-phosphate guanosyltransferase  100 
 
 
236 aa  493  1e-138  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0148  nucleotidyl transferase  89.32 
 
 
236 aa  437  1e-122  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3978  nucleotidyl transferase  37.05 
 
 
245 aa  160  2e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5466  Nucleotidyl transferase  40.95 
 
 
241 aa  151  8e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3282  nucleotidyl transferase  35.4 
 
 
370 aa  134  8e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.404178 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1064  Nucleotidyl transferase  35.68 
 
 
363 aa  130  1e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.292184  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1852  nucleotidyl transferase  34.07 
 
 
370 aa  129  4e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5002  nucleotidyl transferase  53.51 
 
 
843 aa  127  1e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0737  nucleotidyl transferase  32.44 
 
 
357 aa  126  3e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.879816 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5876  nucleotidyl transferase  33.78 
 
 
357 aa  125  5e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.624445  normal  0.732322 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1018  nucleotidyl transferase  34.21 
 
 
361 aa  125  5e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000995532  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1755  D-glycero-D-manno-heptose 1-phosphate guanosyltransferase  34.87 
 
 
223 aa  125  5e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.385636  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3113  nucleotidyl transferase  34.96 
 
 
349 aa  124  9e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.409116  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1079  nucleotidyl transferase  31.88 
 
 
820 aa  124  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1208  nucleotidyltransferase family protein  34.21 
 
 
361 aa  123  2e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00478172  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4613  Nucleotidyl transferase  33.04 
 
 
366 aa  123  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0238  D,D-heptose 1,7-bisphosphate phosphatase  36.21 
 
 
408 aa  122  4e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.546722 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_991  nucleotidyltransferase  34.21 
 
 
361 aa  122  6e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00100816  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0541  nucleotidyl transferase  29.52 
 
 
238 aa  122  7e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1624  nucleotidyl transferase  33.48 
 
 
367 aa  121  1e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.344481  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1489  nucleotidyl transferase  36.07 
 
 
230 aa  120  2e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.523541  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0370  nucleotidyl transferase  32.2 
 
 
227 aa  120  2e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.357076 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2294  D-glycero-D-manno-heptose 1-phosphate guanosyltransferase  34.93 
 
 
230 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3774  Nucleotidyl transferase  30.25 
 
 
830 aa  119  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3290  WcbM  34.93 
 
 
230 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2172  D-glycero-D-manno-heptose 1-phosphate guanosyltransferase  34.93 
 
 
230 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3276  D-glycero-D-manno-heptose 1-phosphate guanosyltransferase  34.93 
 
 
230 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0534  D-glycero-D-manno-heptose 1-phosphate guanosyltransferase  34.93 
 
 
230 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.140164  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1787  nucleotidyl transferase  28.44 
 
 
348 aa  119  3e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1066  D-glycero-D-manno-heptose 1-phosphate guanosyltransferase  34.93 
 
 
230 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1937  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  31.28 
 
 
392 aa  119  5e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.235204  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1961  nucleotidyl transferase  30.47 
 
 
816 aa  119  5e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1463  nucleotidyl transferase  52.29 
 
 
828 aa  119  6e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0300765  normal  0.0105434 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1422  capsular biosynthesis nucleotidyltransferase, putative  34.33 
 
 
224 aa  118  7e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1757  nucleotidyl transferase  32.26 
 
 
228 aa  117  1e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3241  D-glycero-D-manno-heptose 1-phosphate guanosyltransferase  34.5 
 
 
230 aa  117  1e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.563103  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06180  Nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase family protein  33.04 
 
 
359 aa  117  2e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0622435  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0492  nucleotidyl transferase  33.49 
 
 
230 aa  117  2e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  1.62703e-05 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0598  nucleotidyl transferase  29.33 
 
 
348 aa  116  2e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.534705  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4397  nucleotidyl transferase  32.02 
 
 
832 aa  116  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4822  nucleotidyl transferase  34.78 
 
 
326 aa  116  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1337  nucleotidyl transferase  32.72 
 
 
228 aa  115  5e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0683407  normal  0.343314 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1855  Nucleotidyl transferase  31.72 
 
 
370 aa  115  5e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2250  nucleotidyl transferase  30.4 
 
 
399 aa  115  8e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0300  nucleotidyl transferase  26.72 
 
 
397 aa  115  8e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1940  Nucleotidyl transferase  30.21 
 
 
818 aa  114  1e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0999  nucleotidyl transferase  31.65 
 
 
237 aa  114  1e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.335464  normal  0.356487 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0740  nucleotidyl transferase  31.58 
 
 
832 aa  114  1e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.2195  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1138  nucleotidyl transferase  32.26 
 
 
227 aa  114  1e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.44426 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2995  nucleotidyl transferase  29.02 
 
 
785 aa  114  1e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1394  mannose-1-phosphate guanylyltransferase / phosphomannomutase  44.36 
 
 
832 aa  114  2e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0028  nucleotidyl transferase  28 
 
 
835 aa  113  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2301  nucleotidyl transferase  27.88 
 
 
348 aa  113  3e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1123  nucleotidyl transferase  32.17 
 
 
854 aa  112  3e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1469  Nucleotidyl transferase  47.37 
 
 
833 aa  112  4e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1584  nucleotidyl transferase  33.93 
 
 
238 aa  112  5e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0853  nucleotidyl transferase family protein  28.83 
 
 
784 aa  112  5e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4381  nucleotidyl transferase family protein  28.38 
 
 
784 aa  112  5e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1321  nucleotidyl transferase  31.25 
 
 
359 aa  112  5e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.254091  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0529  Nucleotidyl transferase  34.53 
 
 
352 aa  112  5e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0885  Nucleotidyl transferase  28.38 
 
 
229 aa  112  5e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4007  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  28.12 
 
 
784 aa  112  5e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4080  Nucleotidyl transferase  32.5 
 
 
351 aa  112  5e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1357  nucleotidyl transferase  31.25 
 
 
359 aa  112  5e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00960312  normal  0.366439 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1338  nucleotidyl transferase  31.25 
 
 
359 aa  112  5e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4347  nucleotidyl transferase family protein  28.12 
 
 
784 aa  112  5e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.114462  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4169  nucleotidyl transferase family protein  28.12 
 
 
784 aa  112  6e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1729  nucleotidyl transferase  31.7 
 
 
359 aa  112  6e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.442987  normal  0.868818 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4017  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  28.12 
 
 
784 aa  112  6e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.688327  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4400  nucleotidyl transferase family protein  28.12 
 
 
784 aa  112  6e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4287  nucleotidyl transferase family protein  28.12 
 
 
784 aa  112  6e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.268164 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4491  nucleotidyl transferase family protein  28.12 
 
 
784 aa  112  6e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1692  nucleotidyl transferase  31.86 
 
 
834 aa  111  8e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.230386  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0359  Nucleotidyl transferase  30.93 
 
 
347 aa  111  1e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4734  nucleotidyl transferase  29.91 
 
 
359 aa  111  1e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.261092  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14051  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  31.39 
 
 
356 aa  110  2e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.810427  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0348  Nucleotidyl transferase  30.13 
 
 
810 aa  110  2e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0407  Nucleotidyl transferase  27.56 
 
 
835 aa  110  2e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01681  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  28.09 
 
 
392 aa  109  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4120  nucleotidyl transferase  29.15 
 
 
784 aa  109  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4179  Nucleotidyl transferase  32.03 
 
 
365 aa  109  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.219549  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2912  Nucleotidyl transferase  29.65 
 
 
841 aa  109  4e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1239  Nucleotidyl transferase  32.09 
 
 
347 aa  108  6e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1231  nucleotidyl transferase  45.61 
 
 
841 aa  108  7e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.946144 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0744  nucleotidyl transferase  31.86 
 
 
364 aa  108  7e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.196844 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3178  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  27.56 
 
 
836 aa  107  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.335265 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1608  capsular biosynthesis nucleotidyltransferase, putative  33.33 
 
 
226 aa  107  2e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1374  mannose-1-phosphate guanyltransferase  32 
 
 
364 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2334  nucleotidyl transferase  27.35 
 
 
828 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3254  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  28 
 
 
836 aa  106  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.450864  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1925  nucleotidyl transferase  32.55 
 
 
821 aa  106  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.175667 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26731  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  27.85 
 
 
392 aa  106  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0365  Nucleotidyl transferase  28.69 
 
 
355 aa  106  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2028  nucleotidyl transferase  28.83 
 
 
842 aa  106  3e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0525  Nucleotidyl transferase  29.28 
 
 
840 aa  106  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3402  Nucleotidyl transferase  27.56 
 
 
836 aa  106  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0788  Nucleotidyl transferase  29.46 
 
 
830 aa  106  4e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.233183  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2437  Nucleotidyl transferase  31.98 
 
 
827 aa  106  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00386454  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0182  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  29.73 
 
 
842 aa  105  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150703  normal  0.0187588 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3188  nucleotidyl transferase  28.44 
 
 
843 aa  105  5e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00738142 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>