More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0201 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_0201  glutamine synthetase catalytic region  100 
 
 		 448 aa  931    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0281454  normal  0.125698 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4681  L-glutamine synthetase  63.57 
 
 		 451 aa  590  1e-167  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.455375  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3286  hypothetical protein  55.66 
 
 		 441 aa  471  1.0000000000000001e-131  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0169038 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2916  glutamate-ammonia ligase  40.71 
 
 		 469 aa  326  4.0000000000000003e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.20359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21290  glutamine synthetase, type I  31.25 
 
 		 441 aa  244  3e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0204015  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2047  glutamine synthetase, type I  32.59 
 
 		 445 aa  233  5e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.945821  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2374  glutamine synthetase, type I  32.04 
 
 		 456 aa  228  2e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.943832  normal  0.417951 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1487  glutamine synthetase, type I  33.26 
 
 		 444 aa  228  2e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1007  glutamate--ammonia ligase  30.4 
 
 		 442 aa  227  4e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000328264  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1297  L-glutamine synthetase  31.19 
 
 		 443 aa  225  1e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000250879  normal  0.0655165 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15270  L-glutamine synthetase  31.99 
 
 		 444 aa  225  1e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16570  L-glutamine synthetase  31.95 
 
 		 445 aa  225  1e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.45489  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1112  glutamine synthetase, type I  32.79 
 
 		 445 aa  224  2e-57  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.729434 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6502  glutamine synthetase catalytic region  35.07 
 
 		 496 aa  224  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.415769  normal  0.198271 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2046  L-glutamine synthetase  33.19 
 
 		 455 aa  224  3e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.480104  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1849  glutamine synthetase, type I  31.77 
 
 		 445 aa  223  4e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0159  glutamine synthetase  33.02 
 
 		 445 aa  221  9.999999999999999e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.463093  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1379  glutamine synthetase  31.72 
 
 		 448 aa  222  9.999999999999999e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000272727  hitchhiker  0.00000000000339738 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2117  glutamine synthetase, type I  31.54 
 
 		 444 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1235  glutamine synthetase, type I  31.1 
 
 		 444 aa  220  3.9999999999999997e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000016519  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0962  L-glutamine synthetase  30.39 
 
 		 445 aa  218  1e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0105368  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0643  glutamine synthetase, type I  30.28 
 
 		 445 aa  218  1e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.61132  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0249  glutamine synthetase, type I  30.91 
 
 		 433 aa  219  1e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.449889  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2119  glutamine synthetase, type I  31.32 
 
 		 445 aa  218  2e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0386  glutamine synthetase, type I  30.02 
 
 		 444 aa  217  4e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6309  putative glutamine synthetase  33.8 
 
 		 443 aa  217  4e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.542991  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0166  glutamine synthetase, type III  31.18 
 
 		 464 aa  216  9e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3479  glutamine synthetase, type I  32.04 
 
 		 444 aa  215  9.999999999999999e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0194091  hitchhiker  0.0056563 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1389  glutamine synthetase, type I  31.26 
 
 		 450 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0924  glutamine synthetase, type I  32.75 
 
 		 453 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.238729  normal  0.0517431 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3106  glutamine synthetase, type I  32.28 
 
 		 453 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000021484  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0666  L-glutamine synthetase  28.41 
 
 		 447 aa  213  5.999999999999999e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.57633 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3034  glutamate--ammonia ligase  32.1 
 
 		 463 aa  213  7e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2270  L-glutamine synthetase  29.82 
 
 		 440 aa  212  1e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.327087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1766  glutamine synthetase catalytic region  32.19 
 
 		 452 aa  211  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.725397  decreased coverage  0.000162709 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1466  glutamine synthetase, type I  32.23 
 
 		 446 aa  211  2e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1573  glutamine synthetase, type I  31.84 
 
 		 445 aa  211  2e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1047  glutamine synthetase, type I  32.04 
 
 		 444 aa  211  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0994  glutamine synthetase, type I  30.04 
 
 		 442 aa  211  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0909  glutamine synthetase catalytic region  31.85 
 
 		 447 aa  210  3e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0384  L-glutamine synthetase  30.34 
 
 		 446 aa  210  4e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.882152  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72690  putative glutamine synthetase  34.03 
 
 		 443 aa  210  5e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0153069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0453  glutamine synthetase, type I  32.23 
 
 		 446 aa  210  5e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07430  L-glutamine synthetase  31.56 
 
 		 447 aa  209  9e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1294  L-glutamine synthetase  31.14 
 
 		 444 aa  209  1e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0180309 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3296  glutamine synthetase, type I  32.04 
 
 		 447 aa  208  2e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.405518  normal  0.0478634 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0628  glutamine synthetase, type I  29.25 
 
 		 443 aa  207  4e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0694416  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0180  glutamine synthetase, type I  29.2 
 
 		 446 aa  207  4e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2498  L-glutamine synthetase  34.65 
 
 		 446 aa  207  4e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0717822  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0919  L-glutamine synthetase  31.84 
 
 		 453 aa  206  5e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0521  glutamine synthetase, type I  29.79 
 
 		 446 aa  206  6e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3754  glutamine synthetase, type I  29.98 
 
 		 444 aa  206  6e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.149768  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3549  glutamine synthetase, type I  29.98 
 
 		 444 aa  206  8e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3449  glutamine synthetase, type I  29.98 
 
 		 444 aa  206  8e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3462  glutamate--ammonia ligase (glutamine synthetase, type I)  29.98 
 
 		 444 aa  206  8e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3833  glutamine synthetase, type I  29.98 
 
 		 444 aa  206  8e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3713  glutamine synthetase, type I  29.98 
 
 		 444 aa  206  8e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.53476e-18 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3731  glutamine synthetase, type I  29.98 
 
 		 444 aa  206  9e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_941  glutamine synthetase, type I  30.72 
 
 		 443 aa  205  1e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13430  L-glutamine synthetase  32.11 
 
 		 446 aa  205  1e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0720784  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2381  glutamine synthetase, type I  30.2 
 
 		 444 aa  206  1e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0709  glutamine synthetase, type I  31.15 
 
 		 449 aa  205  2e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.616816 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3469  glutamine synthetase, type I  29.98 
 
 		 444 aa  205  2e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00616587  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0952  L-glutamine synthetase  29.82 
 
 		 447 aa  204  2e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.434592  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12210  L-glutamine synthetase  30.96 
 
 		 446 aa  204  2e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000380356  normal  0.117276 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3759  glutamine synthetase, type I  29.35 
 
 		 444 aa  204  3e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000109487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1592  L-glutamine synthetase  31.42 
 
 		 446 aa  204  3e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0667119  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2806  glutamine synthetase, type I  29.35 
 
 		 449 aa  204  3e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1591  glutamine synthetase, type I  31.42 
 
 		 446 aa  204  3e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000014184 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2389  glutamine synthetase, type I  29.06 
 
 		 448 aa  204  4e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000201555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3015  glutamine synthetase, type I  31.14 
 
 		 450 aa  203  5e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3262  glutamine synthetase catalytic region  31.78 
 
 		 446 aa  203  6e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.216944  hitchhiker  0.00017757 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3803  glutamine synthetase, type I  29.75 
 
 		 444 aa  202  7e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1502  glutamine synthetase, type I  29.75 
 
 		 444 aa  202  7e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0398754 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2027  glutamine synthetase, type I  29.52 
 
 		 443 aa  202  7e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.123659  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0634  glutamine synthetase, type I  30.18 
 
 		 444 aa  202  8e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.144254  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4032  glutamine synthetase, type I  32.81 
 
 		 444 aa  202  8e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0782216  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0982  L-glutamine synthetase  31.88 
 
 		 453 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.624749  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1975  L-glutamine synthetase  27.89 
 
 		 442 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1537  glutamine synthetase, type I  29.98 
 
 		 456 aa  202  9.999999999999999e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0952  L-glutamine synthetase  27.88 
 
 		 445 aa  201  1.9999999999999998e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00098496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3145  L-glutamine synthetase  31.51 
 
 		 452 aa  201  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.799755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0717  L-glutamine synthetase  30.2 
 
 		 448 aa  201  1.9999999999999998e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.837857  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2178  glutamine synthetase, type I  32.21 
 
 		 444 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.588108  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4491  glutamine synthetase catalytic region  32.57 
 
 		 444 aa  201  3e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0411429  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1204  glutamine synthetase, type I  32.43 
 
 		 452 aa  200  3.9999999999999996e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00014918  normal  0.349834 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1837  glutamine synthetase, type I  30.09 
 
 		 439 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1258  glutamine synthetase, type I  30.47 
 
 		 453 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0380427 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2909  glutamine synthetase, type I  31.74 
 
 		 446 aa  200  5e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.113408  normal  0.593319 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1497  glutamine synthetase, type I  30.91 
 
 		 446 aa  200  5e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.293618  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2273  glutamine synthetase, type I  28.15 
 
 		 443 aa  200  5e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1764  L-glutamine synthetase  28.02 
 
 		 442 aa  199  7e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.705801  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2490  glutamine synthetase, type I  31.45 
 
 		 446 aa  199  7.999999999999999e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.137457 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0770  glutamine synthetase, type I  29.43 
 
 		 450 aa  199  9e-50  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127283 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0077  L-glutamine synthetase  33.42 
 
 		 453 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3398  glutamine synthetase catalytic region  31.88 
 
 		 449 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1700  glutamine synthetase, type I  29.93 
 
 		 445 aa  199  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0952  L-glutamine synthetase  30.02 
 
 		 443 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0202  L-glutamine synthetase  29.66 
 
 		 440 aa  198  2.0000000000000003e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1125  L-glutamine synthetase  29.02 
 
 		 443 aa  197  3e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0811977  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>