66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_0099 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_0099  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  100 
 
 		 552 aa  1080    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0417  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  37.08 
 
 		 905 aa  194  4e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.46141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3877  LGFP repeat protein  35.55 
 
 		 654 aa  171  2e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.200487  normal  0.0193324 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3174  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  36.07 
 
 		 694 aa  164  6e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.15405  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1023  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  35.02 
 
 		 636 aa  151  3e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0196  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  29.15 
 
 		 502 aa  148  3e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1405  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.02 
 
 		 959 aa  147  6e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2379  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  35.31 
 
 		 879 aa  147  7.0000000000000006e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0102944 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3789  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.01 
 
 		 591 aa  146  8.000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2561  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  33.03 
 
 		 784 aa  142  1.9999999999999998e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4329  LGFP repeat protein  31.4 
 
 		 928 aa  137  4e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34600  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.25 
 
 		 387 aa  137  7.000000000000001e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.123006  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2558  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  33.33 
 
 		 728 aa  135  9.999999999999999e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.39914  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5022  LGFP  32.6 
 
 		 537 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5110  LGFP repeat-containing protein  32.6 
 
 		 537 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.667896 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5403  LGFP repeat-containing protein  32.6 
 
 		 537 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.116536 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4477  LGFP repeat-containing protein  35.64 
 
 		 370 aa  131  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.601176 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1157  LGFP repeat-containing protein  30.65 
 
 		 541 aa  130  7.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0583206  normal  0.0991304 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5652  LGFP repeat-containing protein  31.69 
 
 		 539 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.786051  normal  0.800046 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13845  hypothetical protein  34.42 
 
 		 539 aa  126  1e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.280356 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1188  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  33.11 
 
 		 794 aa  126  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.469744  normal  0.0598623 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2624  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  32.16 
 
 		 950 aa  124  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.3089  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20080  LysM domain-containing protein  31.79 
 
 		 695 aa  120  7.999999999999999e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4245  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.51 
 
 		 1072 aa  110  9.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.370967  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1610  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.23 
 
 		 964 aa  103  9e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3432  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.09 
 
 		 964 aa  103  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0164906 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0455  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  33.64 
 
 		 357 aa  96.3  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0270  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  33.18 
 
 		 364 aa  96.7  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2816  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  29.39 
 
 		 542 aa  90.1  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3182  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  32.84 
 
 		 375 aa  87  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00209082 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2393  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  33.46 
 
 		 268 aa  85.9  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.594471  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2719  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  33.64 
 
 		 274 aa  83.6  0.000000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.670474 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5193  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.69 
 
 		 356 aa  83.6  0.000000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000362844  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1539  twin-arginine translocation pathway signal  32.37 
 
 		 486 aa  81.6  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.407284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5070  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  32.87 
 
 		 353 aa  81.6  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.212369  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3434  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  33.73 
 
 		 366 aa  81.3  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.0021339  normal  0.405491 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1928  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase negative regulator of AmpC, AmpD  30.73 
 
 		 391 aa  80.9  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4840  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  30.3 
 
 		 277 aa  80.1  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2152  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.61 
 
 		 356 aa  79.7  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000936807  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35340  negative regulator of beta-lactamase expression  29.36 
 
 		 311 aa  79.3  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1929  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase negative regulator of AmpC, AmpD  30.52 
 
 		 223 aa  79  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1925  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase  30.1 
 
 		 289 aa  75.5  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0536095  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0009  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  27.56 
 
 		 684 aa  74.7  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1930  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  28.5 
 
 		 223 aa  73.2  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4945  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  29 
 
 		 273 aa  71.2  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16840  hypothetical protein  29.85 
 
 		 266 aa  70.1  0.00000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.754207  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0529  N-acetylmuramoyl-l-alanine amidase, putative  29.27 
 
 		 222 aa  58.2  0.0000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.549299  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0545  putative N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.27 
 
 		 157 aa  54.7  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5274  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase negative regulator of AmpC, AmpD  27.49 
 
 		 224 aa  54.7  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3764  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  26.84 
 
 		 288 aa  52.4  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0204504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3186  hypothetical protein  31.77 
 
 		 256 aa  52.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1669  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  37.5 
 
 		 173 aa  51.6  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.761458  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2303  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  40.58 
 
 		 157 aa  51.2  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3666  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, putative  29.41 
 
 		 150 aa  50.4  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1572  putative N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  34.34 
 
 		 150 aa  50.4  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.577314  normal  0.236623 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3648  putative N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.79 
 
 		 150 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3670  putative N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  34.34 
 
 		 152 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0492519  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3323  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  34.34 
 
 		 150 aa  50.1  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0947828  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3389  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.79 
 
 		 152 aa  50.1  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0561834  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1595  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  26.99 
 
 		 799 aa  49.3  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00111453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3745  putative N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.57 
 
 		 150 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3698  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.68 
 
 		 150 aa  48.9  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.694196  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3428  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.68 
 
 		 150 aa  48.9  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3340  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  41.54 
 
 		 152 aa  48.1  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2671  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  27.23 
 
 		 792 aa  44.7  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.342561  normal  0.283165 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2269  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, putative  38.27 
 
 		 149 aa  43.9  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0638229  hitchhiker  0.00820304 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>