49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2298 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2298  CRISPR-associated Cas4 family protein  100 
 
 		 170 aa  345  1e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0540  CRISPR-associated Cas4 family protein  55.83 
 
 		 168 aa  199  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4287  CRISPR-associated protein Cas4  52.07 
 
 		 169 aa  188  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2517  hypothetical protein  51.19 
 
 		 168 aa  186  9e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0309  CRISPR-associated protein Cas4  52.17 
 
 		 165 aa  180  7e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3932  CRISPR-associated protein Cas4  49.7 
 
 		 169 aa  179  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0941  CRISPR-associated Cas4 family protein  50.93 
 
 		 163 aa  171  5e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2660  CRISPR-associated protein Cas4  47.56 
 
 		 185 aa  171  5.999999999999999e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1187  CRISPR-associated protein Cas4  49.4 
 
 		 169 aa  164  4e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2318  CRISPR-associated Cas4 family protein  50.31 
 
 		 165 aa  161  4.0000000000000004e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2429  CRISPR-associated protein Cas4  40.37 
 
 		 165 aa  157  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0976  CRISPR-associated protein Cas4  39.52 
 
 		 177 aa  152  2e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1812  CRISPR-associated Cas4 family protein  37.27 
 
 		 178 aa  145  2.0000000000000003e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.233304  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0620  CRISPR-associated protein Cas4  45.68 
 
 		 168 aa  145  3e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0266  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  36.02 
 
 		 162 aa  134  6.0000000000000005e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2004  CRISPR-associated protein Cas4  41.1 
 
 		 165 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2023  CRISPR-associated Cas4 family protein  41.36 
 
 		 165 aa  131  6e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.84369  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0302  hypothetical protein  38.32 
 
 		 199 aa  123  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00784243  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0126  CRISPR-associated protein Cas4  36.75 
 
 		 171 aa  122  3e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0672  CRISPR-associated protein Cas4  38.41 
 
 		 169 aa  121  4e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1126  CRISPR-associated Cas4 family protein  37.42 
 
 		 199 aa  120  7e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00956788  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3328  CRISPR-associated protein Cas4  37.72 
 
 		 189 aa  120  9e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1878  CRISPR-associated Cas4 family protein  36.36 
 
 		 170 aa  117  9.999999999999999e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0349  CRISPR-associated Cas4 family protein  36.65 
 
 		 158 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.177576  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2837  CRISPR-associated protein Cas4  34.52 
 
 		 186 aa  116  1.9999999999999998e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.679978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1020  CRISPR-associated protein Cas4  35.58 
 
 		 161 aa  114  3.9999999999999997e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000334057  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0914  CRISPR-associated Cas4 family protein  35.93 
 
 		 173 aa  114  6.9999999999999995e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0131013  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1423  CRISPR-associated protein Cas4  38.51 
 
 		 166 aa  114  6.9999999999999995e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.283584  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0918  CRISPR-associated protein Cas4  36.81 
 
 		 162 aa  108  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000176613 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1728  CRISPR-associated Cas4 family protein  33.73 
 
 		 177 aa  107  7.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.855022 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1289  CRISPR-associated protein Cas4  36.26 
 
 		 165 aa  105  3e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1638  CRISPR-associated protein Cas4  29.94 
 
 		 180 aa  100  7e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.270939  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1450  CRISPR-associated protein Cas4  33.33 
 
 		 192 aa  100  9e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0902  CRISPR-associated protein Cas4  34.94 
 
 		 163 aa  100  1e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.057649  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1229  CRISPR-associated protein Cas4  34.97 
 
 		 167 aa  97.4  8e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2015  CRISPR-associated Cas4 family protein  34.55 
 
 		 170 aa  95.5  3e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1083  CRISPR-associated Cas4 family protein  28.14 
 
 		 172 aa  93.6  1e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1022  CRISPR-associated Cas4 family protein  36.02 
 
 		 159 aa  93.2  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0447  CRISPR-associated protein Cas4  35.98 
 
 		 166 aa  90.5  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0664  CRISPR-associated protein Cas4  33.93 
 
 		 161 aa  87.8  6e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0807388  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0936  CRISPR-associated protein Cas4  28.22 
 
 		 169 aa  82  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3001  CRISPR-associated protein Cas4  29.27 
 
 		 162 aa  79  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0454064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0395  CRISPR-associated protein Cas4  35.34 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0424779  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1000  hypothetical protein  22.84 
 
 		 172 aa  67  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1804  RecB family exonuclease  32.12 
 
 		 162 aa  62.8  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1391  hypothetical protein  21.82 
 
 		 171 aa  60.1  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.268781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1975  CRISPR-associated protein Cas4  23.23 
 
 		 220 aa  43.1  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.360978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1872  CRISPR-associated Cas4 family protein  25.14 
 
 		 198 aa  41.6  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0755  CRISPR-associated Cas4 family protein  26.44 
 
 		 178 aa  41.2  0.007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.714771  normal  0.862744 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>