55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1723 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1723  P27 family phage terminase small subunit  100 
 
 		 160 aa  333  7.999999999999999e-91  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000117045  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7138  P27 family phage terminase small subunit  45.45 
 
 		 152 aa  134  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00058611 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0646  P27 family phage terminase small subunit  41.94 
 
 		 161 aa  125  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.646797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0871  P27 family phage terminase small subunit  43.66 
 
 		 152 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.831198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3398  P27 family phage terminase small subunit  41.09 
 
 		 158 aa  108  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.096573  hitchhiker  0.0000000756325 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2470  phage terminase, small subunit, , P27 family  37.82 
 
 		 163 aa  105  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2064  P27 family phage terminase small subunit  37.25 
 
 		 156 aa  105  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00145671 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3882  phage terminase, small subunit, putative  35.62 
 
 		 155 aa  101  5e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.686092  hitchhiker  0.00346128 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4461  putative phage terminase, small subunit, P27 family  37.41 
 
 		 154 aa  100  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000187625 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1288  P27 family phage terminase small subunit  40.82 
 
 		 132 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.163062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1678  P27 family phage terminase small subunit  34.87 
 
 		 161 aa  95.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.253906  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2968  phage terminase small subunit  36 
 
 		 170 aa  91.3  5e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2620  phage terminase, small subunit, putative, P27 family  35.71 
 
 		 167 aa  89  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0118703  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3265  phage terminase, small subunit, P27 family  31.72 
 
 		 153 aa  87.4  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.757677  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2597  phage terminase, small subunit, , P27 family  33.12 
 
 		 170 aa  87  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.115209  normal  0.0515475 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0465  phage terminase, small subunit  35.77 
 
 		 157 aa  86.3  2e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.371651 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0622  phage terminase, small subunit, , P27 family  31.94 
 
 		 165 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2268  putative phage terminase, small subunit, P27 family  34.04 
 
 		 164 aa  77.8  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.753219  normal  0.08804 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1454  phage terminase, small subunit, , P27 family  33.12 
 
 		 165 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2272  putative phage terminase, small subunit, P27 family  33.33 
 
 		 164 aa  77  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0621935  hitchhiker  0.0000000000000114171 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4249  phage terminase, small subunit, , P27 family  33.57 
 
 		 160 aa  73.2  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1473  phage terminase, small subunit, putative, P27  31.3 
 
 		 131 aa  69.7  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.889427  normal  0.331074 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1617  phage terminase, small subunit, putative, P27  31.3 
 
 		 131 aa  69.7  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.207143  normal  0.415042 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1185  P27 family phage terminase small subunit  28.29 
 
 		 160 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.133965  hitchhiker  0.000000000518622 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0871  Phage terminase protein  27.21 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0530685  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0669  P27 family phage terminase small subunit  30.63 
 
 		 154 aa  60.8  0.000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5504  phage terminase, small subunit, , P27 family  33.64 
 
 		 144 aa  60.5  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1588  putative phage terminase, small subunit  29.01 
 
 		 170 aa  58.9  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0296354  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2481  phage terminase, small subunit, putative, P27  29.6 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1724  phage terminase, small subunit, putative, P27  30.09 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0277511  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12668  phiRv2 prophage protein  30.15 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2844  hypothetical protein  30.25 
 
 		 183 aa  55.1  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0426152  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1369  P27 family phage terminase small subunit  30.17 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.369715 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0220  phage terminase, small subunit, , P27 family  30.43 
 
 		 166 aa  53.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000228338  unclonable  0.00000741257 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0286  P27 family phage terminase small subunit  29.57 
 
 		 144 aa  53.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0956  P27 family phage terminase small subunit  27.72 
 
 		 127 aa  52.4  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2021  phage terminase, small subunit, putative, P27  25.21 
 
 		 137 aa  51.2  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0334  phage terminase, small subunit, putative, P27  25.21 
 
 		 137 aa  50.8  0.000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0390  hypothetical protein  29.01 
 
 		 183 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1659  putative phage terminase, small subunit, P27 family  25.74 
 
 		 157 aa  50.4  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2353  hypothetical protein  28.35 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1651  hypothetical protein  30.15 
 
 		 145 aa  48.9  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7333  phage terminase, small subunit, , P27 family  26.53 
 
 		 152 aa  47.8  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.367321  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1640  hypothetical protein  28.4 
 
 		 183 aa  47  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3988  phage terminase, small subunit, , P27 family  29.63 
 
 		 125 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5450  hypothetical protein  28.46 
 
 		 130 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1615  P27 family phage terminase small subunit  29.63 
 
 		 178 aa  46.2  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.415923  normal  0.344261 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1320  P27 family phage terminase small subunit  25.74 
 
 		 154 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000502965  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0839  phage terminase, small subunit, putative, P27  25.74 
 
 		 154 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00189834  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1630  hypothetical protein  28.15 
 
 		 145 aa  44.7  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.299301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0960  hypothetical protein  27.82 
 
 		 138 aa  44.7  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0602496 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1242  hypothetical protein  27.78 
 
 		 183 aa  43.9  0.0009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00220491  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3974  hypothetical protein  30.3 
 
 		 173 aa  43.9  0.0009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0829411 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1651  P27 family phage terminase small subunit  26.44 
 
 		 124 aa  43.1  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.430539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1650  Phage terminase, small subunit  21.58 
 
 		 187 aa  43.1  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>