More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1251 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1251  xanthine/uracil/vitamin C permease  100 
 
 		 465 aa  913    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000260393  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0209  Xanthine/uracil/vitamin C permease  65.72 
 
 		 476 aa  580  1e-164  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.746672  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4073  Xanthine/uracil/vitamin C permease  60.68 
 
 		 470 aa  520  1e-146  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000669664  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1665  permease  58.23 
 
 		 464 aa  508  9.999999999999999e-143  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3346  xanthine/uracil/vitamin C permease  57.82 
 
 		 453 aa  499  1e-140  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00813782  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0225  purine transporter, AzgA family  57.36 
 
 		 464 aa  490  1e-137  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0365  xanthine/uracil permease family protein  48.85 
 
 		 473 aa  454  1.0000000000000001e-126  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0987606  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0516  xanthine/uracil/vitamin C permease  52.37 
 
 		 460 aa  455  1.0000000000000001e-126  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000274491  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0375  xanthine/uracil/vitamin C permease  48.02 
 
 		 473 aa  441  9.999999999999999e-123  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0283882  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1894  xanthine/uracil/vitamin C permease  52.68 
 
 		 473 aa  420  1e-116  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0190312  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0414  xanthine/uracil/vitamin C permease  47.61 
 
 		 482 aa  417  9.999999999999999e-116  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.222193  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0974  membrane permease  47.84 
 
 		 430 aa  394  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.827979  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01158  permease  47.93 
 
 		 429 aa  392  1e-108  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1745  xanthine/uracil/vitamin C permease  47.06 
 
 		 440 aa  393  1e-108  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004272  xanthine/uracil/thiamine/ascorbate permease family protein  47.49 
 
 		 429 aa  391  1e-107  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3768  xanthine/uracil/vitamin C permease  48.7 
 
 		 430 aa  389  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0362  Xanthine/uracil/vitamin C permease  47.84 
 
 		 452 aa  386  1e-106  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00525533  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0661  uracil-xanthine permease, putative  47.94 
 
 		 430 aa  385  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.515071  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4615  xanthine/uracil/vitamin C permease  48.37 
 
 		 430 aa  385  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.177747  normal  0.424997 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3904  Xanthine/uracil/vitamin C permease  47.61 
 
 		 453 aa  384  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0623  putative uracil-xanthine permease  47.51 
 
 		 430 aa  380  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1453  Xanthine/uracil/vitamin C permease  46.75 
 
 		 462 aa  380  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4897  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.89 
 
 		 431 aa  380  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.419904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1868  hypothetical protein  46.32 
 
 		 430 aa  380  1e-104  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0492643  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1119  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.57 
 
 		 473 aa  379  1e-104  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.503349  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3796  xanthine/uracil/vitamin C permease  47.17 
 
 		 454 aa  379  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0566594 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5908  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.96 
 
 		 432 aa  376  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.688151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4648  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.98 
 
 		 431 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.873527 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0238  Xanthine/uracil/vitamin C permease  45.13 
 
 		 441 aa  375  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1115  Xanthine/uracil/vitamin C permease  45.03 
 
 		 441 aa  375  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0785  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.54 
 
 		 431 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4653  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.54 
 
 		 431 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0293  xanthine/uracil permease family protein  45.65 
 
 		 441 aa  372  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.903242  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4515  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.54 
 
 		 441 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.777214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1827  xanthine/uracil permease family protein  47.49 
 
 		 429 aa  372  1e-102  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.779296  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3892  Xanthine/uracil/vitamin C permease  45.43 
 
 		 434 aa  373  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.642873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3780  Xanthine/uracil/vitamin C permease  45.43 
 
 		 434 aa  373  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0612559  normal  0.111868 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0940  Xanthine/uracil/vitamin C permease  43.1 
 
 		 463 aa  371  1e-101  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0195  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.13 
 
 		 433 aa  370  1e-101  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.682246  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4653  xanthine/uracil permease family protein  44.54 
 
 		 431 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0255  xanthine/uracil permease family protein  45.44 
 
 		 441 aa  371  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0241  guanine-hypoxanthine permease; xanthine/uracil permease family protein  45.44 
 
 		 441 aa  371  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.864417  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1716  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.13 
 
 		 433 aa  370  1e-101  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.373341  normal  0.633993 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0244  guanine-hypoxanthine permease; xanthine/uracil permease family protein  45.44 
 
 		 441 aa  372  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0242401  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0302  xanthine/uracil permease family protein  45.44 
 
 		 441 aa  370  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00487612  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0248  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.44 
 
 		 441 aa  371  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000150063  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0270  xanthine/uracil permease family protein  45.44 
 
 		 441 aa  371  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0137601  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0832  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.02 
 
 		 430 aa  369  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5022  xanthine/uracil permease family protein  45.65 
 
 		 441 aa  371  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000757996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1547  permease  47.28 
 
 		 429 aa  370  1e-101  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0198208  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0321  xanthine/uracil permease family protein  45.44 
 
 		 441 aa  371  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000181359  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02237  hypothetical protein  45.43 
 
 		 434 aa  368  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0887  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.48 
 
 		 433 aa  366  1e-100  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4286  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.2 
 
 		 431 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.19892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2280  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.52 
 
 		 444 aa  365  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000412367  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2321  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.52 
 
 		 444 aa  365  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000388996  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0295  xanthine/uracil permease family protein  46.07 
 
 		 441 aa  368  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1785  Xanthine/uracil/vitamin C permease  44.61 
 
 		 436 aa  368  1e-100  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  2.31517e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5121  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.35 
 
 		 433 aa  365  1e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.560875  normal  0.502437 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1571  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.13 
 
 		 433 aa  365  1e-99  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0254  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.76 
 
 		 441 aa  364  2e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000390188  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4656  Xanthine/uracil/vitamin C permease  44.23 
 
 		 446 aa  363  3e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1232  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.65 
 
 		 441 aa  363  3e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.444446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5656  Xanthine/uracil/vitamin C permease  44.18 
 
 		 433 aa  363  4e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.938894 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2372  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.34 
 
 		 457 aa  363  4e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0283802  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5339  xanthine/uracil/vitamin C permease:sulphate transporter  45.34 
 
 		 453 aa  362  7.0000000000000005e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0727  Xanthine/uracil/vitamin C permease  47.02 
 
 		 458 aa  362  8e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62440  putative transporter  43.91 
 
 		 431 aa  362  9e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0897  AzgA family purine transporter  43.7 
 
 		 433 aa  360  2e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.196873  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2164  permease  43.7 
 
 		 433 aa  360  2e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0806  AzgA family purine transporter  43.7 
 
 		 433 aa  360  2e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1814  permease  43.91 
 
 		 433 aa  361  2e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1078  NCS2 family nucleobase/cation symporter  43.75 
 
 		 433 aa  361  2e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.234361  normal  0.0267352 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5435  putative transporter  43.7 
 
 		 431 aa  360  3e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3579  Xanthine/uracil/vitamin C permease  44.1 
 
 		 431 aa  360  3e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.429295  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3600  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.07 
 
 		 429 aa  359  6e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3086  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.72 
 
 		 429 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44800  putative transporter  42.61 
 
 		 449 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.174562 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1118  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.91 
 
 		 442 aa  357  2.9999999999999997e-97  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.286705 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0965  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.29 
 
 		 429 aa  356  5.999999999999999e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1566  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.41 
 
 		 430 aa  355  7.999999999999999e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000114361 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04970  Xanthine/uracil/vitamin C permease  44.9 
 
 		 433 aa  355  7.999999999999999e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.131082  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0202  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.01 
 
 		 446 aa  355  8.999999999999999e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00866517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3417  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.64 
 
 		 429 aa  354  2e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.933273 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3644  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.91 
 
 		 433 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1598  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.74 
 
 		 435 aa  353  4e-96  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3815  putative transporter  42.39 
 
 		 449 aa  353  5e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.231468  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1835  xanthine/uracil permease family protein  42.46 
 
 		 444 aa  352  5.9999999999999994e-96  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000000130891  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0702  xanthine/uracil/vitamin C transporter  43.48 
 
 		 433 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2517  xanthine/uracil permease family protein  43.2 
 
 		 429 aa  352  8e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000472895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3962  Xanthine/uracil/vitamin C permease  42.64 
 
 		 446 aa  351  1e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4396  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.48 
 
 		 433 aa  352  1e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.323664  normal  0.0500816 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3669  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.3 
 
 		 446 aa  350  2e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2977  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.41 
 
 		 429 aa  350  2e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4915  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.26 
 
 		 433 aa  351  2e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5815  putative xanthine/uracil permease  43.91 
 
 		 453 aa  351  2e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2756  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.52 
 
 		 446 aa  351  2e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.759738  normal  0.128218 
 
 
-
 
NC_002950  PG0936  xanthine/uracil permease family protein  44.44 
 
 		 433 aa  350  3e-95  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0512099 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3956  Xanthine/uracil/vitamin C permease  43.25 
 
 		 449 aa  350  3e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.550955  normal  0.250278 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2793  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.73 
 
 		 431 aa  350  4e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>