260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1900 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_1900  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  100 
 
 
215 aa  443  1e-124  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0225533  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0186  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  59.07 
 
 
213 aa  249  2e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.626116  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0717  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  55.92 
 
 
212 aa  235  4e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.170701 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0787  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  55.92 
 
 
212 aa  234  5e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.109615  normal  0.222265 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1243  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  54.42 
 
 
213 aa  234  9e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0527508 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0767  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  54.03 
 
 
212 aa  228  5e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.127871 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1509  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  53.02 
 
 
214 aa  226  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.01004e-05 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4116  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  53 
 
 
215 aa  225  4e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.225541  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3853  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  53.46 
 
 
215 aa  225  4e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0541085  normal  0.804089 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4331  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  51.15 
 
 
215 aa  223  2e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.262405  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1067  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  55.66 
 
 
211 aa  223  2e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50800  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  52.07 
 
 
215 aa  222  3e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587779 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0741  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  50.24 
 
 
213 aa  222  4e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.643542  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3221  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  50.71 
 
 
213 aa  221  8e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0110352  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4286  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  51.61 
 
 
215 aa  220  1e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1436  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  52.07 
 
 
215 aa  220  1e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0815  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  51.66 
 
 
212 aa  219  2e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.554957  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0514  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  50.71 
 
 
212 aa  219  4e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.439872  normal  0.298122 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0423  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  51.18 
 
 
211 aa  218  4e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.190408  normal  0.079885 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1229  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  52.53 
 
 
215 aa  218  4e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1150  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  51.61 
 
 
215 aa  217  8e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.343525  normal  0.105039 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1129  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  51.15 
 
 
215 aa  217  1e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00425892 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0557  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  51.16 
 
 
214 aa  216  2e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.365319  normal  0.0595481 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1165  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  51.15 
 
 
215 aa  216  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0728  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  52.09 
 
 
214 aa  214  5e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0663  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  51.89 
 
 
211 aa  213  1e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2494  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  50 
 
 
214 aa  213  3e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00659427  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0107  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  50 
 
 
214 aa  213  3e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  2.3808e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0659  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  50 
 
 
214 aa  213  3e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0194138  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0359  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  50 
 
 
214 aa  213  3e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0016328  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1850  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  50.7 
 
 
214 aa  212  4e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.239685  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2642  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  51.66 
 
 
212 aa  211  8e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0717  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  49.53 
 
 
265 aa  211  8e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  9.6585e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2893  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  48.37 
 
 
213 aa  211  9e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1061  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  49.53 
 
 
214 aa  211  9e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.040983  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19500  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  51.15 
 
 
215 aa  211  9e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.187849  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0904  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  49.53 
 
 
214 aa  211  9e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0158513  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0901  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  49.53 
 
 
214 aa  211  9e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.901665  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3489  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  51.44 
 
 
214 aa  210  1e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.481543  normal  0.892372 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0555  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  49.3 
 
 
212 aa  209  2e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.410968  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2888  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  50.71 
 
 
210 aa  208  4e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.877962  normal  0.487747 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0582  hypothetical protein  49.29 
 
 
215 aa  208  5e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0601  hypothetical protein  49.29 
 
 
215 aa  208  5e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2568  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  49.53 
 
 
214 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.387899  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1957  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  49.53 
 
 
214 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.414052  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5900  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  49.53 
 
 
214 aa  206  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.495337 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2592  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  49.53 
 
 
214 aa  206  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.984906 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2487  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  49.06 
 
 
214 aa  205  4e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.262881 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2616  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  49.3 
 
 
214 aa  205  4e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1775  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  45.83 
 
 
215 aa  204  5e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0503905 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0417  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  49.3 
 
 
213 aa  204  7e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2478  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  53.65 
 
 
213 aa  204  1e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.12705  normal  0.1751 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0848  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  49.07 
 
 
217 aa  201  7e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0332  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  48.84 
 
 
211 aa  200  1e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.207205 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0835  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  52.36 
 
 
200 aa  197  1e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2993  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  46.51 
 
 
213 aa  196  2e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.047465  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0930  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  45.75 
 
 
212 aa  195  4e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0957  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  45.75 
 
 
212 aa  195  4e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0155  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  46.7 
 
 
211 aa  194  7e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.923059  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3559  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  50 
 
 
239 aa  192  3e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.41957 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2922  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  50.71 
 
 
211 aa  192  3e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.969034 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2817  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  47.69 
 
 
211 aa  192  4e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.878112  normal  0.0808941 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1895  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  46.7 
 
 
217 aa  191  6e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.85169  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2372  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  46.7 
 
 
229 aa  191  7e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4533  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  52.63 
 
 
202 aa  191  8e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.387891  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0857  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  48.42 
 
 
222 aa  188  5e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3713  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  48.34 
 
 
226 aa  188  5e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.589399  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1311  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  49.47 
 
 
233 aa  188  6e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.279184  normal  0.369294 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3586  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  46.92 
 
 
215 aa  187  7e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.63325  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0363  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  45.12 
 
 
216 aa  187  7e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.138758  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2058  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  47.71 
 
 
217 aa  186  2e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.183278  normal  0.448099 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2803  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  48.82 
 
 
225 aa  186  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00595972  normal  0.551671 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2378  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  45.75 
 
 
227 aa  186  2e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.25247  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0886  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  44.19 
 
 
214 aa  186  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0394  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  48.19 
 
 
215 aa  186  2e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.17512  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11923  Pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  44.13 
 
 
213 aa  186  2e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.227321  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2564  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  47.71 
 
 
212 aa  186  3e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.252364  normal  0.0693579 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2662  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  45.75 
 
 
227 aa  185  4e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0604494  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2989  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  49.29 
 
 
215 aa  185  4e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.274237  normal  0.310077 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1007  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  43.78 
 
 
216 aa  184  6e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4542  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  42.27 
 
 
214 aa  184  7e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1693  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  46.23 
 
 
233 aa  184  7e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0861149  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1881  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  47.71 
 
 
217 aa  184  1e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2931  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  47.71 
 
 
224 aa  184  1e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2218  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  45.07 
 
 
217 aa  183  2e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000558719 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1358  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  43.32 
 
 
216 aa  183  2e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.426968  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0416  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  45.31 
 
 
208 aa  182  3e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.867273  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1810  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  45.5 
 
 
218 aa  182  4e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00431301  hitchhiker  0.00113301 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1068  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  48.96 
 
 
210 aa  182  5e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.326405  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3944  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  46.33 
 
 
215 aa  181  5e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000793587  normal  0.125259 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1991  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  44.55 
 
 
218 aa  181  6e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0105907 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01608  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  44.55 
 
 
218 aa  181  6e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2002  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  44.55 
 
 
218 aa  181  6e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000269962  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1714  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  44.55 
 
 
218 aa  181  6e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.243328  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01598  hypothetical protein  44.55 
 
 
218 aa  181  6e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4168  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  45.79 
 
 
217 aa  181  7e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.481002  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0424  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  44.79 
 
 
208 aa  181  1e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2350  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  44.08 
 
 
218 aa  180  1e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0623202  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0790  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  47.37 
 
 
208 aa  180  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.150003 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1561  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  44.08 
 
 
218 aa  180  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>