121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2712 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2712  dithiol-disulfide isomerase  100 
 
 		 223 aa  465  9.999999999999999e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2046  hypothetical protein  37.75 
 
 		 207 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0174425  normal  0.659871 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4089  hypothetical protein  35.24 
 
 		 211 aa  145  5e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0795  DSBA oxidoreductase  36.76 
 
 		 221 aa  141  9e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0142876  normal  0.0910349 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0725  DSBA oxidoreductase  36.27 
 
 		 221 aa  137  8.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.246686  normal  0.929424 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1694  DSBA oxidoreductase  37.74 
 
 		 210 aa  136  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.274727 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1688  conserved hypothetical protein, thioredoxin-like fold  35.38 
 
 		 210 aa  136  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.746509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53160  hypothetical protein  37.5 
 
 		 200 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6744  thioredoxin-like fold  37.38 
 
 		 214 aa  135  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1769  putative protein-disulfide isomerase  33.99 
 
 		 207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0763119  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4660  hypothetical protein  35.12 
 
 		 212 aa  133  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.275495  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1366  DSBA oxidoreductase  33.49 
 
 		 210 aa  128  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.28938  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34850  DSBA oxidoreductase  34.17 
 
 		 199 aa  127  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1735  hypothetical protein  33.99 
 
 		 210 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.824558  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0778  hypothetical protein  33.82 
 
 		 221 aa  126  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.544779  normal  0.0154482 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3657  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 210 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.381267 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3102  protein-disulfide isomerase-like protein  33.5 
 
 		 221 aa  125  4.0000000000000003e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.967383  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3955  DSBA oxidoreductase  33.01 
 
 		 210 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0174672 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1350  DSBA oxidoreductase  33.01 
 
 		 210 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6828  conserved hypothetical protein, thioredoxin-like fold protein  34.65 
 
 		 210 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.391464 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3640  protein-disulfide isomerase  32.24 
 
 		 242 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2644  hypothetical protein  30.61 
 
 		 209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.25227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0606  putative protein-disulfide isomerase  29.05 
 
 		 238 aa  105  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.872062  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0075  hypothetical protein  32.58 
 
 		 206 aa  105  4e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1051  hypothetical protein  29.05 
 
 		 242 aa  105  6e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0212434  normal  0.0155406 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2620  thioredoxin domain-containing protein  31.05 
 
 		 259 aa  101  9e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0530  hypothetical protein  29.38 
 
 		 208 aa  99.4  4e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000790995  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1759  DSBA oxidoreductase  32.34 
 
 		 199 aa  99  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0545  hypothetical protein  28.86 
 
 		 200 aa  98.6  7e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22500  protein-disulfide isomerase  29.23 
 
 		 244 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000773657  hitchhiker  0.0000178225 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0459  hypothetical protein  26.98 
 
 		 212 aa  94  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3568  hypothetical protein  27.84 
 
 		 213 aa  93.6  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1413  hypothetical protein  25.89 
 
 		 209 aa  92  6e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0401797  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5479  thioredoxin  26.9 
 
 		 206 aa  91.3  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000603844 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4446  hypothetical protein  28.02 
 
 		 208 aa  90.1  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0048258 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2043  thioredoxin  26.34 
 
 		 208 aa  89.7  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1963  DSBA oxidoreductase  24.04 
 
 		 207 aa  87.8  1e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00619259  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0950  thioredoxin  26.4 
 
 		 206 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4381  thioredoxin  27.13 
 
 		 206 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.583730000000001e-23 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0279  protein-disulfide isomerase  26.6 
 
 		 206 aa  86.7  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000930867  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1372  hypothetical protein  28.27 
 
 		 228 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0623516  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2460  protein-disulfide isomerase  28.27 
 
 		 225 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161957  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0358  hypothetical protein  28.27 
 
 		 228 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.496177  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1267  hypothetical protein  28.27 
 
 		 228 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.42251  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1193  hypothetical protein  28.27 
 
 		 228 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0935  hypothetical protein  28.27 
 
 		 228 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1753  hypothetical protein  30.56 
 
 		 245 aa  82  0.000000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.93705  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0636  hypothetical protein  28.27 
 
 		 249 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1753  hypothetical protein  26.5 
 
 		 207 aa  79  0.00000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.731876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3841  hypothetical protein  32.22 
 
 		 216 aa  79  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.782723 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002936  thioredoxin  26.67 
 
 		 209 aa  76.3  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000472775  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1385  hypothetical protein  27.39 
 
 		 231 aa  76.6  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.147376  normal  0.897973 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1321  hypothetical protein  27.39 
 
 		 231 aa  76.6  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0445299  normal  0.563378 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1542  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  28.1 
 
 		 232 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1053  hypothetical protein  25.13 
 
 		 215 aa  75.5  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3663  hypothetical protein  30.51 
 
 		 256 aa  74.3  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0807483  normal  0.175109 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2293  hypothetical protein  26.63 
 
 		 218 aa  73.6  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.472167 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1475  DSBA oxidoreductase  27.85 
 
 		 220 aa  72.4  0.000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0294  hypothetical protein  27.13 
 
 		 222 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3490  hypothetical protein  28.49 
 
 		 218 aa  71.2  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.320877  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3039  putative protein-disulfide isomerase  28.96 
 
 		 206 aa  71.2  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.41836 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2250  hypothetical protein  27.87 
 
 		 214 aa  70.5  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.72314  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3629  hypothetical protein  29.28 
 
 		 218 aa  70.5  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0058  hypothetical protein  27.16 
 
 		 233 aa  68.6  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1561  DSBA oxidoreductase  25.12 
 
 		 305 aa  68.2  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000756973  normal  0.805709 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1444  hypothetical protein  29.19 
 
 		 242 aa  67  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2391  dithiol-disulfide isomerase  24.75 
 
 		 319 aa  67  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.20777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1089  putative protein-disulfide isomerase  27.49 
 
 		 217 aa  67  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4159  polyketide biosynthesis dithiol-disulfide isomerase-like protein  24.06 
 
 		 328 aa  67  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5215  hypothetical protein  26.09 
 
 		 336 aa  67.4  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00274094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02994  protein-disulfide isomerase  23.49 
 
 		 198 aa  66.2  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0336  hypothetical protein  24.59 
 
 		 209 aa  65.5  0.0000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.483638  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6472  hypothetical protein  25.79 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2351  hypothetical protein  26.11 
 
 		 214 aa  65.1  0.0000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3475  hypothetical protein  26.97 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1273  DSBA oxidoreductase  23.93 
 
 		 303 aa  62.8  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1155  putative protein-disulfide isomerase  26.32 
 
 		 217 aa  61.6  0.000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.400146 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1351  protein-disulfide isomerase-like protein  27.27 
 
 		 217 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.485662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2523  DSBA oxidoreductase  24.3 
 
 		 300 aa  61.2  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1089  putative protein-disulfide isomerase  25.59 
 
 		 217 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0966  hypothetical protein  27.32 
 
 		 211 aa  58.2  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3255  hypothetical protein  27.32 
 
 		 211 aa  58.2  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0101602  hitchhiker  0.0000000123908 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1019  hypothetical protein  27.32 
 
 		 211 aa  58.2  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1398  DSBA oxidoreductase  22.07 
 
 		 221 aa  57  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.928742 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0485  DSBA oxidoreductase  22.56 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000937  hypothetical protein  22.53 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.043372  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3166  putative protein-disulfide isomerase  23.66 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.343946  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1625  hypothetical protein  23.38 
 
 		 297 aa  55.1  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1205  putative protein-disulfide isomerase  23.91 
 
 		 230 aa  55.1  0.0000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.090867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2107  polyketide biosynthesis dithiol-disulfide isomerase-like protein  24 
 
 		 221 aa  54.3  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2784  putative protein-disulfide isomerase  24.46 
 
 		 233 aa  54.7  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0238093  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3165  putative protein-disulfide isomerase  24.46 
 
 		 230 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00700  hypothetical protein  25.59 
 
 		 234 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1805  thioredoxin  24.39 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.379307  normal  0.533532 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3309  putative protein-disulfide isomerase  23.91 
 
 		 230 aa  52.4  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0312483 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0770  hypothetical protein  21.39 
 
 		 297 aa  52.4  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2050  DSBA oxidoreductase  26.21 
 
 		 225 aa  52  0.000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1148  DSBA oxidoreductase  23.35 
 
 		 237 aa  51.6  0.000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1347  DSBA oxidoreductase  25.73 
 
 		 233 aa  51.2  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1578  hypothetical protein  23.11 
 
 		 221 aa  50.4  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>