More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1631 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1631  ribosomal protein L18  100 
 
 		 117 aa  235  2e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1163  ribosomal protein L18  65.22 
 
 		 118 aa  157  5e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000618231  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0381  ribosomal protein L18  62.61 
 
 		 116 aa  142  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.958382  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3146  50S ribosomal protein L18P  57.63 
 
 		 116 aa  126  8.000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00662623  normal  0.561423 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0610  50S ribosomal protein L18P  57.5 
 
 		 118 aa  126  8.000000000000001e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0267024  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1815  50S ribosomal protein L18  53.33 
 
 		 120 aa  126  9.000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0306  50S ribosomal protein L18  58.18 
 
 		 119 aa  126  9.000000000000001e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.38344e-28 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05800  RplR  61.86 
 
 		 117 aa  125  2.0000000000000002e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2698  50S ribosomal protein L18  55.45 
 
 		 119 aa  125  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2383  50S ribosomal protein L18  55.45 
 
 		 119 aa  125  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1891  50S ribosomal protein L18  56.36 
 
 		 118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.865797  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5179  50S ribosomal protein L18  50.83 
 
 		 120 aa  124  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311819  unclonable  1.18579e-25 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4359  ribosomal protein L18  53.45 
 
 		 117 aa  124  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000257389  normal  0.0751525 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0305  50S ribosomal protein L18  57.89 
 
 		 119 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.413782  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0138  50S ribosomal protein L18  50.83 
 
 		 120 aa  124  5e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.4273e-62 
 
 
-
 
NC_002950  PG1922  50S ribosomal protein L18  54.7 
 
 		 114 aa  124  6e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5771  ribosomal protein L18  56.03 
 
 		 117 aa  123  7e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.74936  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0074  50S ribosomal protein L18  55.45 
 
 		 118 aa  123  7e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.966065  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0126  50S ribosomal protein L18  50.83 
 
 		 120 aa  123  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000140079  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0126  50S ribosomal protein L18  50.83 
 
 		 120 aa  123  8.000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0122  50S ribosomal protein L18  50.83 
 
 		 120 aa  123  8.000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109989  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0120  50S ribosomal protein L18  50.83 
 
 		 120 aa  123  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000618216  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0147  50S ribosomal protein L18  50.83 
 
 		 120 aa  123  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000702498  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0126  50S ribosomal protein L18  50.83 
 
 		 120 aa  123  8.000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0315012  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0157  50S ribosomal protein L18  50.83 
 
 		 120 aa  123  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109054  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0127  50S ribosomal protein L18  51.67 
 
 		 120 aa  123  9e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2261  50S ribosomal protein L18  54.17 
 
 		 119 aa  123  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00249191  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2302  50S ribosomal protein L18  54.17 
 
 		 119 aa  123  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0220849  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0121  50S ribosomal protein L18  51.82 
 
 		 120 aa  123  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000538516  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1467  50S ribosomal protein L18  53.64 
 
 		 118 aa  123  1e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000595755  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0724  ribosomal protein L18  51.67 
 
 		 124 aa  122  1e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.111204  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2213  50S ribosomal protein L18  55.26 
 
 		 119 aa  122  1e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000234169  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0618  ribosomal protein L18  56.14 
 
 		 117 aa  122  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.969603 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3979  ribosomal protein L18  53.28 
 
 		 122 aa  122  2e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1835  50S ribosomal protein L18  54.39 
 
 		 119 aa  122  2e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5140  ribosomal protein L18  53.64 
 
 		 126 aa  121  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.642153 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2407  50S ribosomal protein L18  57.02 
 
 		 119 aa  121  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0221783  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0123  50S ribosomal protein L18  52.5 
 
 		 120 aa  121  4e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0322  50S ribosomal protein L18P  50 
 
 		 128 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00166637 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2280  50S ribosomal protein L18  52.63 
 
 		 119 aa  118  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000151304  hitchhiker  0.00323172 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2048  50S ribosomal protein L18  52.63 
 
 		 119 aa  118  1.9999999999999998e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00722751  normal  0.437554 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0120  50S ribosomal protein L18  50 
 
 		 120 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000542863  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0858  ribosomal protein L18  51.28 
 
 		 119 aa  118  3e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1729  50S ribosomal protein L18  53.28 
 
 		 124 aa  118  3e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000500708  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4010  50S ribosomal protein L18  55.56 
 
 		 121 aa  118  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00000737084  hitchhiker  0.0000640833 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04140  LSU ribosomal protein L18P  55.77 
 
 		 134 aa  118  3e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1508  50S ribosomal protein L18  52.07 
 
 		 121 aa  117  3.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.175326  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3690  ribosomal protein L18  53.98 
 
 		 134 aa  117  3.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  0.000000255511  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2630  50S ribosomal protein L18P  53.85 
 
 		 128 aa  117  6e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.13685  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1924  50S ribosomal protein L18  62.11 
 
 		 120 aa  117  6e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.845183  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3127  ribosomal protein L18  50.91 
 
 		 125 aa  117  7e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0774  ribosomal protein L18  50.41 
 
 		 122 aa  116  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000026259  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2802  50S ribosomal protein L18  54.05 
 
 		 117 aa  116  9.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.449731 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0337  50S ribosomal protein L18  61.05 
 
 		 120 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2752  ribosomal protein L18  53.98 
 
 		 118 aa  115  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.333327  normal  0.200711 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0731  ribosomal protein L18  50 
 
 		 125 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4305  ribosomal protein L18  48.28 
 
 		 127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0301  50S ribosomal protein L18  53.1 
 
 		 119 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.525651 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0211  50S ribosomal protein L18  51.82 
 
 		 117 aa  115  1.9999999999999998e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0774  ribosomal protein L18  51.79 
 
 		 122 aa  115  3e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1242  50S ribosomal protein L18P  48.7 
 
 		 124 aa  115  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0425166  hitchhiker  0.0030984 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4782  50S ribosomal protein L18  51.33 
 
 		 120 aa  114  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127323  hitchhiker  0.000000074744 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2148  50S ribosomal protein L18  55.36 
 
 		 120 aa  114  5e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1494  hypothetical protein  50.88 
 
 		 116 aa  113  6.9999999999999995e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.256346 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1338  50S ribosomal protein L18  51.3 
 
 		 137 aa  113  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.000353034  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2891  ribosomal protein L18  54.95 
 
 		 112 aa  113  7.999999999999999e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0197  50S ribosomal protein L18  52.63 
 
 		 119 aa  113  8.999999999999998e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.326686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2217  50S ribosomal protein L18  57 
 
 		 120 aa  113  8.999999999999998e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.442401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0883  50S ribosomal protein L18  48.76 
 
 		 121 aa  113  8.999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.418113  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2695  ribosomal protein L18  50.83 
 
 		 119 aa  113  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1269  ribosomal protein L18  52.43 
 
 		 120 aa  113  1.0000000000000001e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5054  50S ribosomal protein L18  50.43 
 
 		 120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.570149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1169  50S ribosomal protein L18  55.56 
 
 		 121 aa  112  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0336131  normal  0.0947713 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3401  ribosomal protein L18  52.38 
 
 		 134 aa  112  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2463  50S ribosomal protein L18  58.95 
 
 		 120 aa  111  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.212338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1102  LSU ribosomal protein L18P  51.92 
 
 		 127 aa  111  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0571737 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0607  50S ribosomal protein L18  52.25 
 
 		 119 aa  111  3e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3008  50S ribosomal protein L18  48.33 
 
 		 120 aa  111  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156671  hitchhiker  0.00901101 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2185  50S ribosomal protein L18  58.95 
 
 		 120 aa  111  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.954863  normal  0.731843 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2049  ribosomal protein L18  50.43 
 
 		 116 aa  110  4.0000000000000004e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00570654  normal  0.0179917 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17010  LSU ribosomal protein L18P  49.12 
 
 		 124 aa  110  6e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000838424  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5031  50S ribosomal protein L18  50.43 
 
 		 136 aa  110  7.000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00000697313  normal  0.548641 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1662  50S ribosomal protein L18P  50.83 
 
 		 119 aa  110  7.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.130652  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0377  50S ribosomal protein L18  53.21 
 
 		 119 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.492357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4930  ribosomal protein L18  54.55 
 
 		 121 aa  109  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00612398  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1749  50S ribosomal protein L18  49.57 
 
 		 119 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.637683 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1731  50S ribosomal protein L18  53.21 
 
 		 119 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00463126  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1337  50S ribosomal protein L18  54.84 
 
 		 118 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.150956 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3432  50S ribosomal protein L18  49.57 
 
 		 120 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.23776  normal  0.3359 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1851  50S ribosomal protein L18  51.28 
 
 		 112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.662264 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0237  50S ribosomal protein L18  52.17 
 
 		 120 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0234  50S ribosomal protein L18  52.17 
 
 		 120 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.875475 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2919  50S ribosomal protein L18P  50.94 
 
 		 122 aa  108  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000202022  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1970  50S ribosomal protein L18  50.89 
 
 		 122 aa  109  2.0000000000000002e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2672  50S ribosomal protein L18P  53.1 
 
 		 120 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.159839  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1048  50S ribosomal protein L18  54.37 
 
 		 134 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00198535  normal  0.123064 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1122  ribosomal protein L18  47.54 
 
 		 122 aa  108  2.0000000000000002e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.805171  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1779  50S ribosomal protein L18P  49.57 
 
 		 120 aa  108  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0297069  normal  0.117381 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2960  50S ribosomal protein L18P  49.09 
 
 		 127 aa  108  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00477287  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1723  50S ribosomal protein L18  52.88 
 
 		 123 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00474742  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>