More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1584 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1584  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 312 aa  620  1e-177  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.317048 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0643  protein of unknown function DUF6 transmembrane  64.48 
 
 		 290 aa  349  3e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.141277  normal  0.135976 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2673  protein of unknown function DUF6 transmembrane  56.7 
 
 		 294 aa  323  2e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.481619  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1240  protein of unknown function DUF6 transmembrane  55.36 
 
 		 290 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0744  hypothetical protein  30.32 
 
 		 312 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.906344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0243  hypothetical protein  29.14 
 
 		 312 aa  101  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100372  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2045  hypothetical protein  29.53 
 
 		 309 aa  94  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.710395 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1615  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.51 
 
 		 291 aa  93.6  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0335  hypothetical protein  29.21 
 
 		 289 aa  90.9  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.414942 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0805  DMT family permease  27.54 
 
 		 304 aa  90.1  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378246 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0878  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.75 
 
 		 306 aa  89  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.754226  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2567  hypothetical protein  28.03 
 
 		 304 aa  88.6  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0314  hypothetical protein  28.76 
 
 		 306 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0352  permease, drug/metabolite transporter  28.9 
 
 		 306 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.110507  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0257  DMT family permease  28.39 
 
 		 310 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3057  transporter, EamA family  24.58 
 
 		 303 aa  82.8  0.000000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3272  hypothetical protein  29.48 
 
 		 314 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1406  hypothetical protein  28.68 
 
 		 324 aa  82  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.520748  normal  0.479385 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0260  DMT family permease  28.99 
 
 		 312 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2780  drug/metabolite exporter family protein  24.24 
 
 		 303 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2821  drug/metabolite exporter family protein  23.91 
 
 		 303 aa  79  0.00000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3092  EamA family protein  23.57 
 
 		 303 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00288744  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0406  hypothetical protein  28.96 
 
 		 306 aa  79  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2796  hypothetical protein  25.68 
 
 		 293 aa  79  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3073  transporter, EamA family  23.91 
 
 		 303 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2848  EamA family protein  23.91 
 
 		 303 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3061  eama family protein  23.91 
 
 		 303 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3090  transporter, EamA family  23.23 
 
 		 303 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0880872  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2840  hypothetical protein  23.57 
 
 		 303 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.269386  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2189  transporter, EamA family  23.23 
 
 		 303 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000931242 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2043  hypothetical protein  24.41 
 
 		 304 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3635  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.95 
 
 		 306 aa  77  0.0000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.437202  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5105  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.77 
 
 		 349 aa  76.6  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.910123  normal  0.400388 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2560  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.99 
 
 		 290 aa  76.3  0.0000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.711408  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2341  hypothetical protein  24.1 
 
 		 312 aa  75.5  0.000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0925779 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3287  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.23 
 
 		 288 aa  75.5  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.504842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1468  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.47 
 
 		 303 aa  74.7  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.845571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1390  DMT family permease  26.37 
 
 		 293 aa  74.7  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.526899  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2748  transporter, EamA family  25.74 
 
 		 305 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2354  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.91 
 
 		 302 aa  74.7  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.165015  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2616  hypothetical protein  29.43 
 
 		 310 aa  75.1  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0513326  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2768  EamA family protein  25.26 
 
 		 305 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000452563  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0056  hypothetical protein  26.37 
 
 		 293 aa  73.9  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0122515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2311  hypothetical protein  28.62 
 
 		 303 aa  73.9  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000443541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2544  transporter, EamA family  25 
 
 		 305 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000168841 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3424  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  25.9 
 
 		 301 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000803671 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5505  hypothetical protein  28.24 
 
 		 296 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1777  EamA family protein  26.62 
 
 		 301 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00180942  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1756  drug/metabolite exporter family protein  26.62 
 
 		 301 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2410  hypothetical protein  25.95 
 
 		 305 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1734  drug/metabolite exporter family protein  26.62 
 
 		 301 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000184981  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1951  transporter, EamA family  26.62 
 
 		 301 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000452263 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1915  eama family protein  26.62 
 
 		 301 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0191779  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1589  hypothetical protein  25.52 
 
 		 324 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.151328  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4196  hypothetical protein  25.17 
 
 		 293 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2425  hypothetical protein  27.74 
 
 		 313 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.61547  normal  0.354813 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2549  EamA family protein  25 
 
 		 305 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0928721  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2020  transporter, EamA family  27.34 
 
 		 283 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000240822  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2744  transporter, EamA family  25 
 
 		 305 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.55496e-17 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2736  eama family protein  25 
 
 		 305 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2049  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.91 
 
 		 308 aa  70.5  0.00000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4993  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  27.1 
 
 		 306 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.570492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63230  hypothetical protein  28.2 
 
 		 296 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2471  drug/metabolite exporter family protein  24.23 
 
 		 305 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1919  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  26.99 
 
 		 301 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.208347  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0391  hypothetical protein  26.79 
 
 		 330 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0667129  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1999  EamA family protein  26.64 
 
 		 301 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.099067  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0031  drug/metabolite transporter  24.73 
 
 		 294 aa  70.1  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6822  normal  0.556158 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0154  drug/metabolite transporter  24.73 
 
 		 294 aa  70.1  0.00000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.98831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7502  regulator protein pecM  22.7 
 
 		 307 aa  69.7  0.00000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1850  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.57 
 
 		 308 aa  69.7  0.00000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.152184  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2505  drug/metabolite exporter family protein  25.09 
 
 		 305 aa  69.3  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000162037  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1789  hypothetical protein  24.16 
 
 		 301 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000223486  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2545  hypothetical protein  26.61 
 
 		 299 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.281765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0265  hypothetical protein  26.35 
 
 		 307 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.726467  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2255  hypothetical protein  23.63 
 
 		 290 aa  68.6  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.116056  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3672  DMT family permease  26.62 
 
 		 311 aa  68.2  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.199096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06857  hypothetical protein  25.55 
 
 		 305 aa  67.8  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4921  hypothetical protein  25 
 
 		 316 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.876528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4000  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.4 
 
 		 321 aa  67.4  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2495  hypothetical protein  25 
 
 		 336 aa  67.4  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.939833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0328  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  26.89 
 
 		 306 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0605966  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2802  hypothetical protein  27.63 
 
 		 305 aa  67  0.0000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.930073 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0375  hypothetical protein  27.61 
 
 		 312 aa  66.6  0.0000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00512602  normal  0.079664 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4132  hypothetical protein  26.25 
 
 		 289 aa  66.2  0.0000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.507718  hitchhiker  0.00000080806 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0199  hypothetical protein  23.81 
 
 		 298 aa  65.9  0.0000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1251  hypothetical protein  29.54 
 
 		 306 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.948426 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5346  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.01 
 
 		 335 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1129  hypothetical protein  29.18 
 
 		 306 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00281156  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2153  hypothetical protein  29.18 
 
 		 306 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0413496 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2149  hypothetical protein  29.18 
 
 		 306 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.327458 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3529  hypothetical protein  27.63 
 
 		 356 aa  64.7  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  24.91 
 
 		 315 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2206  hypothetical protein  29.18 
 
 		 306 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.500007 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3106  hypothetical protein  24.22 
 
 		 299 aa  64.7  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0777432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1646  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.24 
 
 		 315 aa  64.3  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0088  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.5 
 
 		 290 aa  63.9  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.529373  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4483  hypothetical protein  25.75 
 
 		 305 aa  63.5  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0924  hypothetical protein  28.26 
 
 		 306 aa  63.2  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1225  hypothetical protein  28.26 
 
 		 306 aa  63.2  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.157758  normal  0.931863 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>