More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1227 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_1469  ABC transporter related protein  51.89 
 
 
586 aa  649  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1227  ABC transporter related  100 
 
 
589 aa  1194  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.175574 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4763  ABC transporter related  51.2 
 
 
591 aa  638  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.116722  normal  0.0159357 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0669  ABC transporter related  56.65 
 
 
588 aa  664  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.921203  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0313  ABC transporter, ATP-binding/membrane-spanning protein  49.3 
 
 
590 aa  601  1e-170  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13518  ATPase  49.57 
 
 
587 aa  578  1e-163  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4668  ABC transporter, transmembrane region  49.05 
 
 
584 aa  565  1e-160  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0047  ABC transporter-like protein  45.55 
 
 
586 aa  558  1e-158  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.99996 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0335  ABC transporter transmembrane region  46.57 
 
 
588 aa  547  1e-154  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1761  ATPase  44.67 
 
 
611 aa  545  1e-154  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.115592  normal  0.424794 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0453  ATPase  43.6 
 
 
614 aa  538  1e-151  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0418  ABC transporter related protein  45.02 
 
 
600 aa  528  1e-149  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0387  ABC transporter related  44.81 
 
 
619 aa  525  1e-148  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.102241  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2371  ABC transporter, ATPase subunit  41.46 
 
 
622 aa  523  1e-147  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0387  ABC transporter related  43.08 
 
 
611 aa  523  1e-147  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  3.1667e-08  normal  0.0347309 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0422  ABC transporter related  43.32 
 
 
613 aa  518  1e-145  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.333547  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  41.74 
 
 
594 aa  517  1e-145  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0318  ABC transporter related  43.48 
 
 
603 aa  512  1e-144  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0419  ABC transporter-related protein  42.78 
 
 
608 aa  504  1e-141  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0718918 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2627  ABC transporter related  41.54 
 
 
592 aa  483  1e-135  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2181  ABC transporter related  40.55 
 
 
600 aa  482  1e-134  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0034  ABC transporter related protein  37.42 
 
 
603 aa  456  1e-127  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0494  ABC transporter related  37.52 
 
 
611 aa  456  1e-127  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  40.48 
 
 
597 aa  455  1e-126  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0033  ABC transporter related  37.48 
 
 
602 aa  452  1e-126  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2505  ABC transporter related protein  37.25 
 
 
607 aa  449  1e-125  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152219  normal  0.502097 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1250  ABC transporter related  36.23 
 
 
610 aa  442  1e-122  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3416  ABC transporter-related protein  38.51 
 
 
602 aa  441  1e-122  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2613  ABC transporter, transmembrane region  37.1 
 
 
625 aa  436  1e-121  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.200186  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0443  ABC transporter related  39.48 
 
 
588 aa  436  1e-121  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  2.01252e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0801  ABC transporter-like protein  33.81 
 
 
635 aa  432  1e-120  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.678319 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0101  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  39.01 
 
 
592 aa  433  1e-120  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0648  ABC transporter related  38.85 
 
 
623 aa  434  1e-120  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.986523 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0160  ABC transporter related  36.62 
 
 
616 aa  433  1e-120  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  37.56 
 
 
617 aa  429  1e-119  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  38.95 
 
 
614 aa  427  1e-118  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  39.14 
 
 
608 aa  419  1e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0048  ABC transporter related  36.71 
 
 
598 aa  414  1e-114  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000163685  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.8 
 
 
589 aa  414  1e-114  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3376  ABC transporter related  38.84 
 
 
610 aa  399  1e-110  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19280  ABC transporter related  35.58 
 
 
609 aa  400  1e-110  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1245  ABC transporter related  37.33 
 
 
594 aa  401  1e-110  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00497584  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3786  ABC transporter  37.24 
 
 
587 aa  400  1e-110  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.469191  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2332  ABC transporter-related protein  37.24 
 
 
587 aa  402  1e-110  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000229781  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3695  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.41 
 
 
587 aa  396  1e-109  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.06018e-05 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3067  ABC transporter related  35.25 
 
 
621 aa  397  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.134342  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3384  ABC transporter, ATP-binding protein  37.41 
 
 
587 aa  396  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.603869  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3740  ABC transporter permease/ATP-binding protein  37.41 
 
 
587 aa  396  1e-109  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.037622  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3466  ABC transporter ATP-binding/permease  37.41 
 
 
587 aa  396  1e-109  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.197712  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1528  ABC transporter, transmembrane region  36.9 
 
 
587 aa  396  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00299054  normal  0.0159788 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2726  ABC transporter related  38.84 
 
 
610 aa  398  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3432  ABC transporter, ATP-binding protein  37.41 
 
 
587 aa  396  1e-109  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.47455e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0673  ABC transporter related  41.38 
 
 
650 aa  396  1e-109  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2306  ABC transporter related  38.61 
 
 
610 aa  393  1e-108  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.306403 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1385  ABC transporter related  41.87 
 
 
622 aa  392  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1390  ABC transporter related  35.49 
 
 
602 aa  393  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.838756  normal  0.671981 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3719  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.07 
 
 
587 aa  392  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  34.94 
 
 
597 aa  394  1e-108  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2282  ABC transporter related  35.74 
 
 
609 aa  394  1e-108  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3813  ABC transporter related protein  37.52 
 
 
642 aa  391  1e-107  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.206928  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3714  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.07 
 
 
587 aa  390  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.207401  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3365  ABC transporter related  38.83 
 
 
587 aa  390  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000714306  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0017  ABC transporter related  36.06 
 
 
593 aa  389  1e-107  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1359  ABC transporter related  37.2 
 
 
608 aa  389  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1540  multidrug ABC transporter ATPase/permease  36.88 
 
 
602 aa  391  1e-107  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.652681  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2932  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.33 
 
 
598 aa  386  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00230756 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3782  ABC transporter related  36.04 
 
 
594 aa  387  1e-106  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.91836  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2539  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.15 
 
 
598 aa  386  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2401  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.33 
 
 
598 aa  387  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  35.63 
 
 
597 aa  385  1e-106  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  35.63 
 
 
597 aa  385  1e-105  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2475  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.98 
 
 
598 aa  384  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00961334  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0282  ABC transporter related protein  37.16 
 
 
600 aa  383  1e-105  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  36.61 
 
 
598 aa  383  1e-105  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1430  ABC transporter related  36.82 
 
 
592 aa  385  1e-105  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1382  ABC transporter related  33.91 
 
 
578 aa  382  1e-104  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.372914  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1656  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37 
 
 
581 aa  381  1e-104  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2193  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  37.15 
 
 
598 aa  379  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0325354  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2236  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  37.15 
 
 
598 aa  380  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0563945  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2250  ABC transporter related  37.33 
 
 
598 aa  380  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0582239  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2460  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.98 
 
 
598 aa  379  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0880  ABC transporter related  35.26 
 
 
579 aa  375  1e-103  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  1.84481e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2276  ABC transporter ATP-binding/permease  36.98 
 
 
598 aa  379  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.406907  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  35.15 
 
 
587 aa  377  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1937  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.41 
 
 
599 aa  379  1e-103  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0902  ABC transporter related  35.26 
 
 
579 aa  375  1e-103  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00896089  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0782  ATPase  38.1 
 
 
598 aa  378  1e-103  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.461775 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0841  ABC transporter related  36.54 
 
 
607 aa  377  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2444  ABC transporter permease/ATP-binding protein  36.98 
 
 
598 aa  379  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.290529  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2254  ABC transporter related  35.16 
 
 
592 aa  373  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  39.45 
 
 
575 aa  373  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  2.15819e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3872  ABC transporter related  33.97 
 
 
585 aa  373  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2719  ABC transporter related  36.46 
 
 
606 aa  372  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2921  ABC transporter related protein  34.49 
 
 
636 aa  374  1e-102  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  35.44 
 
 
579 aa  374  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1249  ABC transporter, ATP-binding protein  35.27 
 
 
598 aa  374  1e-102  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159778 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3035  ABC transporter-like protein protein  37.72 
 
 
626 aa  371  1e-101  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0118  ABC transporter related  37.75 
 
 
645 aa  369  1e-101  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00403697  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1942  ABC transporter, transmembrane region  33.84 
 
 
594 aa  370  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  36.28 
 
 
578 aa  370  1e-101  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>