More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0881 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_0881  ribosomal protein S9  100 
 
 
129 aa  258  1e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3496  30S ribosomal protein S9  58.87 
 
 
128 aa  144  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000030471  normal  0.91876 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0722  30S ribosomal protein S9  58.06 
 
 
128 aa  144  4.0000000000000006e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4742  ribosomal protein S9  57.26 
 
 
128 aa  144  5e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000000153745  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0051  30S ribosomal protein S9  55.65 
 
 
128 aa  144  5e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1611  30S ribosomal protein S9  58.2 
 
 
128 aa  143  6e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0149645  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0111  ribosomal protein S9  56.45 
 
 
128 aa  143  7.0000000000000006e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000221009  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04080  30S ribosomal protein S9  57.38 
 
 
128 aa  137  4.999999999999999e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3038  30S ribosomal protein S9  58.06 
 
 
128 aa  137  6e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0109364  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3517  30S ribosomal protein S9  55.38 
 
 
130 aa  133  9e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.143376  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3371  30S ribosomal protein S9  55.38 
 
 
130 aa  133  9e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0767368  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3453  30S ribosomal protein S9  55.38 
 
 
130 aa  133  9e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0006  ribosomal protein S9  51.59 
 
 
133 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.819912  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0870  ribosomal protein S9  52.71 
 
 
167 aa  128  3e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0902  30S ribosomal protein S9  54.55 
 
 
130 aa  127  6e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000079624  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2151  30S ribosomal protein S9  51.24 
 
 
158 aa  125  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.45731  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3436  30S ribosomal protein S9  51.54 
 
 
131 aa  126  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.113849  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2970  30S ribosomal protein S9  51.49 
 
 
159 aa  126  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0570988  normal  0.349655 
 
 
-
 
NC_002950  PG0376  30S ribosomal protein S9  55.65 
 
 
128 aa  125  2.0000000000000002e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0423  30S ribosomal protein S9  49.61 
 
 
129 aa  123  7e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00762488  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0230  SSU ribosomal protein S9P  55.37 
 
 
132 aa  122  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000443747  normal  0.670048 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1798  30S ribosomal protein S9  52.89 
 
 
130 aa  121  3e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3627  30S ribosomal protein S9  52.07 
 
 
130 aa  121  3e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000023775  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2285  30S ribosomal protein S9  52.89 
 
 
130 aa  121  4e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000447741  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2244  30S ribosomal protein S9  52.89 
 
 
130 aa  121  4e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000238567  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2175  30S ribosomal protein S9  53.72 
 
 
160 aa  120  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0915323  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0021  30S ribosomal protein S9  53.72 
 
 
160 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.849835  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1650  30S ribosomal protein S9  53.72 
 
 
160 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.377487 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2249  30S ribosomal protein S9  52.07 
 
 
163 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0221  30S ribosomal protein S9  49.26 
 
 
135 aa  119  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0143774  normal  0.010853 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2069  30S ribosomal protein S9  52.07 
 
 
130 aa  119  9.999999999999999e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000831765  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2608  30S ribosomal protein S9  52.07 
 
 
130 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0410125  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4611  30S ribosomal protein S9  50.41 
 
 
162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0520803 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004510  SSU ribosomal protein S9p (S16e)  51.56 
 
 
130 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000229051  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0149  30S ribosomal protein S9  51.24 
 
 
162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0212  ribosomal protein S9  52 
 
 
131 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000467508  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1513  SSU ribosomal protein S9P  52.07 
 
 
165 aa  118  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.472306 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3285  30S ribosomal protein S9  51.24 
 
 
180 aa  118  3e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2678  30S ribosomal protein S9  52.07 
 
 
130 aa  118  3e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000125135  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2363  30S ribosomal protein S9  52.07 
 
 
130 aa  118  3e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000350135  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0790  30S ribosomal protein S9  51.24 
 
 
158 aa  117  3.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.552498  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0454  30S ribosomal protein S9  54.55 
 
 
130 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0255963  normal  0.796217 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1527  ribosomal protein S9  54.55 
 
 
132 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000273794  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0786  30S ribosomal protein S9  51.24 
 
 
158 aa  117  3.9999999999999996e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.637937  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2496  30S ribosomal protein S9  51.24 
 
 
158 aa  117  3.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0224  30S ribosomal protein S9  48.53 
 
 
135 aa  117  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0402  30S ribosomal protein S9  48.84 
 
 
129 aa  117  4.9999999999999996e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.248058  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1476  30S ribosomal protein S9  51.24 
 
 
166 aa  117  4.9999999999999996e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.270542 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1235  ribosomal protein S9  45.97 
 
 
131 aa  117  4.9999999999999996e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.026641  normal  0.24615 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0331  ribosomal protein S9  51.24 
 
 
130 aa  117  6e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00016739  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0797  30S ribosomal protein S9  51.94 
 
 
128 aa  116  9e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000494469  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1686  ribosomal protein S9  48.46 
 
 
161 aa  116  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1748  30S ribosomal protein S9  50.39 
 
 
128 aa  116  9.999999999999999e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00000973218  normal  0.252579 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1163  30S ribosomal protein S9  48.76 
 
 
160 aa  116  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.456788  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0321  30S ribosomal protein S9  52.89 
 
 
130 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000288169  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44376  Putative mitochondrial ribosomal protein S9  50.41 
 
 
137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.272268  normal  0.0615746 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2620  30S ribosomal protein S9  48.76 
 
 
161 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.159482 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2843  30S ribosomal protein S9  48.76 
 
 
161 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00882  30S ribosomal protein S9  50 
 
 
130 aa  115  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1566  30S ribosomal protein S9  49.61 
 
 
128 aa  115  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000968491  normal  0.322438 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1031  30S ribosomal protein S9  52.38 
 
 
132 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.791116  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2663  30S ribosomal protein S9  49.22 
 
 
130 aa  115  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00134428  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0734  30S ribosomal protein S9  47.93 
 
 
130 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144699  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1782  30S ribosomal protein S9  52.07 
 
 
130 aa  115  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000024243  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0128  30S ribosomal protein S9  49.22 
 
 
130 aa  115  1.9999999999999998e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000606121  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0247  SSU ribosomal protein S9P  50 
 
 
130 aa  115  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00762963  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2011  30S ribosomal protein S9  48.06 
 
 
129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00763906  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0342  30S ribosomal protein S9  48.76 
 
 
136 aa  115  3e-25  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00140539  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0323  30S ribosomal protein S9  48.76 
 
 
131 aa  114  3e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000255899  hitchhiker  5.84326e-17 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0725  30S ribosomal protein S9  50 
 
 
130 aa  115  3e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.616344  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20520  SSU ribosomal protein S9P  49.59 
 
 
171 aa  114  3.9999999999999997e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.476775  normal  0.598664 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02470  ribosomal protein S9  50.78 
 
 
131 aa  114  3.9999999999999997e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000158686  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3293  30S ribosomal protein S9  52.07 
 
 
130 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000148641  hitchhiker  0.00108393 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3702  ribosomal protein S9  50.41 
 
 
130 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000244977  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01520  ribosomal protein S9  50.78 
 
 
131 aa  114  3.9999999999999997e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000216085  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3731  30S ribosomal protein S9  51.22 
 
 
137 aa  114  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2425  30S ribosomal protein S9  47.76 
 
 
164 aa  114  5e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.149157  normal  0.160414 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0104  30S ribosomal protein S9  49.22 
 
 
130 aa  114  5e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000569691  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04450  SSU ribosomal protein S9P  48.39 
 
 
162 aa  114  5e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.271227 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2650  30S ribosomal protein S9  48.76 
 
 
161 aa  114  6e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.550147  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1470  30S ribosomal protein S9  47.29 
 
 
171 aa  114  6e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.828818 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1601  30S ribosomal protein S9  50.41 
 
 
164 aa  114  6e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.292372  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0905  ribosomal protein S9  51.24 
 
 
130 aa  113  6.9999999999999995e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.122737  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0215  30S ribosomal protein S9  48.44 
 
 
130 aa  113  6.9999999999999995e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00249156  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0342  SSU ribosomal protein S9P  51.24 
 
 
170 aa  113  6.9999999999999995e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0651444  hitchhiker  0.00386337 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0724  30S ribosomal protein S9  50.41 
 
 
130 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00489418  hitchhiker  0.0000321207 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3939  30S ribosomal protein S9  50.41 
 
 
130 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0745  30S ribosomal protein S9  50.41 
 
 
130 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000051972  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0733  30S ribosomal protein S9  50.41 
 
 
130 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000589004  hitchhiker  0.00344758 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3651  30S ribosomal protein S9  50.41 
 
 
130 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456747  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0703  30S ribosomal protein S9  50.41 
 
 
130 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000775692  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3268  30S ribosomal protein S9  50.41 
 
 
130 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000222713  hitchhiker  0.0000090404 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0679  30S ribosomal protein S9  50.41 
 
 
130 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000564509  hitchhiker  0.00025421 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0693  30S ribosomal protein S9  50.41 
 
 
130 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000579549  decreased coverage  0.00000193008 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2679  ribosomal protein S9  51.59 
 
 
130 aa  112  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0151101  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1379  30S ribosomal protein S9  49.59 
 
 
159 aa  112  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0851685 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1735  30S ribosomal protein S9  50.41 
 
 
131 aa  112  1.0000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0401133 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2120  SSU ribosomal protein S9P  52.89 
 
 
130 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.39803  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0853  30S ribosomal protein S9  51.24 
 
 
124 aa  112  2.0000000000000002e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000119355  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3107  30S ribosomal protein S9  48.76 
 
 
160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.966484  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>