More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3805 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_1299  hydrogenase, Fe-only  60.52 
 
 		 579 aa  740    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.130328  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2467  hydrogenase, Fe-only  55.19 
 
 		 574 aa  651    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0342  hydrogenase, Fe-only  60.73 
 
 		 582 aa  756    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2138  hydrogenase, Fe-only  56.38 
 
 		 581 aa  708    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000865974  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06330  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 75 kDa subunit  55.21 
 
 		 578 aa  638    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00021405  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1717  Iron hydrogenase, small subunit  57.27 
 
 		 573 aa  655    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.118526  normal  0.410336 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0172  hydrogenase, Fe-only  57.69 
 
 		 573 aa  661    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2232  hydrogenase, Fe-only  59.52 
 
 		 582 aa  729    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3805  hydrogenase, Fe-only  100 
 
 		 582 aa  1202    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1783  hydrogenase, Fe-only  54.06 
 
 		 583 aa  632  1e-180  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0844  hydrogenases, Fe-only  54.3 
 
 		 576 aa  628  1e-178  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1651  hydrogenases, Fe-only  54.97 
 
 		 593 aa  620  1e-176  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.556328  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1781  hydrogenase, Fe-only  52.68 
 
 		 578 aa  617  1e-175  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0152  hydrogenase, Fe-only  53.1 
 
 		 580 aa  601  1e-170  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1337  hydrogenase, Fe-only  50.59 
 
 		 590 aa  593  1e-168  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3829  hydrogenase, Fe-only  50.86 
 
 		 625 aa  594  1e-168  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0150  hydrogenase, Fe-only  52.29 
 
 		 585 aa  586  1e-166  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_155  [Fe] hydrogenase, Hym C subunit  49.22 
 
 		 573 aa  582  1.0000000000000001e-165  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1633  NAD-reducing iron-only hydrogenase large subunit  52.54 
 
 		 585 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000469619  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0224  hydrogenase, Fe-only  49.05 
 
 		 573 aa  579  1e-164  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0147  [Fe] hydrogenase, large subunit HymC, putative  49.05 
 
 		 573 aa  577  1.0000000000000001e-163  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1605  NAD-reducing iron-only hydrogenase large subunit  51.36 
 
 		 585 aa  578  1.0000000000000001e-163  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1149  hydrogenase, Fe-only  49.14 
 
 		 569 aa  567  1e-160  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000253121  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1017  iron hydrogenase, small subunit  50.87 
 
 		 574 aa  563  1.0000000000000001e-159  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1085  hydrogenase, Fe-only  48.7 
 
 		 577 aa  559  1e-158  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0625  hydrogenase, Fe-only  48.63 
 
 		 587 aa  557  1e-157  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000144729  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1548  hydrogenase, Fe-only  52.08 
 
 		 615 aa  558  1e-157  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0723  hydrogenase, Fe-only  50.43 
 
 		 578 aa  552  1e-156  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02980  NADH dehydrogenase I subunit G  49.57 
 
 		 570 aa  552  1e-156  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3290  hydrogenases, Fe-only  46.58 
 
 		 594 aa  551  1e-155  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3601  hydrogenase, Fe-only  48.12 
 
 		 587 aa  544  1e-153  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0723  hydrogenase, Fe-only  48.38 
 
 		 582 aa  539  9.999999999999999e-153  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0747  hydrogenase, Fe-only  48.21 
 
 		 582 aa  535  1e-151  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01810  NADH dehydrogenase I subunit G  49.22 
 
 		 666 aa  531  1e-149  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000616939  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1544  hydrogenase, Fe-only  47.61 
 
 		 581 aa  524  1e-147  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1601  hydrogenase, Fe-only  46 
 
 		 582 aa  518  1.0000000000000001e-145  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2502  iron-containing hydrogenase, Hyd gamma  47.15 
 
 		 598 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0236  hydrogenase, Fe-only  46.31 
 
 		 586 aa  512  1e-144  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.660897  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0533  hydrogenase, Fe-only  45.99 
 
 		 582 aa  503  1e-141  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0310904  normal  0.240554 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2655  iron hydrogenase  44.76 
 
 		 572 aa  495  1e-139  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2341  iron hydrogenase  43.88 
 
 		 572 aa  492  9.999999999999999e-139  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1384  hydrogenases, Fe-only  44.69 
 
 		 606 aa  492  1e-137  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0137  hydrogenase, Fe-only  43.52 
 
 		 619 aa  487  1e-136  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2436  (Fe) hydrogenase, large subunit HymC, putative  45.45 
 
 		 563 aa  488  1e-136  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000128912  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2303  hydrogenase, Fe-only  43.19 
 
 		 562 aa  474  1e-132  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1593  Fe-hydrogenase  44.31 
 
 		 596 aa  474  1e-132  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2159  hydrogenase, Fe-only  44.75 
 
 		 582 aa  472  1e-132  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1490  hydrogenases, Fe-only  41 
 
 		 601 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1654  hydrogenases, Fe-only  45.68 
 
 		 659 aa  465  1e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.357121  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0087  hydrogenase, Fe-only  41.61 
 
 		 567 aa  450  1e-125  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4621  hydrogenase, Fe-only  49.57 
 
 		 527 aa  451  1e-125  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0290  hydrogenase, Fe-only  49.04 
 
 		 549 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.199872  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0430  hydrogenase, Fe-only  41.25 
 
 		 566 aa  443  1e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.735126  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0463  hydrogenases, Fe-only  48.92 
 
 		 520 aa  436  1e-121  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0157  hydrogenase, Fe-only  50.11 
 
 		 523 aa  435  1e-120  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.434937  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16530  hydrogenase, Fe-only  41.87 
 
 		 569 aa  433  1e-120  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.143158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0225  hydrogenase, Fe-only  40.9 
 
 		 667 aa  435  1e-120  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0168  hydrogenase, Fe-only  50.11 
 
 		 513 aa  421  1e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.191335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0490  hydrogenase large subunit  41.35 
 
 		 653 aa  418  9.999999999999999e-116  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1367  hydrogenase large subunit  41.76 
 
 		 645 aa  403  1e-111  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1319  hydrogenase large subunit  41.76 
 
 		 645 aa  402  9.999999999999999e-111  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0560  hydrogenase, Fe-only  39.04 
 
 		 666 aa  396  1e-109  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00291892  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3003  hydrogenase, Fe-only  41.94 
 
 		 644 aa  376  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1076  [Fe] hydrogenase  44.32 
 
 		 696 aa  367  1e-100  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.723256  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0475  ferredoxin hydrogenase  43.36 
 
 		 458 aa  365  1e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1925  ferredoxin hydrogenase  49.35 
 
 		 387 aa  361  2e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2037  hydrogenase, Fe-only  41.27 
 
 		 1150 aa  358  1.9999999999999998e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163812  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0938  periplasmic [Fe] hydrogenase 1  43.65 
 
 		 696 aa  353  7e-96  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0625857  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2281  ferredoxin hydrogenase  48.82 
 
 		 439 aa  347  4e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1883  ferredoxin hydrogenase  39.57 
 
 		 460 aa  336  5.999999999999999e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0848  hydrogenases, Fe-only  46.15 
 
 		 417 aa  317  3e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2056  hydrogenase, Fe-only  42.14 
 
 		 644 aa  316  7e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000410653  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1386  hydrogenases, Fe-only  45.97 
 
 		 421 aa  309  6.999999999999999e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.999103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0081  ferredoxin hydrogenase  47.2 
 
 		 421 aa  307  3e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1503  hydrogenase, Fe-only  46.03 
 
 		 418 aa  304  3.0000000000000004e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.349556  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0711  response regulator receiver protein  40.93 
 
 		 410 aa  282  1e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.312278  hitchhiker  0.0000873565 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3250  hydrogenases, Fe-only  40.93 
 
 		 410 aa  281  2e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.644479  hitchhiker  0.0000163586 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3920  periplasmic Fe hydrogenase, large subunit  40.44 
 
 		 410 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3504  ferredoxin  48.08 
 
 		 312 aa  207  6e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1831  NADH dehydrogenase I chain G  48.1 
 
 		 363 aa  200  5e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1398  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.54 
 
 		 893 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0310  ferredoxin hydrogenase  30.41 
 
 		 462 aa  196  7e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3503  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.29 
 
 		 900 aa  196  1e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3507  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.71 
 
 		 893 aa  195  2e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0156  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.89 
 
 		 898 aa  195  2e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1888  ferredoxin  44.76 
 
 		 307 aa  194  6e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1856  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  45.71 
 
 		 351 aa  193  8e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0100  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.38 
 
 		 893 aa  188  2e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000102152  hitchhiker  0.000000000000206048 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0334  NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit G, iron-sulphur binding protein  46.19 
 
 		 826 aa  185  2.0000000000000003e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33837  predicted protein  32.94 
 
 		 473 aa  185  2.0000000000000003e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.40604 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1029  NADH dehydrogenase I chain G  45.89 
 
 		 358 aa  184  3e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3777  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulphur binding, conserved site  41.78 
 
 		 310 aa  184  6e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000710786  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0704  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.58 
 
 		 900 aa  179  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0835  anaerobic dehydrogenase  43.81 
 
 		 305 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25280  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.31 
 
 		 911 aa  172  1e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0556633 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4051  bidirectional hydrogenase complex protein HoxU  40 
 
 		 238 aa  170  8e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0848168 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3520  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.39 
 
 		 904 aa  169  1e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0785  NADH dehydrogenase I chain G  41.55 
 
 		 353 aa  168  2e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4113  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.52 
 
 		 901 aa  167  4e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.163208  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0720  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.85 
 
 		 949 aa  166  9e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>