More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1684 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1684  SufS subfamily cysteine desulfurase  100 
 
 		 444 aa  921    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0488  cysteine desulfurase, SufS subfamily  64.6 
 
 		 774 aa  568  1e-161  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21000  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  63.61 
 
 		 604 aa  566  1e-160  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.382512  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16690  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  63.61 
 
 		 604 aa  567  1e-160  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1815  selenocysteine lyase  65.1 
 
 		 665 aa  565  1e-160  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.653401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2493  SufS subfamily cysteine desulfurase  64.09 
 
 		 605 aa  560  1e-158  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1608  cysteine desulfurase, SufS subfamily  64.18 
 
 		 657 aa  555  1e-157  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2661  cysteine desulfurase  62.59 
 
 		 626 aa  556  1e-157  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0591977  normal  0.463261 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0617  SufS subfamily cysteine desulfurase  63.09 
 
 		 621 aa  555  1e-157  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000358817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3227  SufS subfamily cysteine desulfurase  64.66 
 
 		 662 aa  556  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.545837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1552  cysteine desulphurases, SufS  61.07 
 
 		 682 aa  553  1e-156  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0124  cysteine desulphurases, SufS  61.44 
 
 		 688 aa  549  1e-155  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4655  SufS subfamily cysteine desulfurase  63.66 
 
 		 644 aa  549  1e-155  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00370812  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0023  putative cysteine desulfurase  62.16 
 
 		 661 aa  545  1e-154  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.493291 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5682  cysteine desulfurase, SufS subfamily  63.66 
 
 		 560 aa  544  1e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.305949 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0543  SufS subfamily cysteine desulfurase  61.73 
 
 		 679 aa  542  1e-153  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.266344 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1232  SufS subfamily cysteine desulfurase  62.2 
 
 		 629 aa  541  1e-153  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.153291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2622  cysteine desulphurases, SufS  60.45 
 
 		 666 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.795615 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3637  SufS subfamily cysteine desulfurase  61.44 
 
 		 678 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.51832  normal  0.140258 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5792  SufS subfamily cysteine desulfurase  61.14 
 
 		 641 aa  540  9.999999999999999e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0152868 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3517  SufS subfamily cysteine desulfurase  60.45 
 
 		 650 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1894  cysteine desulfurase, SufS subfamily  61.9 
 
 		 630 aa  541  9.999999999999999e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4001  SufS subfamily cysteine desulfurase  59.95 
 
 		 666 aa  536  1e-151  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.077192 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2039  cysteine desulfurase, SufS subfamily  62.41 
 
 		 610 aa  531  1e-150  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1407  putative cysteine desulfurase  60.95 
 
 		 660 aa  519  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0933  putative cysteine desulfurase  60.95 
 
 		 671 aa  519  1e-146  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0448  putative cysteine desulfurase  60.95 
 
 		 660 aa  519  1e-146  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0199  putative cysteine desulfurase  60.95 
 
 		 660 aa  519  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.75031  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1818  SufS family cysteine desulfurase  60.45 
 
 		 660 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.295345  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1904  cysteine desulphurases, SufS  60.7 
 
 		 660 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.256271  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0362  selenocysteine lyase  60.45 
 
 		 685 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.556152  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0754  SufS subfamily cysteine desulfurase  59.9 
 
 		 608 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.633954 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5203  cysteine desulfurase, SufS subfamily  59.4 
 
 		 941 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1549  cysteine desulfurase, SufS subfamily  58.37 
 
 		 673 aa  508  1e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0186902 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  56.75 
 
 		 420 aa  507  9.999999999999999e-143  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1338  cysteine desulfurase, SufS subfamily  57.35 
 
 		 674 aa  502  1e-141  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.986463 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  57.86 
 
 		 672 aa  502  1e-141  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0228689 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1427  SufS subfamily cysteine desulfurase  57.88 
 
 		 664 aa  504  1e-141  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000769952 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0989  selenocysteine lyase  52.58 
 
 		 414 aa  478  1e-134  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4272  SufS subfamily cysteine desulfurase  54.5 
 
 		 451 aa  478  1e-134  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5780  cysteine desulfurase, SufS subfamily  55.14 
 
 		 408 aa  477  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.649929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  53.1 
 
 		 418 aa  473  1e-132  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1505  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  52.23 
 
 		 425 aa  466  9.999999999999999e-131  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0740826  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.26 
 
 		 429 aa  461  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0166  cysteine desulfurase, SufS subfamily  52.62 
 
 		 412 aa  458  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000385676  unclonable  0.00000000000000152095 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.39 
 
 		 429 aa  457  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0582  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.89 
 
 		 404 aa  456  1e-127  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0897789  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.39 
 
 		 429 aa  456  1e-127  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3037  cysteine desulfurase, SufS subfamily  53.16 
 
 		 404 aa  457  1e-127  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0138624 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  54.11 
 
 		 404 aa  455  1e-127  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0975  aminotransferase class 5 protein; selenocysteine lyase  51.87 
 
 		 419 aa  452  1.0000000000000001e-126  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.18075  normal  0.925491 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3352  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.73 
 
 		 415 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.143815 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3281  cysteine desulfurase, SufS subfamily  52.01 
 
 		 429 aa  451  1e-125  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30955  normal  0.0478783 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1512  cysteine desulfurase SufS  50.38 
 
 		 405 aa  450  1e-125  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1445  cysteine desulfurase  50.38 
 
 		 405 aa  451  1e-125  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0655  hypothetical protein  51.72 
 
 		 414 aa  446  1.0000000000000001e-124  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0639  hypothetical protein  51.72 
 
 		 414 aa  446  1.0000000000000001e-124  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0699  SufS subfamily cysteine desulfurase  53.42 
 
 		 419 aa  444  1e-123  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.74 
 
 		 406 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5928  cysteine desulfurase  49.63 
 
 		 413 aa  439  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2990  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.88 
 
 		 428 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.398941  normal  0.104458 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1863  SufS subfamily cysteine desulfurase  54.45 
 
 		 416 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3154  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.87 
 
 		 417 aa  438  9.999999999999999e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1236  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.87 
 
 		 413 aa  437  1e-121  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321654  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3969  cysteine desulfurase  51.38 
 
 		 415 aa  436  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0413583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.5 
 
 		 406 aa  437  1e-121  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3259  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.5 
 
 		 414 aa  435  1e-121  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.797453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2570  cysteine desulfurase  49.13 
 
 		 422 aa  432  1e-120  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1417  cysteine desulfurase  52.23 
 
 		 417 aa  433  1e-120  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2459  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.63 
 
 		 415 aa  434  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.117109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2325  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.13 
 
 		 414 aa  432  1e-120  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.553712  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2745  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.37 
 
 		 415 aa  434  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0995  hypothetical protein  51.77 
 
 		 412 aa  434  1e-120  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.20271 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0906  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.62 
 
 		 425 aa  428  1e-119  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.601083 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2252  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.75 
 
 		 414 aa  429  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.4 
 
 		 427 aa  431  1e-119  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0429  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.63 
 
 		 419 aa  431  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2103  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.63 
 
 		 413 aa  430  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.105912 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04465  selenocysteine lyase  50.75 
 
 		 412 aa  428  1e-119  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.13 
 
 		 413 aa  430  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00682669 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0101  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.75 
 
 		 414 aa  431  1e-119  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.724967 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0418  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.63 
 
 		 419 aa  430  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0536  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.93 
 
 		 416 aa  429  1e-119  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0735  aminotransferase, class V  48.88 
 
 		 404 aa  428  1e-118  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5118  aminotransferase, class V  49.01 
 
 		 406 aa  426  1e-118  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4849  aminotransferase, class V  49.01 
 
 		 406 aa  426  1e-118  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4705  aminotransferase, class V, cysteine desulfhydrase  49.01 
 
 		 406 aa  426  1e-118  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1661  cysteine desulphurases, SufS  50.63 
 
 		 414 aa  428  1e-118  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.278494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0427  cysteine desulphurases, SufS  50.75 
 
 		 420 aa  426  1e-118  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.21345  normal  0.0671623 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4466  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.36 
 
 		 419 aa  426  1e-118  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.523936 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3577  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.01 
 
 		 406 aa  427  1e-118  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5121  cysteine desulfurase SufS  49.01 
 
 		 406 aa  426  1e-118  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0728  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.13 
 
 		 421 aa  426  1e-118  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.88575  normal  0.887973 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1962  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.5 
 
 		 406 aa  422  1e-117  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00108569  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01639  hypothetical protein  50.62 
 
 		 406 aa  423  1e-117  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000164024  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1951  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  50.62 
 
 		 406 aa  423  1e-117  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00128399  unclonable  0.0000000107568 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2837  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.38 
 
 		 415 aa  421  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00234776  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0799  cysteine desulfurase  50 
 
 		 423 aa  423  1e-117  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.635677  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1505  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  50.62 
 
 		 406 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000304018 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2183  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.37 
 
 		 406 aa  422  1e-117  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000179204  hitchhiker  0.0000283455 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>