54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1512 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1512  rhomboid family protein  100 
 
 		 191 aa  376  1e-104  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353415  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0259  rhomboid-like protein  56.74 
 
 		 194 aa  188  5e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000169722  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0124  rhomboid family protein  29.33 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1301  rhomboid family protein  28.29 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0042  rhomboid family protein  27.85 
 
 		 396 aa  51.6  0.000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740017  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3769  Rhomboid family protein  28.67 
 
 		 203 aa  51.2  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0472391 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1860  Rhomboid family protein  27.32 
 
 		 519 aa  50.1  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000892671  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3276  Rhomboid family protein  24.88 
 
 		 430 aa  48.9  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1367  Rhomboid family protein  28.47 
 
 		 205 aa  48.5  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.870184  normal  0.274757 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1071  rhomboid family protein  25.84 
 
 		 279 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.254711 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0937  rhomboid family protein  27.42 
 
 		 202 aa  47.8  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1705  rhomboid family protein  30.5 
 
 		 342 aa  46.6  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.745116  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0044  Rhomboid family protein  29.5 
 
 		 356 aa  46.6  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4639  intramembrane serine protease GlpG  26.39 
 
 		 278 aa  46.6  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0460  rhomboid-like protein  26.32 
 
 		 204 aa  46.2  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0322234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1438  rhomboid family protein  30.5 
 
 		 342 aa  46.2  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3861  putative intramembrane serine protease  25.9 
 
 		 554 aa  46.2  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4732  intramembrane serine protease GlpG  28.32 
 
 		 276 aa  45.4  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03227  hypothetical protein  28.32 
 
 		 276 aa  45.4  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3806  intramembrane serine protease GlpG  28.32 
 
 		 276 aa  45.4  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3704  intramembrane serine protease GlpG  28.32 
 
 		 276 aa  45.4  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.144478 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03275  predicted intramembrane serine protease  28.32 
 
 		 276 aa  45.4  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.989873  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0290  intramembrane serine protease GlpG  28.32 
 
 		 276 aa  45.4  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3621  intramembrane serine protease GlpG  28.32 
 
 		 276 aa  45.4  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0290  Rhomboid family protein  28.32 
 
 		 276 aa  45.4  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3900  intramembrane serine protease GlpG  28.32 
 
 		 276 aa  45.4  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002143  protein GlpG  25.38 
 
 		 280 aa  44.7  0.0008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00412305  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0221  rhomboid-like protein  24.72 
 
 		 190 aa  44.7  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0260  rhomboid family protein  24.72 
 
 		 190 aa  44.7  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1663  integral membrane protein  31.2 
 
 		 220 aa  44.7  0.0009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.771185  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0312  rhomboid family protein  28.67 
 
 		 206 aa  44.3  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000705799  hitchhiker  0.00414604 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4123  intramembrane serine protease GlpG  23.71 
 
 		 277 aa  44.3  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0235  rhomboid family protein  28.88 
 
 		 186 aa  43.5  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05680  peptidase, S54 (rhomboid) family, putative  25.35 
 
 		 232 aa  43.5  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.811656  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3791  intramembrane serine protease GlpG  29.63 
 
 		 274 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.666891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3832  intramembrane serine protease GlpG  29.63 
 
 		 276 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.555662 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3716  intramembrane serine protease GlpG  29.63 
 
 		 276 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3725  intramembrane serine protease GlpG  29.63 
 
 		 274 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3894  intramembrane serine protease GlpG  29.63 
 
 		 276 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.478877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0674  membrane-associated serine protease  23.59 
 
 		 227 aa  43.5  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.263581  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1609  rhomboid family protein  28.46 
 
 		 220 aa  43.5  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2417  glpG protein  23.95 
 
 		 277 aa  43.1  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140187  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1088  Rhomboid family protein  24.82 
 
 		 205 aa  43.1  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3930  intramembrane serine protease GlpG  23.71 
 
 		 277 aa  43.5  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0223  rhomboid-like protein  24.16 
 
 		 190 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0919  membrane-associated serine protease  27.81 
 
 		 236 aa  42.7  0.003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.473127  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0235  rhomboid family protein  23.6 
 
 		 190 aa  43.1  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3784  rhomboid family protein  27.21 
 
 		 283 aa  42.7  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0327167 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1387  hypothetical protein  26.67 
 
 		 202 aa  43.1  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0256989  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0249  rhomboid family protein  23.6 
 
 		 190 aa  43.1  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1317  rhomboid family protein  24.22 
 
 		 202 aa  42.7  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.175415  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4037  Rhomboid family protein  26.92 
 
 		 256 aa  42.7  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.6253 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26597  predicted protein  23.23 
 
 		 228 aa  42.7  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0296389  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2381  Rhomboid family protein  29.17 
 
 		 389 aa  42  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>