More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0617 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0617  signal transduction histidine kinase, LytS  100 
 
 		 601 aa  1216    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000118268  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2372  histidine kinase internal region  31.6 
 
 		 595 aa  216  9.999999999999999e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2008  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.51 
 
 		 585 aa  136  9.999999999999999e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3886  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.52 
 
 		 580 aa  134  3.9999999999999996e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000303887  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1983  putative sensor with HAMP domain  34.23 
 
 		 597 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.24245  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0495  histidine kinase internal region  29.08 
 
 		 604 aa  131  3e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0199  putative sensor with HAMP domain  27.08 
 
 		 589 aa  127  6e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2114  putative sensor with HAMP domain  29.63 
 
 		 627 aa  127  6e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.28006  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0398  histidine kinase internal region  23.89 
 
 		 567 aa  127  6e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2405  sensor histidine kinase  26.58 
 
 		 512 aa  126  1e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1959  histidine kinase  33.96 
 
 		 414 aa  126  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2252  histidine kinase internal region  32.76 
 
 		 569 aa  126  1e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2698  histidine kinase internal region  31.43 
 
 		 576 aa  123  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2056  putative sensor with HAMP domain  33.49 
 
 		 587 aa  121  3.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0945  histidine kinase  30.74 
 
 		 600 aa  120  9e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1339  signal transduction histidine kinase, LytS  32.55 
 
 		 426 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0214  histidine kinase internal region  31.25 
 
 		 518 aa  118  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0208  histidine kinase internal region  31.25 
 
 		 518 aa  118  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3543  signal transduction histidine kinase, LytS  33.94 
 
 		 403 aa  117  5e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00838652  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0578  histidine kinase internal region  31.75 
 
 		 604 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1137  putative sensor with HAMP domain  32.27 
 
 		 597 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0468  signal transduction histidine kinase, LytS  33.96 
 
 		 450 aa  114  6e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5622  sensor histidine kinase LytS  35.22 
 
 		 589 aa  114  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19850  histidine kinase internal region  31.38 
 
 		 595 aa  114  7.000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5574  sensor histidine kinase LytS  35.22 
 
 		 589 aa  113  9e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10410  signal transduction histidine kinase, LytS  29.84 
 
 		 578 aa  113  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000014237  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2122  histidine kinase internal region  29.93 
 
 		 516 aa  113  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190674  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5296  sensor histidine kinase LytS  34.78 
 
 		 589 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5123  sensor histidine kinase  34.78 
 
 		 589 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5138  sensor histidine kinase  34.78 
 
 		 589 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5692  sensor histidine kinase LytS  34.78 
 
 		 589 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5566  sensor histidine kinase LytS  34.78 
 
 		 589 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3033  histidine kinase internal region  33.04 
 
 		 633 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0284117  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0554  sensor histidine kinase  35.78 
 
 		 583 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5537  sensor histidine kinase LytS  34.78 
 
 		 589 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1762  signal transduction histidine kinase, LytS  29.79 
 
 		 465 aa  111  3e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.513767  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0526  histidine kinase internal region  26.79 
 
 		 594 aa  111  5e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000253378  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2398  signal transduction histidine kinase, LytS  31.8 
 
 		 568 aa  110  8.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0223  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.14 
 
 		 502 aa  110  8.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0994  putative sensor with HAMP domain  22.29 
 
 		 603 aa  110  9.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0411  signal transduction histidine kinase, LytS  32.55 
 
 		 1018 aa  109  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000411039  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0538  sensor histidine kinase  35.32 
 
 		 583 aa  109  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5235  signal transduction histidine kinase, LytS  34.8 
 
 		 589 aa  108  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0292  signal transduction histidine kinase, LytS  32.86 
 
 		 506 aa  108  3e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5383  sensor histidine kinase LytS  34.78 
 
 		 522 aa  108  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.498572  normal  0.326696 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2719  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.77 
 
 		 576 aa  107  4e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2345  sensor histidine kinase  27.27 
 
 		 578 aa  107  5e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0123193  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1227  histidine kinase  27.81 
 
 		 488 aa  107  6e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2355  signal transduction histidine kinase, LytS  33.33 
 
 		 580 aa  107  8e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.461368  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3306  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.95 
 
 		 483 aa  107  8e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1171  sensor histidine kinase  33.64 
 
 		 410 aa  106  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.400646  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3281  signal transduction histidine kinase, LytS  30.98 
 
 		 335 aa  105  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2453  histidine kinase  23.85 
 
 		 612 aa  105  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000429093  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0148  putative sensor with HAMP domain  30.51 
 
 		 594 aa  105  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2551  signal transduction histidine kinase, LytS  26.09 
 
 		 600 aa  105  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1002  sensor histidine kinase  33.18 
 
 		 410 aa  105  3e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0599  putative sensor with HAMP domain  28.2 
 
 		 623 aa  104  4e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.396658  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1225  signal transduction histidine kinase, LytS  30.71 
 
 		 603 aa  104  5e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.247489 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2171  ATP-binding region, ATPase-like  29.65 
 
 		 455 aa  104  5e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346246  normal  0.0306612 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2057  sensor histidine kinase  28.37 
 
 		 578 aa  104  5e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1585  signal transduction histidine kinase, LytS  26.16 
 
 		 574 aa  104  5e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1582  signal transduction histidine kinase, LytS  32.09 
 
 		 498 aa  103  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0045193  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3774  signal transduction histidine kinase, LytS  29.78 
 
 		 446 aa  102  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.469079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2792  signal transduction histidine kinase, LytS  32.76 
 
 		 564 aa  102  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000275265  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3212  histidine kinase internal region  29.44 
 
 		 596 aa  102  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1965  histidine kinase internal region  28.77 
 
 		 576 aa  100  5e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0160  ATP-binding region, ATPase-like  32.2 
 
 		 567 aa  100  7e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3959  signal transduction histidine kinase, LytS  33.78 
 
 		 591 aa  100  9e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0494  signal transduction histidine kinase, LytS  32.23 
 
 		 645 aa  100  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000248497  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2958  signal transduction histidine kinase, LytS  31.51 
 
 		 568 aa  99.8  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.177996  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3248  putative sensor with HAMP domain  25.4 
 
 		 600 aa  99  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2140  histidine kinase internal region  26.86 
 
 		 564 aa  98.6  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2134  signal transduction histidine kinase LytS  28.78 
 
 		 394 aa  98.2  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.775402  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02290  predicted sensory kinase in two-component system with YpdB  32.55 
 
 		 565 aa  97.8  5e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1277  signal transduction histidine kinase, LytS  32.55 
 
 		 565 aa  97.8  5e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02251  hypothetical protein  32.55 
 
 		 565 aa  97.8  5e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0056  signal transduction histidine kinase, LytS  29.8 
 
 		 557 aa  97.8  5e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0698199  decreased coverage  0.000000126428 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0054  signal transduction histidine kinase, LytS  29.8 
 
 		 557 aa  97.8  5e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0736236  hitchhiker  0.000664675 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0852  putative sensor with HAMP domain  31.13 
 
 		 610 aa  97.4  6e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1289  signal transduction histidine kinase, LytS  32.55 
 
 		 559 aa  97.8  6e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2670  sensor histidine kinase  32.55 
 
 		 559 aa  97.8  6e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2532  sensor histidine kinase  32.55 
 
 		 559 aa  97.8  6e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3612  sensor histidine kinase  32.55 
 
 		 559 aa  97.8  6e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.857731 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2517  sensor histidine kinase  32.55 
 
 		 559 aa  97.8  6e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0772  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.16 
 
 		 640 aa  97.4  7e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000785951  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2358  signal transduction histidine kinase, LytS  33.96 
 
 		 566 aa  97.4  7e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.551334  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1721  histidine kinase internal region  30.4 
 
 		 573 aa  96.3  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2444  signal transduction histidine kinase, LytS  33 
 
 		 566 aa  96.7  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.221441  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4590  putative sensor with HAMP domain  25.32 
 
 		 577 aa  96.7  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2973  signal transduction histidine kinase, LytS  29.09 
 
 		 369 aa  96.7  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.341771 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2749  sensor histidine kinase  32.08 
 
 		 559 aa  95.9  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3404  signal transduction histidine kinase, LytS  31.63 
 
 		 563 aa  95.9  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.823402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1376  signal transduction histidine kinase, LytS  29.76 
 
 		 405 aa  96.3  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3857  signal transduction histidine kinase, LytS  31.25 
 
 		 581 aa  95.9  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000136608  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0054  signal transduction histidine kinase, LytS  29.49 
 
 		 557 aa  95.1  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0899  signal transduction histidine kinase, LytS  29.22 
 
 		 572 aa  95.1  3e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.144133  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3406  histidine kinase internal region  27.78 
 
 		 603 aa  95.1  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.264135  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1351  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  29.91 
 
 		 414 aa  94.7  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0059  signal transduction histidine kinase, LytS  29.49 
 
 		 557 aa  94.7  4e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.996795  hitchhiker  0.000632462 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2919  signal transduction histidine kinase, LytS  32.37 
 
 		 565 aa  95.1  4e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.125544 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>