203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2213 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2213  hypothetical protein  100 
 
 
321 aa  656    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.809495  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2233  hypothetical protein  99.07 
 
 
321 aa  647    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2237  hypothetical protein  98.44 
 
 
321 aa  644    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2246  hypothetical protein  99.07 
 
 
321 aa  647    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2204  hypothetical protein  98.72 
 
 
327 aa  628  1e-179  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1356  protein of unknown function DUF1568  94.08 
 
 
321 aa  616  1e-175  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0875577  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1506  protein of unknown function DUF1568  86.6 
 
 
321 aa  569  1e-161  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1427  hypothetical protein  71.34 
 
 
321 aa  468  1.0000000000000001e-131  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1425  hypothetical protein  71.34 
 
 
321 aa  467  9.999999999999999e-131  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0722  protein of unknown function DUF1568  69.16 
 
 
321 aa  465  9.999999999999999e-131  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.645218  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1319  protein of unknown function DUF1568  71.47 
 
 
319 aa  461  1e-129  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0490388  hitchhiker  0.00690567 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1929  protein of unknown function DUF1568  65.73 
 
 
321 aa  437  1e-121  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2454  protein of unknown function DUF1568  66.67 
 
 
321 aa  435  1e-121  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000257297  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1578  hypothetical protein  62.81 
 
 
316 aa  395  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000706252  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2333  protein of unknown function DUF1568  58.57 
 
 
324 aa  389  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2336  protein of unknown function DUF1568  58.92 
 
 
324 aa  377  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1256  protein of unknown function DUF1568  57.23 
 
 
321 aa  368  1e-101  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0072967  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1104  methionine-R-sulfoxide reductase  56.43 
 
 
506 aa  366  1e-100  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000471642  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1782  protein of unknown function DUF1568  55.97 
 
 
325 aa  360  2e-98  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0188832 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1423  protein of unknown function DUF1568  55.49 
 
 
325 aa  354  1e-96  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.892865 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1487  hypothetical protein  55.17 
 
 
323 aa  350  2e-95  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1386  protein of unknown function DUF1568  55.52 
 
 
325 aa  348  5e-95  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0925  protein of unknown function DUF1568  52.17 
 
 
336 aa  342  5.999999999999999e-93  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1392  hypothetical protein  54.01 
 
 
320 aa  340  1e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2218  hypothetical protein  52.17 
 
 
327 aa  340  2e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00293328  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1484  hypothetical protein  56.95 
 
 
295 aa  339  2.9999999999999998e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2131  hypothetical protein  52.98 
 
 
333 aa  329  4e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.132605  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2205  hypothetical protein  98.01 
 
 
160 aa  306  3e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0255  hypothetical protein  50.89 
 
 
288 aa  283  4.0000000000000003e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0724188  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2643  transposase domain-containing protein  41.38 
 
 
335 aa  253  3e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1084  transposase and inactivated derivatives  40.88 
 
 
338 aa  251  9.000000000000001e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0844  hypothetical protein  41.38 
 
 
340 aa  249  3e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0793  hypothetical protein  38.75 
 
 
335 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000261863  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0845  hypothetical protein  45.15 
 
 
334 aa  212  5.999999999999999e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2207  protein of unknown function DUF1568  38.56 
 
 
323 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.45311e-16 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2224  hypothetical protein  92.38 
 
 
112 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00479916  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1791  transposase and inactivated derivatives  38.34 
 
 
323 aa  192  6e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0954  hypothetical protein  38.73 
 
 
326 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.729066  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1423  protein of unknown function DUF1568  47.67 
 
 
180 aa  165  9e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7985800000000005e-18 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2207  hypothetical protein  96.15 
 
 
81 aa  154  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0950  hypothetical protein  35.25 
 
 
321 aa  150  4e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000190963  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2771  hypothetical protein  34.65 
 
 
318 aa  149  7e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3632  hypothetical protein  31.75 
 
 
316 aa  149  8e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.108416  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0770  protein of unknown function DUF1568  30.09 
 
 
316 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.717082  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1620  hypothetical protein  32.98 
 
 
313 aa  142  8e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1356  hypothetical protein  33.09 
 
 
319 aa  142  9e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.895893  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0793  hypothetical protein  32.51 
 
 
314 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3037  protein of unknown function DUF1568  31.77 
 
 
315 aa  138  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3020  hypothetical protein  29.6 
 
 
316 aa  137  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3016  hypothetical protein  35.9 
 
 
312 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1967  hypothetical protein  33.09 
 
 
282 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.969925  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1966  hypothetical protein  33.09 
 
 
305 aa  130  3e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.527692  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0324  protein of unknown function DUF1568  39.05 
 
 
252 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.551772  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0922  protein of unknown function DUF1568  41.52 
 
 
176 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0741  protein of unknown function DUF1568  71.43 
 
 
97 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.117883  normal  0.0672697 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2247  hypothetical protein  64.84 
 
 
101 aa  125  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4538  protein of unknown function DUF1568  34.64 
 
 
251 aa  123  4e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0855967  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1032  protein of unknown function DUF1568  33.18 
 
 
326 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1748  hypothetical protein  28.35 
 
 
312 aa  121  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.994794  normal  0.0128416 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2198  transposase  29.67 
 
 
253 aa  120  3e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2192  hypothetical protein  29.67 
 
 
253 aa  118  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107555  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2086  hypothetical protein  29.78 
 
 
321 aa  118  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.464464  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0167  hypothetical protein  56.44 
 
 
101 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1055  transposase  43.45 
 
 
250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2050  protein of unknown function DUF1568  36.36 
 
 
336 aa  117  3e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.633564  normal  0.705399 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2878  protein of unknown function DUF1568  31.75 
 
 
289 aa  117  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000473385 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1813  protein of unknown function DUF1568  36.79 
 
 
277 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00112655  hitchhiker  0.00000000103135 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1406  protein of unknown function DUF1568  32.41 
 
 
289 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0595  hypothetical protein  37.33 
 
 
258 aa  113  4.0000000000000004e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.217159  hitchhiker  2.03187e-17 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2265  transposase and inactivated derivatives  30.86 
 
 
241 aa  113  5e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0148  transposase  36.36 
 
 
236 aa  112  7.000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0526667  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2264  transposase and inactivated derivatives  32.84 
 
 
323 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.88974  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0203  hypothetical protein  35.16 
 
 
288 aa  110  3e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0207  hypothetical protein  35.16 
 
 
288 aa  110  3e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12790  transposase  40.44 
 
 
241 aa  110  3e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3926  hypothetical protein  30.71 
 
 
322 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0136  transposase  35.15 
 
 
236 aa  109  5e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2394  hypothetical protein  32.79 
 
 
239 aa  109  5e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.419691  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2878  protein of unknown function DUF1568  32.97 
 
 
287 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0201  hypothetical protein  34.62 
 
 
288 aa  108  8.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0164  transposase  25.69 
 
 
287 aa  107  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0743928  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0033  hypothetical protein  39.31 
 
 
235 aa  105  8e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01210  transposase  35 
 
 
245 aa  105  1e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1151  protein of unknown function DUF1568  38.62 
 
 
231 aa  103  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1007  hypothetical protein  39.73 
 
 
234 aa  102  7e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.849512  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3871  protein of unknown function DUF1568  39.86 
 
 
236 aa  102  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2216  hypothetical protein  67.61 
 
 
72 aa  101  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.136455  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1724  hypothetical protein  38.46 
 
 
248 aa  99  1e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1725  hypothetical protein  37.76 
 
 
248 aa  98.2  2e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0682  hypothetical protein  28.93 
 
 
232 aa  98.2  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.349284  normal  0.584525 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2793  transposase-like p;rotein  36.99 
 
 
165 aa  95.9  8e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3049  transposase and inactivated derivatives  30.84 
 
 
226 aa  95.5  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0477  hypothetical protein  30.28 
 
 
232 aa  94.4  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0397  protein of unknown function DUF1568  30.34 
 
 
304 aa  93.6  4e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000164254  normal  0.853679 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0093  hypothetical protein  38.24 
 
 
234 aa  92.8  7e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150021  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0790  hypothetical protein  28.51 
 
 
232 aa  92.4  9e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.513436  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4446  hypothetical protein  30.69 
 
 
236 aa  92  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.885807  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0489  hypothetical protein  32.72 
 
 
310 aa  92  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.448467 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1552  protein of unknown function DUF1568  32.61 
 
 
230 aa  91.3  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.268269 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2238  hypothetical protein  88.24 
 
 
70 aa  91.7  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>