65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1867 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1094  major facilitator superfamily MFS_1  78.85 
 
 		 437 aa  675    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.929439  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1686  major facilitator superfamily MFS_1  78.29 
 
 		 454 aa  657    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000674894  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1481  transporter, putative  76.64 
 
 		 441 aa  669    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0889  transporter, putative  74.83 
 
 		 437 aa  650    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1867  major facilitator transporter  100 
 
 		 436 aa  859    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0859  major facilitator superfamily MFS_1  65.8 
 
 		 438 aa  578  1e-164  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.221691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1578  major facilitator superfamily MFS_1  64.19 
 
 		 438 aa  555  1e-157  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0877587 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1647  hypothetical protein  37.47 
 
 		 441 aa  235  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.411737  normal  0.910118 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2269  major facilitator transporter  28.71 
 
 		 427 aa  137  4e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000581212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2239  ferric reductase domain-containing protein  25.5 
 
 		 642 aa  107  6e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0544393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57608  predicted protein  25.68 
 
 		 474 aa  90.5  5e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.371537 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01489  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04850)  24.8 
 
 		 533 aa  82.4  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0186505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13760  hypothetical protein  41.56 
 
 		 1065 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.217439 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  27.95 
 
 		 1833 aa  52.4  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4226  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.5 
 
 		 465 aa  50.4  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.693691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2564  major facilitator transporter  27.07 
 
 		 450 aa  47.8  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0769  major facilitator transporter  31.13 
 
 		 487 aa  47.4  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.647722  normal  0.627018 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0410  multidrug-efflux transporter  31.67 
 
 		 433 aa  47.4  0.0005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1437  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.03 
 
 		 520 aa  47.4  0.0006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0599  major facilitator transporter  31.82 
 
 		 467 aa  47  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5749  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.32 
 
 		 607 aa  47  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2078  major facilitator superfamily MFS_1  23.97 
 
 		 404 aa  47  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20360  major facilitator superfamily (MFS) permease  35.14 
 
 		 432 aa  46.6  0.0008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1712  major facilitator superfamily MFS_1  27.67 
 
 		 445 aa  46.6  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.200643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29790  sugar phosphate permease  33.33 
 
 		 485 aa  46.6  0.0009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4127  major facilitator superfamily transporter  22.53 
 
 		 418 aa  46.6  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.554881 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0482  major facilitator transporter  23.53 
 
 		 407 aa  46.2  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15980  arabinose efflux permease family protein  25.48 
 
 		 402 aa  46.2  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000235485 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0371  major facilitator superfamily MFS_1  33.62 
 
 		 425 aa  45.8  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2528  major facilitator superfamily MFS_1  31.18 
 
 		 417 aa  45.1  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.387633  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0095  major facilitator superfamily MFS_1  23.21 
 
 		 395 aa  45.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1633  major facilitator superfamily MFS_1  26.52 
 
 		 503 aa  45.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0865478  normal  0.084905 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  37.93 
 
 		 455 aa  45.8  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  37.93 
 
 		 455 aa  44.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0340  major facilitator transporter  32.1 
 
 		 385 aa  45.1  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2425  major facilitator transporter  25.36 
 
 		 458 aa  45.1  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1015  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.78 
 
 		 561 aa  44.7  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2097  major facilitator transporter  29.53 
 
 		 459 aa  44.3  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.201063 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2887  major facilitator superfamily MFS_1  22.65 
 
 		 455 aa  43.9  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0537  major facilitator transporter  32.1 
 
 		 395 aa  43.9  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2778  major facilitator transporter  30.86 
 
 		 395 aa  43.9  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2164  major facilitator transporter  30.86 
 
 		 395 aa  43.9  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.570545  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2838  major facilitator transporter  30.86 
 
 		 395 aa  43.9  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0298937  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2789  major facilitator transporter  30.86 
 
 		 385 aa  43.9  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.36999 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2696  major facilitator transporter  30.86 
 
 		 385 aa  43.9  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.236302 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0744  major facilitator transporter  34.74 
 
 		 433 aa  43.9  0.006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0364296  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0421  putative multidrug-efflux transporter transmembrane protein  24.29 
 
 		 387 aa  43.9  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.107977  normal  0.376208 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3165  major facilitator transporter  37.5 
 
 		 442 aa  43.9  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.660067 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1024  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.55 
 
 		 512 aa  43.9  0.006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4248  major facilitator transporter  35.9 
 
 		 452 aa  43.5  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.718043  unclonable  0.0000000000020202 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13268  transmembrane transport protein  36.36 
 
 		 1048 aa  43.5  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.321047 
 
 
-
 
NC_004310  BR1059  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.12 
 
 		 513 aa  43.5  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.186181  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2304  major facilitator superfamily aromatic acid transporter  33.33 
 
 		 452 aa  43.5  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.551017 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3078  major facilitator superfamily MFS_1  24.16 
 
 		 457 aa  43.5  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.493541  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0920  General substrate transporter  32.76 
 
 		 471 aa  43.5  0.008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1277  major facilitator superfamily transporter  32.14 
 
 		 433 aa  43.5  0.008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2507  benzoate transport  38.89 
 
 		 451 aa  43.1  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2361  major facilitator transporter  34.41 
 
 		 594 aa  43.5  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.213022 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1459  major facilitator superfamily MFS_1  25.45 
 
 		 411 aa  43.1  0.009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.135074  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0262  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.73 
 
 		 500 aa  43.1  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0858399  decreased coverage  0.0004758 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3174  major facilitator transporter  29.75 
 
 		 412 aa  43.1  0.009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.860929  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3798  major facilitator transporter  30.56 
 
 		 452 aa  43.1  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2706  major facilitator transporter  37.74 
 
 		 440 aa  43.1  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.728097  normal  0.300526 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1137  major facilitator transporter  32.88 
 
 		 457 aa  43.1  0.01  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2550  major facilitator transporter  37.5 
 
 		 442 aa  43.1  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>