More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1197 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1197  thioredoxin reductase  100 
 
 
311 aa  642    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.711369  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0814  thioredoxin reductase  82.32 
 
 
311 aa  538  9.999999999999999e-153  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1544  thioredoxin reductase  80.71 
 
 
311 aa  532  1e-150  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1260  thioredoxin reductase  79.74 
 
 
311 aa  524  1e-148  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1151  thioredoxin reductase  75.56 
 
 
311 aa  509  1e-143  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000793818  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0923  thioredoxin reductase  73.63 
 
 
311 aa  484  1e-136  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1207  thioredoxin reductase  71.7 
 
 
311 aa  474  1e-133  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.12437  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4061  thioredoxin reductase  63 
 
 
314 aa  390  1e-107  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4094  thioredoxin reductase  63 
 
 
314 aa  390  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00339774  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0181  thioredoxin reductase  59.67 
 
 
334 aa  383  1e-105  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0887  thioredoxin reductase  60.4 
 
 
319 aa  378  1e-104  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0473  thioredoxin reductase  63 
 
 
314 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.499551 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3951  thioredoxin reductase  62.67 
 
 
314 aa  373  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  56.29 
 
 
332 aa  350  2e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1226  thioredoxin reductase  58.25 
 
 
325 aa  348  6e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4960  thioredoxin reductase  56.39 
 
 
319 aa  348  6e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2453  thioredoxin reductase  54.64 
 
 
321 aa  347  1e-94  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2880  thioredoxin reductase  55.3 
 
 
321 aa  345  4e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.805293  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3108  thioredoxin reductase  55.41 
 
 
310 aa  345  7e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264051  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4609  thioredoxin reductase  57.62 
 
 
321 aa  342  5e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0752942  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6803  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding  54.97 
 
 
321 aa  342  5e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2043  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3838  thioredoxin reductase  56.91 
 
 
321 aa  342  5.999999999999999e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3203  thioredoxin reductase  54.55 
 
 
361 aa  341  9e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.121454  normal  0.627549 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7086  thioredoxin reductase  53.29 
 
 
331 aa  340  1e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0030  thioredoxin reductase  55.48 
 
 
320 aa  340  2.9999999999999998e-92  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3350  thioredoxin reductase  53.55 
 
 
318 aa  339  4e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000709992  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7328  thioredoxin reductase  55.05 
 
 
348 aa  338  5.9999999999999996e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0414  thioredoxin reductase  54.28 
 
 
314 aa  338  5.9999999999999996e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0681074  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1453  thioredoxin reductase  55.63 
 
 
321 aa  338  8e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.904503 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7121  thioredoxin reductase  53 
 
 
327 aa  338  9.999999999999999e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1512  thioredoxin reductase  57.28 
 
 
321 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1337  thioredoxin reductase  54.69 
 
 
311 aa  336  1.9999999999999998e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1613  thioredoxin reductase  52.92 
 
 
322 aa  335  5.999999999999999e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1576  thioredoxin reductase  53.64 
 
 
317 aa  335  5.999999999999999e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0228  thioredoxin reductase  53.64 
 
 
312 aa  335  5.999999999999999e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2112  thioredoxin reductase  53.72 
 
 
324 aa  334  1e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0949537  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0839  thioredoxin reductase  55.12 
 
 
336 aa  333  2e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.242227 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2898  thioredoxin reductase  55.3 
 
 
314 aa  332  5e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5778  thioredoxin reductase  53.92 
 
 
333 aa  332  5e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0605147  normal  0.600469 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5402  thioredoxin reductase  53.92 
 
 
333 aa  332  5e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2441  thioredoxin reductase  52.98 
 
 
345 aa  332  5e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0877885  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5491  thioredoxin reductase  53.92 
 
 
333 aa  332  5e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0634892  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9376  thioredoxin reductase  54.43 
 
 
310 aa  331  7.000000000000001e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6067  thioredoxin reductase  54.79 
 
 
331 aa  332  7.000000000000001e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.976607  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2370  thioredoxin reductase  51.61 
 
 
316 aa  331  1e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274866  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2687  thioredoxin reductase  51.94 
 
 
320 aa  330  2e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.643501  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1611  thioredoxin reductase  51.94 
 
 
320 aa  330  2e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000152855  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2598  thioredoxin-disulfide reductase  51.94 
 
 
320 aa  330  2e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000212052  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6431  thioredoxin reductase  53.09 
 
 
310 aa  330  2e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3781  thioredoxin reductase  50.62 
 
 
316 aa  330  2e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1248  thioredoxin reductase  52.94 
 
 
324 aa  330  2e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.335568  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3654  thioredoxin reductase  52.75 
 
 
458 aa  329  3e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.24215  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0256  thioredoxin reductase  51.64 
 
 
335 aa  329  4e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.464072 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3686  thioredoxin reductase  50.63 
 
 
316 aa  329  4e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000489943  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2006  thioredoxin reductase  51.13 
 
 
317 aa  329  4e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0375  thioredoxin-disulfide reductase  52.13 
 
 
323 aa  328  5.0000000000000004e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39670  thioredoxin-disulfide reductase  53.09 
 
 
330 aa  328  5.0000000000000004e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.388089 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0763  thioredoxin reductase  49.84 
 
 
319 aa  328  5.0000000000000004e-89  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0545  thioredoxin reductase  52.13 
 
 
323 aa  328  5.0000000000000004e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.192083  hitchhiker  0.00000399991 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4304  thioredoxin reductase  55.81 
 
 
335 aa  328  5.0000000000000004e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4579  thioredoxin reductase  55.41 
 
 
317 aa  329  5.0000000000000004e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.777909  hitchhiker  0.00491977 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1694  thioredoxin-disulfide reductase  52.26 
 
 
317 aa  328  6e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2262  thioredoxin reductase  51.44 
 
 
319 aa  328  8e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0017275  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2547  thioredoxin reductase  52.94 
 
 
313 aa  328  1.0000000000000001e-88  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.788713  normal  0.117427 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2343  thioredoxin reductase  50.33 
 
 
322 aa  327  1.0000000000000001e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3338  thioredoxin reductase  50 
 
 
331 aa  327  1.0000000000000001e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5364  thioredoxin reductase  52.73 
 
 
337 aa  327  1.0000000000000001e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.65514 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3793  thioredoxin reductase  51.96 
 
 
325 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119595  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31890  thioredoxin-disulfide reductase  53.62 
 
 
353 aa  327  2.0000000000000001e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1692  thioredoxin reductase 1  52.43 
 
 
314 aa  326  2.0000000000000001e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.160177  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0981  thioredoxin-disulfide reductase  50.96 
 
 
317 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.708131  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1016  thioredoxin reductase  53.48 
 
 
320 aa  325  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1360  thioredoxin reductase  52.24 
 
 
332 aa  326  4.0000000000000003e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30280  thioredoxin reductase 1  51.3 
 
 
316 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003744  thioredoxin reductase  51.29 
 
 
319 aa  325  5e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.891826  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5084  thioredoxin reductase  56.11 
 
 
325 aa  325  6e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5097  thioredoxin reductase  55.1 
 
 
362 aa  325  6e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.121367  hitchhiker  0.000000380245 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5401  thioredoxin reductase  52.72 
 
 
361 aa  325  6e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2591  thioredoxin reductase 1  51.3 
 
 
316 aa  325  7e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.542991  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1778  thioredoxin-disulfide reductase  50.99 
 
 
315 aa  325  7e-88  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.246241  decreased coverage  0.00675935 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1731  thioredoxin reductase  50.32 
 
 
316 aa  325  8.000000000000001e-88  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06129  thioredoxin-disulfide reductase  52.09 
 
 
322 aa  325  8.000000000000001e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.345376  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01037  thioredoxin-disulfide reductase  52.09 
 
 
322 aa  325  8.000000000000001e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.088167  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53290  thioredoxin reductase 2  53.87 
 
 
316 aa  325  8.000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.868588 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6236  thioredoxin reductase  50.33 
 
 
314 aa  325  9e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.215918  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4853  thioredoxin reductase  51.79 
 
 
330 aa  325  9e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4032  thioredoxin reductase  51.13 
 
 
316 aa  324  1e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000634849  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1178  thioredoxin reductase  53.48 
 
 
320 aa  324  1e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1731  thioredoxin reductase  50.32 
 
 
316 aa  324  1e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3139  thioredoxin-disulfide reductase  51.3 
 
 
338 aa  324  1e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0803  thioredoxin reductase  51.46 
 
 
318 aa  324  1e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2753  thioredoxin reductase  54.46 
 
 
320 aa  324  1e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3225  thioredoxin reductase  50.97 
 
 
319 aa  323  2e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00279715  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2943  thioredoxin reductase  54.02 
 
 
333 aa  323  2e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3368  thioredoxin reductase  51.47 
 
 
330 aa  323  2e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4536  thioredoxin reductase  55.41 
 
 
348 aa  323  2e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0097  thioredoxin reductase  54.33 
 
 
320 aa  323  2e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.653318  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1148  thioredoxin reductase  54.37 
 
 
317 aa  323  2e-87  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.604332  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2305  thioredoxin reductase  53.9 
 
 
334 aa  323  2e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0781239 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1283  thioredoxin reductase  48.88 
 
 
320 aa  323  3e-87  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>