37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0933 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0933  outer membrane autotransporter  100 
 
 
4248 aa  7729    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1670  outer membrane autotransporter  35.12 
 
 
3046 aa  199  7e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.999552 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0245  Outer membrane autotransporter barrel  33.61 
 
 
2175 aa  171  2.9999999999999998e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.203155  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2539  Outer membrane autotransporter barrel  26.99 
 
 
1778 aa  141  3.0000000000000003e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0250  outer membrane autotransporter  31.81 
 
 
4368 aa  107  4e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3087  Outer membrane autotransporter barrel  26.06 
 
 
2407 aa  89.7  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3958  putative outer membrane autotransporter barrel precursor  24.35 
 
 
907 aa  89  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2974  Outer membrane autotransporter barrel  24.05 
 
 
814 aa  77  0.000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0263  hypothetical protein  36.2 
 
 
3497 aa  76.6  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1306  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.63 
 
 
1489 aa  73.6  0.00000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0779  hypothetical protein  23.57 
 
 
1881 aa  73.6  0.00000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6355  outer membrane autotransporter  21.7 
 
 
4238 aa  71.6  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.51084 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6533  Outer membrane autotransporter barrel  21.7 
 
 
3822 aa  70.9  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6767  outer membrane autotransporter  21.7 
 
 
4238 aa  70.1  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3756  Outer membrane autotransporter barrel  22.6 
 
 
3506 aa  66.6  0.000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2458  outer membrane autotransporter  23.72 
 
 
1369 aa  65.9  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00908706  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1203  outer membrane autotransporter  24.38 
 
 
1769 aa  64.3  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4115  outer membrane autotransporter  21.31 
 
 
3954 aa  63.9  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4933  outer membrane autotransporter  23.29 
 
 
2346 aa  63.9  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348524  unclonable  0.000124828 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5354  outer membrane autotransporter  21.92 
 
 
2365 aa  63.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0199943  normal  0.02642 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00711  YapH protein  23.38 
 
 
2711 aa  63.2  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0184521  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4066  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.42 
 
 
1081 aa  62  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.392825  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0758  outer membrane autotransporter barrel  23.49 
 
 
2396 aa  61.6  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00291921 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3411  Outer membrane autotransporter barrel  21.43 
 
 
1130 aa  58.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0137  outer membrane autotransporter  24.34 
 
 
1519 aa  57.8  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7237  putative outer membrane autotransporter barrel precursor  22.64 
 
 
882 aa  55.5  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7520  outer membrane autotransporter domain-containing protein  27.27 
 
 
1177 aa  55.8  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2173  Outer membrane autotransporter barrel  25.17 
 
 
1180 aa  52.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.193519  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1881  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.68 
 
 
1532 aa  52  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1975  Outer membrane autotransporter  22.16 
 
 
1111 aa  52  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1511  outer membrane autotransporter  29.1 
 
 
1886 aa  51.6  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.188015  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2708  Outer membrane autotransporter barrel  24.25 
 
 
678 aa  49.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1774  serine protease  21.64 
 
 
1508 aa  49.3  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.903556  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2865  outer membrane autotransporter  23.74 
 
 
994 aa  48.9  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3162  putative hemagglutinin-related protein  25 
 
 
1012 aa  48.9  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5186  outer membrane autotransporter  23.13 
 
 
1056 aa  47  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4300  Outer membrane autotransporter barrel  21.11 
 
 
987 aa  47  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.359518 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>