More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0304 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0304  transcription elongation factor GreA  100 
 
 		 157 aa  303  8.000000000000001e-82  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1590  transcription elongation factor GreA  83.44 
 
 		 158 aa  259  1e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01495  putative transcription elongation factor  70.7 
 
 		 158 aa  234  4e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4815  transcription elongation factor GreA  70.06 
 
 		 160 aa  222  2e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0909183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3810  transcription elongation factor GreA  67.52 
 
 		 157 aa  204  4e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.138968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1054  transcription elongation factor GreA  63.69 
 
 		 157 aa  196  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1631  transcription elongation factor GreA  61.94 
 
 		 158 aa  188  2e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0576288  hitchhiker  0.00568101 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1117  transcription elongation factor GreA  60 
 
 		 159 aa  187  5e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.789381  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0733  hypothetical protein  59.62 
 
 		 157 aa  180  7e-45  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1688  transcription elongation factor GreA  56.58 
 
 		 156 aa  174  5e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.833443 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1240  transcription elongation factor GreA  57.05 
 
 		 157 aa  158  3e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1129  GreA/GreB family elongation factor  50.34 
 
 		 158 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0875  transcription elongation factor GreA  51.01 
 
 		 158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.73287  normal  0.0631013 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0480  GreA/GreB family elongation factor  48.99 
 
 		 158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0337518  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1564  transcription elongation factor GreA  51.97 
 
 		 160 aa  145  3e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000290434  hitchhiker  0.000735134 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0906  transcription elongation factor GreA  55.26 
 
 		 160 aa  144  4.0000000000000006e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1284  transcription elongation factor GreA  50.34 
 
 		 158 aa  144  6e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.177076  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0773  transcription elongation factor GreA  50.34 
 
 		 158 aa  144  6e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.568342  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0584  transcription elongation factor GreA  50.34 
 
 		 158 aa  144  6e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125264  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1611  transcription elongation factor GreA  50.34 
 
 		 158 aa  144  6e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.939973  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1508  transcription elongation factor GreA  50.34 
 
 		 158 aa  144  6e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.150081  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1733  transcription elongation factor GreA  50.34 
 
 		 158 aa  144  6e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.669906  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0567  transcription elongation factor GreA  50.34 
 
 		 158 aa  144  6e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.535804  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1478  transcription elongation factor GreA  50.34 
 
 		 158 aa  144  6e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0496142  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2312  transcription elongation factor GreA  50.34 
 
 		 152 aa  144  7.0000000000000006e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.693473  hitchhiker  0.00295599 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1182  transcription elongation factor GreA  50 
 
 		 158 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.22898 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1170  transcription elongation factor GreA  50 
 
 		 158 aa  143  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1851  transcription elongation factor GreA  48.32 
 
 		 158 aa  143  1e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.888423  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1264  transcription elongation factor GreA  50 
 
 		 158 aa  142  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.165873 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0812  transcription elongation factor GreA  50 
 
 		 158 aa  142  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1293  transcription elongation factor GreA  50 
 
 		 158 aa  142  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0940  transcription elongation factor GreA  48.72 
 
 		 172 aa  142  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1781  transcription elongation factor GreA  52.32 
 
 		 159 aa  141  4e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.695085  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0638  transcription elongation factor GreA  49.66 
 
 		 158 aa  141  4e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0788  transcription elongation factor GreA  49.66 
 
 		 158 aa  141  4e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2027  transcription elongation factor GreA  49.33 
 
 		 158 aa  140  5e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4435  transcription elongation factor GreA  49.33 
 
 		 158 aa  140  6e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1263  transcription elongation factor GreA  48.99 
 
 		 168 aa  140  8e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0260201 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2780  transcription elongation factor GreA  48.99 
 
 		 158 aa  140  9e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.115654  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0880  GreA/GreB family elongation factor  49.66 
 
 		 158 aa  140  9.999999999999999e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2523  transcription elongation factor GreA  49.32 
 
 		 158 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182345  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1258  transcription elongation factor GreA  46.67 
 
 		 176 aa  138  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1854  transcription elongation factor GreA  50.99 
 
 		 159 aa  137  3.9999999999999997e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.866249  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2866  transcription elongation factor GreA  46.67 
 
 		 158 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0891965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0673  transcription elongation factor GreA  47.65 
 
 		 152 aa  137  7.999999999999999e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.487901 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3357  transcription elongation factor GreA  46.31 
 
 		 159 aa  136  8.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.970031  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0495  transcription elongation factor GreA  50.99 
 
 		 160 aa  136  1e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.588124  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3084  GreA/GreB family elongation factor  48.37 
 
 		 158 aa  135  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02242  Transcription elongation factor GreA  46.31 
 
 		 153 aa  135  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0681866  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1980  transcription elongation factor GreA  46.79 
 
 		 158 aa  135  2e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00819368 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1429  transcription elongation factor GreA  44.87 
 
 		 159 aa  134  3.0000000000000003e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0808  transcription elongation factor GreA  47.65 
 
 		 159 aa  135  3.0000000000000003e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.350185  normal  0.0132742 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1369  transcription elongation factor  44.87 
 
 		 173 aa  135  3.0000000000000003e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0830842  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1023  transcription elongation factor GreA  48.65 
 
 		 160 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.299103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0809  transcription elongation factor GreA  47.13 
 
 		 157 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000158219  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1000  transcription elongation factor GreA  46.15 
 
 		 158 aa  135  3.0000000000000003e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.302487  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2078  transcription elongation factor GreA  48.65 
 
 		 158 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000287405  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1611  transcription elongation factor GreA  46.31 
 
 		 158 aa  134  4e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.69568e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2677  GreA/GreB family elongation factor  44.97 
 
 		 158 aa  134  4e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1561  transcription elongation factor GreA  49.66 
 
 		 158 aa  134  5e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.970872  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4421  transcription elongation factor GreA  47.44 
 
 		 158 aa  134  5e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3619  transcription elongation factor GreA  45.64 
 
 		 158 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1672  transcription elongation factor GreA  49.67 
 
 		 159 aa  133  7.000000000000001e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.112053  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2887  transcription elongation factor GreA  47.37 
 
 		 157 aa  134  7.000000000000001e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2213  transcription elongation factor GreA  45.64 
 
 		 158 aa  134  7.000000000000001e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0850  transcription elongation factor GreA  46.31 
 
 		 158 aa  133  8e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.209846 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42920  transcription elongation factor GreA  44.97 
 
 		 158 aa  133  9e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.393679  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0868  transcription elongation factor GreA  48.32 
 
 		 157 aa  133  9e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.639151  normal  0.282498 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2119  transcription elongation factor GreA  45.51 
 
 		 166 aa  132  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.736032  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3017  transcription elongation factor GreA  45.64 
 
 		 157 aa  133  9.999999999999999e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4930  transcription elongation factor GreA  47.65 
 
 		 158 aa  132  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41417 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1728  transcription elongation factor GreA  45.51 
 
 		 166 aa  133  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5475  transcription elongation factor GreA  44.97 
 
 		 158 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.670951  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2715  transcription elongation factor GreA  48.32 
 
 		 158 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62900  transcription elongation factor GreA  44.97 
 
 		 158 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1146  transcription elongation factor GreA  46 
 
 		 158 aa  132  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2209  transcription elongation factor GreA  45.51 
 
 		 166 aa  132  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2389  transcription elongation factor GreA  47.33 
 
 		 158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.643877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2612  transcription elongation factor GreA  46.98 
 
 		 158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.657313 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2976  transcription elongation factor GreA  48.32 
 
 		 158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.174839  normal  0.133661 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3400  transcription elongation factor GreA  47.97 
 
 		 158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0549133  normal  0.0891208 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1218  transcription elongation factor GreA  47.97 
 
 		 160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1089  transcription elongation factor GreA  47.97 
 
 		 160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.799328 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4293  transcription elongation factor GreA  45.81 
 
 		 157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2727  GreA/GreB family elongation factor  48.63 
 
 		 160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.148274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1469  transcription elongation factor GreA  47.33 
 
 		 158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2174  transcription elongation factor GreA  46.31 
 
 		 158 aa  131  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1466  transcription elongation factor GreA  48.72 
 
 		 176 aa  131  3e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0366416  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1725  transcription elongation factor GreA  45.64 
 
 		 158 aa  131  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0640  transcription elongation factor GreA  48.32 
 
 		 158 aa  131  3.9999999999999996e-30  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.104464  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0813  transcription elongation factor GreA  45.64 
 
 		 158 aa  130  5e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000426484  normal  0.0245884 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2118  transcription elongation factor GreA  47.1 
 
 		 157 aa  130  5e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0563  transcription elongation factor GreA  45.64 
 
 		 158 aa  130  6e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00266162  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0832  transcription elongation factor GreA  46.31 
 
 		 158 aa  130  6e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000149804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1775  transcription elongation factor GreA  47.65 
 
 		 159 aa  130  6.999999999999999e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000308338  normal  0.0541245 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0828  transcription elongation factor GreA  44.97 
 
 		 158 aa  130  6.999999999999999e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0209829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1254  transcription elongation factor GreA  47.97 
 
 		 158 aa  130  7.999999999999999e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.378894  normal  0.504509 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0984  transcription elongation factor GreA  46.45 
 
 		 157 aa  130  7.999999999999999e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.406423  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0780  GreA/GreB family elongation factor  46.98 
 
 		 158 aa  130  7.999999999999999e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000129967  hitchhiker  0.000100122 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1522  transcription elongation factor GreA  46.58 
 
 		 158 aa  130  9e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>