31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1378 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1378  putative DNA primase, small subunit  100 
 
 		 348 aa  710    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.214397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1683  DNA primase, small subunit  45.61 
 
 		 312 aa  251  1e-65  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.773478 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0991  DNA primase small subunit  43.86 
 
 		 312 aa  246  4e-64  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0437  putative DNA primase, small subunit  41.76 
 
 		 312 aa  239  5e-62  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1787  putative DNA primase, small subunit  42.31 
 
 		 312 aa  236  3e-61  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.057405 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0622  putative DNA primase, small subunit  34.13 
 
 		 389 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1245  DNA primase, small subunit  30.34 
 
 		 404 aa  157  3e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0410  DNA primase, small subunit  33.5 
 
 		 391 aa  154  2e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.193863  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2753  DNA primase small subunit  34.39 
 
 		 386 aa  150  3e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1571  DNA primase small subunit  29.23 
 
 		 414 aa  149  9e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2564  DNA primase, small subunit  32.5 
 
 		 391 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1392  DNA primase small subunit  28.39 
 
 		 390 aa  145  1e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.369939  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1798  DNA primase small subunit  30.89 
 
 		 387 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2019  DNA primase small subunit  31.13 
 
 		 330 aa  137  2e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.358314  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2482  DNA primase, small subunit  31.31 
 
 		 392 aa  135  9.999999999999999e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0953  DNA primase, small subunit  30.23 
 
 		 378 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1955  putative DNA primase, small subunit  29.59 
 
 		 374 aa  127  3e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.804448 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1793  DNA primase small subunit  29.02 
 
 		 320 aa  125  1e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1132  DNA primase, small subunit, putative  28.64 
 
 		 388 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2047  putative DNA primase, small subunit  28.03 
 
 		 387 aa  120  3e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0066  DNA primase small subunit  26.3 
 
 		 373 aa  120  3e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1303  DNA primase small subunit  27.32 
 
 		 380 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0420  DNA primase small subunit  38.64 
 
 		 395 aa  119  6e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.669616  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1084  putative DNA primase, small subunit  28.77 
 
 		 355 aa  104  2e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.346262  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1606  DNA primase small subunit  28.77 
 
 		 357 aa  90.1  4e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0877  DNA primase, small subunit  28.97 
 
 		 357 aa  89.4  8e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1070  putative DNA primase, small subunit  27.61 
 
 		 363 aa  82.8  0.000000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0882  putative DNA primase, small subunit  27.72 
 
 		 364 aa  77  0.0000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.506684  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01650  conserved hypothetical protein  28.88 
 
 		 429 aa  60.5  0.00000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55030  p48 polypeptide of DNA primase  32.47 
 
 		 437 aa  58.2  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_54992  predicted protein  25.81 
 
 		 458 aa  43.5  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.030257  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>