75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2423 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_2423  hypothetical protein  100 
 
 		 419 aa  853    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2822  hypothetical protein  54.29 
 
 		 420 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2587  hypothetical protein  55.56 
 
 		 444 aa  460  9.999999999999999e-129  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0021  hypothetical protein  50.88 
 
 		 399 aa  414  1e-114  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0629415  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2182  hypothetical protein  50.63 
 
 		 401 aa  400  9.999999999999999e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2452  hypothetical protein  49.25 
 
 		 402 aa  387  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.280378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2063  hypothetical protein  46.9 
 
 		 417 aa  354  2e-96  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4993  hypothetical protein  34.84 
 
 		 408 aa  204  3e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.513988 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13168  hypothetical protein  30.65 
 
 		 396 aa  196  9e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4599  hypothetical protein  30.69 
 
 		 393 aa  191  2e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.107377  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3389  hypothetical protein  33.89 
 
 		 399 aa  191  2e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.121637 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2262  hypothetical protein  34.37 
 
 		 396 aa  186  5e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.237582  normal  0.287603 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2926  hypothetical protein  28.57 
 
 		 394 aa  176  8e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.812191  hitchhiker  0.000139992 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0324  SAM-dependent methyltransferase  28.03 
 
 		 431 aa  158  2e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.71025  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1929  hypothetical protein  27.86 
 
 		 383 aa  154  4e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0557173  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0026  hypothetical protein  26.7 
 
 		 433 aa  141  1.9999999999999998e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1098  hypothetical protein  29.37 
 
 		 407 aa  131  2.0000000000000002e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.697484 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0077  hypothetical protein  27.3 
 
 		 392 aa  108  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2590  hypothetical protein  30.81 
 
 		 400 aa  101  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.709956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4454  hypothetical protein  26.69 
 
 		 407 aa  100  6e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3087  hypothetical protein  27.85 
 
 		 416 aa  99.8  9e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000449393  hitchhiker  0.0000364534 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0734  hypothetical protein  27.34 
 
 		 396 aa  97.8  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.386022  normal  0.277265 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0634  hypothetical protein  25.82 
 
 		 412 aa  90.5  5e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1907  hypothetical protein  25.41 
 
 		 412 aa  89  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1860  hypothetical protein  25.41 
 
 		 412 aa  89  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.181101  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1841  hypothetical protein  25.41 
 
 		 369 aa  89  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2598  hypothetical protein  26.44 
 
 		 411 aa  88.2  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000882332 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2934  hypothetical protein  26.7 
 
 		 382 aa  84.3  0.000000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1663  hypothetical protein  28.83 
 
 		 396 aa  82.8  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29160  hypothetical protein  26.09 
 
 		 438 aa  79.3  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0682  hypothetical protein  25.53 
 
 		 418 aa  79.3  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.601703  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08510  hypothetical protein  25.26 
 
 		 422 aa  78.6  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3648  hypothetical protein  25.27 
 
 		 388 aa  78.6  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4027  hypothetical protein  25 
 
 		 428 aa  77.4  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3060  hypothetical protein  25.79 
 
 		 400 aa  77  0.0000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.849253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4268  hypothetical protein  23.34 
 
 		 372 aa  76.6  0.0000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229972  normal  0.945024 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0971  hypothetical protein  25.27 
 
 		 385 aa  75.1  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13053  hypothetical protein  24.93 
 
 		 358 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.150174 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28440  hypothetical protein  27.35 
 
 		 399 aa  73.9  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2888  hypothetical protein  23.5 
 
 		 414 aa  73.2  0.000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00389281  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2600  hypothetical protein  25.14 
 
 		 423 aa  73.2  0.000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.590151  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6063  hypothetical protein  26.09 
 
 		 383 aa  72.4  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3843  hypothetical protein  29.4 
 
 		 428 aa  71.6  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1152  hypothetical protein  24.94 
 
 		 388 aa  71.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2351  hypothetical protein  24.65 
 
 		 407 aa  71.2  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.175675  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4259  hypothetical protein  30.18 
 
 		 415 aa  69.7  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3266  hypothetical protein  23.2 
 
 		 399 aa  67.8  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2091  hypothetical protein  27 
 
 		 381 aa  66.2  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1085  hypothetical protein  26.92 
 
 		 403 aa  60.8  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.643719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0802  hypothetical protein  24.36 
 
 		 477 aa  58.5  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5789  hypothetical protein  25.41 
 
 		 487 aa  58.9  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.712723  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1249  Methyltransferase type 11  26.32 
 
 		 385 aa  55.1  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.419487  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2446  methyltransferase  24.31 
 
 		 357 aa  53.5  0.000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.949706  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0116  methyltransferase  36.54 
 
 		 189 aa  52.4  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16610  hypothetical protein  25.19 
 
 		 443 aa  51.6  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1360  hypothetical protein  24.19 
 
 		 375 aa  47.8  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3184  methyltransferase small  30.49 
 
 		 244 aa  46.6  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.241453  normal  0.13403 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4233  hypothetical protein  25.14 
 
 		 411 aa  46.6  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.118857 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2375  hypothetical protein  30.25 
 
 		 199 aa  46.2  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0161405  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2782  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  36.62 
 
 		 217 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.415202 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2737  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  35.21 
 
 		 217 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.45151  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00159  hypothetical protein  31.71 
 
 		 258 aa  44.7  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0173  methyltransferase  34.78 
 
 		 203 aa  43.9  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.147272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2273  protein-L-isoaspartate methyltransferase-like  32.43 
 
 		 241 aa  43.9  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03538  putative methyltransferase  29.51 
 
 		 216 aa  43.9  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6138  hypothetical protein  31.67 
 
 		 204 aa  43.9  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.266752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0579  methyltransferase  29.79 
 
 		 204 aa  43.9  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330232  normal  0.0174607 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1801  hypothetical protein  27.17 
 
 		 243 aa  43.5  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1802  hypothetical protein  28.26 
 
 		 243 aa  43.9  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2056  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  31.18 
 
 		 666 aa  43.5  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2754  methyltransferase, putative  34.88 
 
 		 189 aa  43.5  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2374  methyltransferase  34.88 
 
 		 189 aa  43.5  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.1111  normal  0.0169548 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1925  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  36.36 
 
 		 224 aa  43.1  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.32328  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3894  (Uracil-5)-methyltransferase  29.29 
 
 		 407 aa  43.5  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2240  hypothetical protein  35.06 
 
 		 264 aa  43.1  0.01  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>