94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1451 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1451  hypothetical protein  100 
 
 		 335 aa  690    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000857119  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0208  Radical SAM domain protein  75.83 
 
 		 333 aa  543  1e-153  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.819308  hitchhiker  0.00109807 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0199  Radical SAM domain protein  74.92 
 
 		 333 aa  531  1e-150  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1913  hypothetical protein  63.36 
 
 		 334 aa  451  1.0000000000000001e-126  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.971358  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3188  radical SAM domain-containing protein  61.09 
 
 		 329 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1926  Radical SAM domain protein  46.81 
 
 		 334 aa  294  2e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1526  hypothetical protein  59.04 
 
 		 84 aa  105  9e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3189  biotin synthase  22.99 
 
 		 345 aa  65.9  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000310414  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2972  biotin synthase  24.44 
 
 		 345 aa  62.8  0.000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11606  biotin synthase  25.46 
 
 		 349 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00001352  normal  0.936765 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2002  biotin synthase  23.91 
 
 		 335 aa  57.4  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.678074  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7724  biotin synthase  22.68 
 
 		 341 aa  57.4  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0821  biotin synthase  23.53 
 
 		 326 aa  57  0.0000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0695199 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0430  biotin synthase  27.27 
 
 		 346 aa  56.6  0.0000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.230205  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0492  biotin synthase  27.27 
 
 		 328 aa  55.8  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3624  biotin synthase  23.79 
 
 		 331 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.193538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_46799  predicted protein  25.96 
 
 		 311 aa  54.7  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.970391 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2775  biotin synthase  26.39 
 
 		 347 aa  54.7  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2462  biotin synthase  26.39 
 
 		 347 aa  55.1  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2292  biotin synthase  25.58 
 
 		 349 aa  54.7  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0563  biotin synthase  25.19 
 
 		 345 aa  53.9  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.295179  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1331  biotin synthase  25.27 
 
 		 328 aa  53.5  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0604  biotin synthase  22.26 
 
 		 333 aa  53.5  0.000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1569  biotin synthase  23.86 
 
 		 331 aa  52.8  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.690546 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1035  biotin synthase  23.22 
 
 		 335 aa  52.4  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0231112 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3698  biotin synthase  22.46 
 
 		 331 aa  52.4  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00270895  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2793  biotin synthase  25.76 
 
 		 331 aa  52  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.883098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1518  biotin synthase  23.86 
 
 		 331 aa  51.2  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000115411 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0963  biotin synthase  25 
 
 		 326 aa  51.2  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.032686  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2823  biotin synthase  26.32 
 
 		 336 aa  52  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0612  biotin synthase  26.25 
 
 		 333 aa  51.2  0.00002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1855  biotin synthase  28.03 
 
 		 350 aa  50.8  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1839  biotin synthase  20.83 
 
 		 353 aa  50.4  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0814889  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0422  biotin synthase  23.27 
 
 		 339 aa  49.7  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3073  biotin synthase  25.54 
 
 		 331 aa  49.7  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0657  biotin synthase  23.53 
 
 		 324 aa  49.3  0.00008  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3090  biotin synthase  25.54 
 
 		 331 aa  49.7  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.136649 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1825  biotin synthase  26.64 
 
 		 326 aa  49.7  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0542557 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2916  biotin synthase  27.27 
 
 		 320 aa  49.7  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.113509  normal  0.431828 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3133  biotin synthase  25.54 
 
 		 331 aa  49.7  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0469  biotin synthase  22.39 
 
 		 354 aa  48.9  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000778897 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2647  biotin synthase  21.07 
 
 		 351 aa  48.9  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000036845  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1571  biotin synthase  24.44 
 
 		 411 aa  49.3  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.598658  normal  0.287862 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26490  biotin synthase  21.69 
 
 		 334 aa  49.3  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.197487 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02874  biotin synthase  23.81 
 
 		 344 aa  48.1  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0719  biotin synthase  24.25 
 
 		 356 aa  47.4  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0050  biotin synthase  25.87 
 
 		 341 aa  47.8  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0041  biotin synthase  25.87 
 
 		 341 aa  47.8  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8311  Biotin synthase  22.58 
 
 		 332 aa  47.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0271  Radical SAM domain protein  22.93 
 
 		 347 aa  47.4  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.195415  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0156  biotin synthase  24.42 
 
 		 345 aa  47.8  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0570  biotin synthase  25.5 
 
 		 339 aa  47.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.965755  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0020  biotin synthase  24.53 
 
 		 320 aa  47.8  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000521068  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3779  biotin synthase  25.79 
 
 		 353 aa  46.6  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195072  normal  0.526732 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03970  biotin synthase, putative  25.58 
 
 		 388 aa  47  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.299072  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2045  biotin synthase  27.39 
 
 		 350 aa  46.6  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0111965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1795  biotin synthase  23.55 
 
 		 319 aa  46.6  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0117  biotin synthase  27.14 
 
 		 345 aa  46.6  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0814388  normal  0.975833 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1580  biotin synthase  26.07 
 
 		 344 aa  46.6  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.309497  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02190  biotin synthase  23.42 
 
 		 412 aa  46.6  0.0006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0036  biotin synthase  21.43 
 
 		 368 aa  46.2  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3644  biotin synthase  25.71 
 
 		 345 aa  46.6  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4030  biotin synthase  24 
 
 		 345 aa  46.2  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.959642 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3077  biotin synthase  25.1 
 
 		 336 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.784786  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2017  biotin synthase  25.1 
 
 		 339 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0388  biotin synthase  25.1 
 
 		 339 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0409  biotin synthase  25.1 
 
 		 336 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2854  biotin synthase  26.47 
 
 		 332 aa  45.8  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0103  biotin synthase  25.1 
 
 		 322 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0757617  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2269  biotin synthase  25.1 
 
 		 339 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0337  biotin synthase  25.1 
 
 		 339 aa  45.4  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2776  biotin synthetase  24.19 
 
 		 350 aa  45.8  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1040  biotin synthase  27.23 
 
 		 321 aa  45.8  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.683221  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0933  biotin synthase  27.23 
 
 		 321 aa  45.8  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1428  biotin synthase  23.96 
 
 		 315 aa  45.1  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2347  biotin synthase  22.73 
 
 		 321 aa  44.7  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1244  Radical SAM domain protein  23.47 
 
 		 360 aa  44.7  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2518  biotin synthase  25.83 
 
 		 354 aa  45.1  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1222  biotin synthase  24.16 
 
 		 329 aa  45.1  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.213831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5738  biotin synthase  22.46 
 
 		 347 aa  45.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1556  biotin synthase  23.96 
 
 		 315 aa  44.7  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2242  biotin synthase  22.18 
 
 		 329 aa  45.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0887115  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0352  biotin synthase  24.21 
 
 		 326 aa  45.1  0.002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.643225  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2168  biotin synthase  23.43 
 
 		 335 aa  44.3  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.444037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21296  biotin synthase  23.6 
 
 		 437 aa  44.3  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3827  biotin synthase  23.85 
 
 		 347 aa  44.3  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0170  biotin synthase  24.64 
 
 		 351 aa  44.3  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2890  biotin synthase  23.7 
 
 		 338 aa  44.3  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.357161 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2286  biotin synthase  22.73 
 
 		 331 aa  43.9  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0215942 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3396  biotin synthase  25.43 
 
 		 336 aa  43.5  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.301102  normal  0.739802 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2083  biotin synthase  19.54 
 
 		 372 aa  43.5  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0506  biotin synthase  23.75 
 
 		 364 aa  43.1  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16510  iron-only hydrogenase maturation protein HydE  26.05 
 
 		 351 aa  43.1  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0897  biotin synthase  25.5 
 
 		 337 aa  42.7  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.615591 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>