More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0873 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_0873  dimethyladenosine transferase  100 
 
 
263 aa  538  9.999999999999999e-153  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1172  dimethyladenosine transferase  74.22 
 
 
262 aa  400  9.999999999999999e-111  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000173217  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1169  dimethyladenosine transferase  70.34 
 
 
269 aa  385  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.013755  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1287  dimethyladenosine transferase  71.81 
 
 
273 aa  380  1e-104  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.652271  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1193  dimethyladenosine transferase  68.2 
 
 
263 aa  361  7.0000000000000005e-99  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1177  dimethyladenosine transferase  62.55 
 
 
262 aa  326  2.0000000000000001e-88  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.356891  normal  0.0114034 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0880  dimethyladenosine transferase  60.77 
 
 
261 aa  320  9.999999999999999e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000357619  decreased coverage  0.00867661 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2603  dimethyladenosine transferase  42.51 
 
 
266 aa  194  2e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0737  dimethyladenosine transferase  39.84 
 
 
268 aa  179  2.9999999999999997e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3913  dimethyladenosine transferase  40.33 
 
 
269 aa  172  2.9999999999999996e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2313  dimethyladenosine transferase  39.76 
 
 
271 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000480867  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2492  dimethyladenosine transferase  37.36 
 
 
271 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000182898  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1864  dimethyladenosine transferase  38.15 
 
 
276 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131942  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1304  dimethyladenosine transferase  38.64 
 
 
275 aa  171  9e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000005204  normal  0.0246501 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3507  dimethyladenosine transferase  41.55 
 
 
276 aa  168  7e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.450284  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2288  dimethyladenosine transferase  37.97 
 
 
275 aa  167  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.311251  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1935  dimethyladenosine transferase  37.97 
 
 
275 aa  166  4e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6033  dimethyladenosine transferase  41.67 
 
 
268 aa  165  5.9999999999999996e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.57913  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0392  dimethyladenosine transferase  37.01 
 
 
291 aa  163  3e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00405196  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1628  dimethyladenosine transferase  40.94 
 
 
258 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0961527  hitchhiker  0.00711372 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0844  dimethyladenosine transferase  39.11 
 
 
261 aa  161  9e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3348  dimethyladenosine transferase  37.32 
 
 
285 aa  160  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.908407  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0718  dimethyladenosine transferase  36.23 
 
 
294 aa  160  2e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.616682  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1352  dimethyladenosine transferase  40.45 
 
 
297 aa  159  4e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.212433  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1288  dimethyladenosine transferase  40.45 
 
 
297 aa  159  4e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0096  dimethyladenosine transferase  39.34 
 
 
261 aa  158  8e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1901  dimethyladenosine transferase  36.08 
 
 
272 aa  158  9e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.13527 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4110  dimethyladenosine transferase  39.29 
 
 
253 aa  158  9e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0551  dimethyladenosine transferase  35.91 
 
 
268 aa  158  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4074  dimethyladenosine transferase  37.64 
 
 
279 aa  158  1e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0035  dimethyladenosine transferase  37.08 
 
 
293 aa  157  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2309  dimethyladenosine transferase  39 
 
 
275 aa  157  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000265248  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5760  dimethyladenosine transferase  41.43 
 
 
266 aa  157  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.220306 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4627  dimethyladenosine transferase  38.33 
 
 
268 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5273  dimethyladenosine transferase  37.2 
 
 
255 aa  157  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1848  dimethyladenosine transferase  36.29 
 
 
264 aa  157  2e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1277  dimethyladenosine transferase  36.78 
 
 
285 aa  156  4e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.772647  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0668  dimethyladenosine transferase  37.65 
 
 
267 aa  156  4e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.777402  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03760  dimethyladenosine transferase  37.65 
 
 
269 aa  155  7e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.472323  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0053  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  41.18 
 
 
294 aa  155  7e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000057406  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1457  dimethyladenosine transferase  41.96 
 
 
272 aa  155  8e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0867671  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3468  dimethyladenosine transferase  38.89 
 
 
253 aa  155  8e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.659211  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1657  dimethyladenosine transferase  39.56 
 
 
266 aa  154  1e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1549  dimethyladenosine transferase  36.12 
 
 
292 aa  154  1e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0135  dimethyladenosine transferase  37.6 
 
 
258 aa  154  2e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.202375 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1981  dimethyladenosine transferase  39.84 
 
 
257 aa  154  2e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0213  dimethyladenosine transferase  35.34 
 
 
297 aa  154  2e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2855  dimethyladenosine transferase  36.95 
 
 
256 aa  152  5e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2464  dimethyladenosine transferase  36.08 
 
 
280 aa  152  5e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000579309  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3635  dimethyladenosine transferase  36.8 
 
 
272 aa  152  5e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1051  dimethyladenosine transferase  39.29 
 
 
266 aa  152  5e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0402858  normal  0.593327 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1772  dimethyladenosine transferase  37.16 
 
 
290 aa  152  5e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2995  dimethyladenosine transferase  37.6 
 
 
256 aa  152  5.9999999999999996e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0736  dimethyladenosine transferase  37.61 
 
 
268 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.281087  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1357  dimethyladenosine transferase  38.82 
 
 
260 aa  152  7e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000735455  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46830  dimethyladenosine transferase  37.17 
 
 
272 aa  152  7e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2325  dimethyladenosine transferase  39.27 
 
 
279 aa  151  8e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000317998  normal  0.877518 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1779  dimethyladenosine transferase  35.71 
 
 
290 aa  151  8.999999999999999e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4526  dimethyladenosine transferase  38.43 
 
 
301 aa  151  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0907  dimethyladenosine transferase  38.5 
 
 
296 aa  151  1e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000552021  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1559  dimethyladenosine transferase  35.88 
 
 
281 aa  151  1e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.147263  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1613  dimethyladenosine transferase  33.46 
 
 
295 aa  151  1e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0633  dimethyladenosine transferase  38.37 
 
 
277 aa  150  2e-35  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0920  dimethyladenosine transferase  35.02 
 
 
282 aa  150  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0307213  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3421  dimethyladenosine transferase  36.6 
 
 
268 aa  150  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.747318  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0208  dimethyladenosine transferase  38.6 
 
 
298 aa  150  2e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000398679  normal  0.017695 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1329  dimethyladenosine transferase  37.5 
 
 
260 aa  149  3e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000282219  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07730  dimethyladenosine transferase  37.17 
 
 
268 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0104234 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1238  dimethyladenosine transferase  38.15 
 
 
249 aa  149  4e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0036  dimethyladenosine transferase  39.46 
 
 
292 aa  149  5e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2152  dimethyladenosine transferase  38.89 
 
 
255 aa  149  5e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4810  dimethyladenosine transferase  36.05 
 
 
284 aa  149  6e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.482961  normal  0.0271814 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0052  dimethyladenosine transferase  36.84 
 
 
288 aa  149  6e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000822785 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4762  dimethyladenosine transferase  42.06 
 
 
253 aa  149  7e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0046  dimethyladenosine transferase  39.46 
 
 
292 aa  148  8e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0039  dimethyladenosine transferase  39.46 
 
 
292 aa  148  8e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0040  dimethyladenosine transferase  39.46 
 
 
292 aa  148  8e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0546968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0037  dimethyladenosine transferase  39.46 
 
 
292 aa  148  8e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0037  dimethyladenosine transferase  39.46 
 
 
292 aa  148  8e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00019411  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04645  dimethyladenosine transferase  39.63 
 
 
262 aa  148  8e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0575079  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0039  dimethyladenosine transferase  39.46 
 
 
292 aa  148  8e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5270  dimethyladenosine transferase  39.46 
 
 
292 aa  148  8e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0050  dimethyladenosine transferase  39.46 
 
 
292 aa  148  8e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0046  dimethyladenosine transferase  39.46 
 
 
292 aa  148  8e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0167  dimethyladenosine transferase  41.41 
 
 
267 aa  148  9e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.314995  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0346  dimethyladenosine transferase  41.41 
 
 
268 aa  148  9e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.335401  normal  0.775767 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0563  dimethyladenosine transferase  40.37 
 
 
272 aa  148  9e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5135  dimethyladenosine transferase  36.84 
 
 
272 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4013  dimethyladenosine transferase  37.13 
 
 
269 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0077  dimethyladenosine transferase  39.57 
 
 
293 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000377526  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4801  dimethyladenosine transferase  36.48 
 
 
266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2861  dimethyladenosine transferase  39.11 
 
 
271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00548999  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3832  dimethyladenosine transferase  38.99 
 
 
272 aa  146  3e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0501  dimethyladenosine transferase  38.02 
 
 
270 aa  146  3e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000511271 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3812  dimethyladenosine transferase  38 
 
 
260 aa  146  3e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0974345  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2079  dimethyladenosine transferase  35.65 
 
 
258 aa  147  3e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0879  dimethyladenosine transferase  37.13 
 
 
269 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.865136 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl005  dimethyladenosine transferase  32.71 
 
 
267 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0439  dimethyladenosine transferase  36.64 
 
 
278 aa  145  5e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130635  normal  0.799564 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21720  dimethyladenosine transferase  36.15 
 
 
301 aa  145  6e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.700032  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>