More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0102 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_0102  iojap-like protein  100 
 
 
131 aa  268  2e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000101684  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2664  iojap-like protein  74.81 
 
 
131 aa  207  4e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000901507  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0095  iojap-like protein  75.57 
 
 
131 aa  207  6e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000027247  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0136  iojap-like protein  71.54 
 
 
147 aa  195  1.0000000000000001e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.872852  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0097  Iojap-related protein  76.52 
 
 
131 aa  187  5.999999999999999e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0187008  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0087  Iojap-related protein  71.09 
 
 
129 aa  183  7e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.755827  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0124  iojap-like protein  71.17 
 
 
143 aa  171  2.9999999999999996e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000225979  hitchhiker  0.00822144 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0228  iojap-like protein  52.63 
 
 
191 aa  111  3e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.689651  normal  0.307872 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0213  Iojap-related protein  51.96 
 
 
107 aa  110  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.277011  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0237  iojap-like protein  51.02 
 
 
198 aa  106  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0226  iojap-like protein  51.02 
 
 
198 aa  106  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.499146  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0686  iojap-like protein  46.15 
 
 
158 aa  99  2e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000289548  normal  0.0203597 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1756  Iojap-related protein  44.12 
 
 
131 aa  97.1  7e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000000663767  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0567  Iojap-related protein  50 
 
 
115 aa  95.5  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0022  Iojap-related protein  45.45 
 
 
163 aa  94.7  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.853245 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2013  iojap-like protein  45.19 
 
 
117 aa  94.7  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13380  iojap-like protein  51.16 
 
 
121 aa  94.7  4e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.129259  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3776  iojap-like protein  38.98 
 
 
128 aa  94.7  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000307395  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3860  iojap-like protein  39.83 
 
 
128 aa  94  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.152757 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4129  iojap-like protein  43.4 
 
 
128 aa  94  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000489424  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1866  iojap-like protein  45.28 
 
 
118 aa  93.6  8e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000042805  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1659  iojap-related protein  45.74 
 
 
118 aa  92.4  2e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.0000807789  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2577  Iojap-related protein  45 
 
 
119 aa  91.7  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.5603199999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0910  Iojap family protein  43.52 
 
 
120 aa  91.7  3e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000376688  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3800  iojap-like protein  42 
 
 
122 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825219  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2006  iojap-like protein  44.55 
 
 
142 aa  90.9  5e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0014366  hitchhiker  0.0000000000365534 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0192  iojap-like protein  45.92 
 
 
118 aa  90.5  7e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000139024  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3343  Poly(A) polymerase, PcnB  38.54 
 
 
114 aa  89.7  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000574363  normal  0.0167921 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2516  iojap-like protein  41.18 
 
 
118 aa  89.7  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000207265  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4329  iojap-like protein  41 
 
 
112 aa  89.7  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.9777e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08370  iojap-related protein  42.22 
 
 
117 aa  88.6  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0216142  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0997  iojap-like protein  41.84 
 
 
118 aa  88.6  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2060  iojap-like protein  45.45 
 
 
142 aa  89.4  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.758731  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3201  Iojap-related protein  42.72 
 
 
131 aa  89.4  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.12867e-19  unclonable  7.41028e-24 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3248  iojap-like protein  44.92 
 
 
125 aa  89  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000025477  unclonable  0.0000142145 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0092  iojap-like protein  43.16 
 
 
114 aa  89  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2674  iojap-like protein  41.44 
 
 
124 aa  88.2  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0269937  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1149  iojap-like protein  47.31 
 
 
110 aa  88.2  4e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1601  iojap-related protein  43.27 
 
 
118 aa  87.8  4e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000000667428  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1581  hypothetical protein  46.94 
 
 
117 aa  88.2  4e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000000588564  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0399  iojap-like protein  42.16 
 
 
116 aa  87.4  5e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000418488  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2263  iojap-like protein  46.36 
 
 
152 aa  86.7  9e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1543  Iojap-related protein  43.01 
 
 
123 aa  86.7  9e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0158973  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0417  hypothetical protein  40.66 
 
 
148 aa  86.7  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.864379 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0377  Iojap-related protein  45.74 
 
 
153 aa  86.7  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1104  hypothetical protein  42.22 
 
 
118 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.793496  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2127  iojap-like protein  41.38 
 
 
130 aa  86.3  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.810786  normal  0.0331873 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12030  hypothetical protein  42.22 
 
 
118 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00879098  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5246  iojap-like protein  43.62 
 
 
144 aa  85.9  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.378223  normal  0.556736 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2601  iojap-like protein  40 
 
 
123 aa  85.9  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.378393  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0163  Iojap-related protein  39.58 
 
 
141 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0031  iojap-like protein  45.36 
 
 
124 aa  85.5  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.983708  normal  0.170479 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1753  iojap-like protein  39.25 
 
 
122 aa  85.1  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1923  iojap-like protein  39.45 
 
 
116 aa  85.1  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000477061  unclonable  0.00000000896903 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0536  iojap-like protein  45.63 
 
 
114 aa  85.1  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.635311 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2415  iojap-like protein  42.71 
 
 
116 aa  85.1  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000000527491  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0522  Iojap-related protein  40.86 
 
 
120 aa  84.7  4e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0513689  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0161  iojap-like protein  40.66 
 
 
150 aa  84.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3646  iojap-like protein  45.56 
 
 
150 aa  84.3  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000675973  normal  0.475596 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3193  iojap-like protein  45.26 
 
 
120 aa  84  6e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3002  iojap-like protein  41 
 
 
131 aa  83.6  9e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3013  iojap-like protein  37.07 
 
 
166 aa  83.2  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0357309  normal  0.915296 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2110  iojap-like protein  44.09 
 
 
117 aa  83.2  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.106455  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13060  iojap-related protein  46.59 
 
 
128 aa  83.2  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.691164  normal  0.0908003 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0577  Iojap-related protein  42.11 
 
 
132 aa  82.8  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.258721 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1521  Iojap-related protein  46.67 
 
 
131 aa  83.2  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.191395  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1511  iojap protein family  45 
 
 
116 aa  82.8  0.000000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000252813  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1339  iojap-like protein  42.16 
 
 
144 aa  83.2  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5041  iojap-like protein  47.42 
 
 
127 aa  82.4  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2454  iojap-like protein  40.21 
 
 
118 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000449181  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3737  iojap-like protein  47 
 
 
104 aa  82.4  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000069668  unclonable  0.000000000198678 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1774  iojap-related protein  37.76 
 
 
156 aa  81.6  0.000000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4639  iojap-like protein  40 
 
 
139 aa  81.6  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.188421  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2793  iojap-like protein  41.76 
 
 
143 aa  81.6  0.000000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3209  iojap-related protein  41.58 
 
 
131 aa  81.6  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.013969  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1509  iojap-like protein  40.22 
 
 
137 aa  81.3  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0462296  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0372  iojap-like protein  39.81 
 
 
114 aa  81.6  0.000000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000445596  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0666  iojap family protein  44 
 
 
116 aa  81.3  0.000000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  2.49784e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2660  Iojap-related protein  40.91 
 
 
115 aa  81.3  0.000000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00250929  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1739  iojap-like protein  35.14 
 
 
173 aa  81.3  0.000000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3534  iojap-like protein  39.25 
 
 
133 aa  81.3  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.667747 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0255  Iojap-related protein  34.75 
 
 
135 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1841  iojap-related protein  37.76 
 
 
117 aa  80.9  0.000000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0164  Iojap-related protein  41.94 
 
 
139 aa  80.9  0.000000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2544  iojap-like protein  37.62 
 
 
120 aa  80.9  0.000000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00643892  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3529  Iojap-related protein  39.25 
 
 
122 aa  81.3  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3631  iojap-like protein  38.32 
 
 
138 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000000986152  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3602  iojap-like protein  39.25 
 
 
122 aa  81.3  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158813  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1476  iojap-like protein  41.41 
 
 
168 aa  80.5  0.000000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.332262  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4278  hypothetical protein  34.48 
 
 
137 aa  80.5  0.000000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0405  iojap-like protein  45.45 
 
 
123 aa  80.5  0.000000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.64212  normal  0.310869 
 
 
-
 
NC_002936  DET0393  iojap-like protein  38.83 
 
 
114 aa  80.5  0.000000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00274134  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1058  iojap-like protein  36.73 
 
 
159 aa  80.5  0.000000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1655  iojap-like protein  35.29 
 
 
123 aa  80.5  0.000000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1238  iojap-like protein  38.24 
 
 
113 aa  80.5  0.000000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2506  Iojap-related protein  43.82 
 
 
119 aa  80.5  0.000000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1783  iojap-like protein  36.64 
 
 
144 aa  80.1  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07936  hypothetical protein  40.21 
 
 
123 aa  80.1  0.000000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1821  iojap-like protein  40.78 
 
 
127 aa  80.1  0.000000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.383706  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4809  iojap-like protein  37.74 
 
 
139 aa  79.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.243454 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>