More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0086 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0086  acylphosphatase  100 
 
 		 91 aa  184  5e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.186616  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2679  acylphosphatase  58.43 
 
 		 92 aa  106  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0920  acylphosphatase  56.04 
 
 		 91 aa  104  4e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0099  acylphosphatase  41.11 
 
 		 124 aa  80.9  0.000000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.643538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3149  acylphosphatase  42.53 
 
 		 96 aa  78.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000748736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2947  acylphosphatase  42.53 
 
 		 96 aa  78.2  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0713  acylphosphatase  42.05 
 
 		 92 aa  77.4  0.00000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.527846  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4329  acylphosphatase  40.91 
 
 		 92 aa  75.1  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.41249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0770  acylphosphatase  37.5 
 
 		 92 aa  74.7  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0122  acylphosphatase  42.53 
 
 		 91 aa  71.2  0.000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0311  acylphosphatase  37.5 
 
 		 93 aa  70.9  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.422172  normal  0.0299279 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4481  acylphosphatase  40.7 
 
 		 101 aa  69.7  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0240  acylphosphatase  36.36 
 
 		 93 aa  69.7  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2835  acylphosphatase  40.91 
 
 		 91 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000760642  hitchhiker  0.000425949 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4097  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  46.51 
 
 		 789 aa  68.9  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3607  acylphosphatase  39.77 
 
 		 110 aa  69.3  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0899906 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1449  acylphosphatase  37.65 
 
 		 89 aa  67.8  0.00000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000172052  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0042  acylphosphatase  38.46 
 
 		 90 aa  67.4  0.00000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2680  acylphosphatase  43.9 
 
 		 91 aa  67  0.00000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.174548  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4069  acylphosphatase  34.88 
 
 		 92 aa  67  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1283  acylphosphatase  37.08 
 
 		 91 aa  67  0.00000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.380051  normal  0.379678 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0730  acylphosphatase  36.36 
 
 		 93 aa  67  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1328  acylphosphatase  39.08 
 
 		 91 aa  67  0.00000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.161573  normal  0.572666 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2214  putative acylphosphatase  39.77 
 
 		 92 aa  66.6  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000119886  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1216  acylphosphatase  40.26 
 
 		 93 aa  66.6  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0405  acylphosphatase  38.2 
 
 		 90 aa  65.9  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1977  acylphosphatase  42.7 
 
 		 95 aa  65.9  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.560432  normal  0.812753 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1183  acylphosphatase  38.1 
 
 		 92 aa  65.5  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.858645  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0151  acylphosphatase  38.67 
 
 		 97 aa  65.5  0.0000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1809  acylphosphatase  37.5 
 
 		 95 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000689172  normal  0.0364693 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0694  acylphosphatase  34.09 
 
 		 93 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.509759  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1396  acylphosphatase  41.33 
 
 		 90 aa  64.7  0.0000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1288  acylphosphatase  37.08 
 
 		 94 aa  64.7  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0729  acylphosphatase  35.23 
 
 		 93 aa  64.3  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1427  acylphosphatase  34.83 
 
 		 97 aa  63.5  0.0000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.223488  normal  0.163349 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3583  acylphosphatase  36.84 
 
 		 99 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6574  acylphosphatase  39.76 
 
 		 97 aa  62.8  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3085  acylphosphatase  44 
 
 		 112 aa  63.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.842982 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0522  acylphosphatase  45.33 
 
 		 89 aa  63.5  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606766 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4554  acylphosphatase  40 
 
 		 86 aa  62  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.640639  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1124  acylphosphatase  41.67 
 
 		 93 aa  62  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.8259399999999998e-21 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2182  acylphosphatase  45.83 
 
 		 90 aa  62  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.404717  normal  0.46336 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1146  acylphosphatase  41.67 
 
 		 93 aa  62  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.137289  normal  0.225824 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1041  acylphosphatase  41.67 
 
 		 93 aa  61.6  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.860635  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1192  acylphosphatase  41.67 
 
 		 93 aa  62  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3446  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  42.22 
 
 		 764 aa  61.6  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.629954 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1158  acylphosphatase  41.67 
 
 		 93 aa  62  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.216126  normal  0.513068 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08420  cylphosphatase  34.09 
 
 		 95 aa  61.6  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1245  acylphosphatase  34.09 
 
 		 95 aa  61.6  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3384  acylphosphatase  35.96 
 
 		 94 aa  61.2  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2778  acylphosphatase  37.21 
 
 		 89 aa  60.8  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.376971  normal  0.15284 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3230  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  36.67 
 
 		 783 aa  60.8  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1812  acylphosphatase  33.72 
 
 		 97 aa  60.8  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4152  acylphosphatase  40.24 
 
 		 97 aa  60.5  0.000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3350  acylphosphatase  42.03 
 
 		 99 aa  60.8  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.200593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1211  acylphosphatase  34.52 
 
 		 86 aa  60.5  0.000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0664194  normal  0.0125945 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1921  acylphosphatase  39.29 
 
 		 83 aa  60.5  0.000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2406  acylphosphatase  33.72 
 
 		 92 aa  59.7  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.31927  normal  0.925907 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2257  acylphosphatase  35.63 
 
 		 88 aa  60.1  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.265908 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0091  acylphosphatase  41.89 
 
 		 95 aa  60.1  0.00000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.104703  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1686  acylphosphatase  39.08 
 
 		 88 aa  60.1  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.333589  normal  0.382627 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2095  acylphosphatase  41.89 
 
 		 109 aa  60.1  0.00000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.451224  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1628  acylphosphatase  39.08 
 
 		 89 aa  60.1  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000020913  normal  0.189828 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1419  acylphosphatase  38.37 
 
 		 92 aa  59.7  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03890  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  43.53 
 
 		 751 aa  60.1  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4711  acylphosphatase  39.76 
 
 		 97 aa  59.7  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0009  acylphosphatase  39.02 
 
 		 97 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3682  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  41.03 
 
 		 780 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3443  acylphosphatase  33.33 
 
 		 92 aa  58.5  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0103  acylphosphatase  34.44 
 
 		 92 aa  58.2  0.00000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00111331 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0974  acylphosphatase  38.2 
 
 		 89 aa  58.2  0.00000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1185  acylphosphatase  44.44 
 
 		 92 aa  58.2  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4771  acylphosphatase  39.77 
 
 		 99 aa  58.2  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000297446  normal  0.0367606 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0794  acylphosphatase  40.91 
 
 		 110 aa  58.2  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.364443  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0745  acylphosphatase  42.25 
 
 		 117 aa  57.4  0.00000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.492264  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51920  acylphosphatase  36.47 
 
 		 91 aa  57  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00243945 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1728  acylphosphatase  34.09 
 
 		 90 aa  57  0.00000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.352005  normal  0.358001 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2291  acylphosphatase  34.09 
 
 		 90 aa  57  0.00000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0355652  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1869  acylphosphatase  37.84 
 
 		 90 aa  56.6  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1604  [NiFe] hydrogenase maturation protein HypF  52.63 
 
 		 754 aa  56.6  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0862  acylphosphatase  35.96 
 
 		 93 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3588  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.75 
 
 		 776 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2526  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.75 
 
 		 780 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.908669  normal  0.241645 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0509  acylphosphatase  36.78 
 
 		 87 aa  56.2  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0168  acylphosphatase  48.21 
 
 		 117 aa  56.6  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0736  acylphosphatase  34.88 
 
 		 93 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1494  acylphosphatase  41.57 
 
 		 89 aa  55.8  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00408889  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2369  acylphosphatase  36.14 
 
 		 99 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.631036  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3091  acylphosphatase  36.36 
 
 		 99 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.937205  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1465  acylphosphatase  41.57 
 
 		 89 aa  55.8  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.846334  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1692  acylphosphatase  40.85 
 
 		 91 aa  55.5  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.205499 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36780  acylphosphatase  38.27 
 
 		 91 aa  55.8  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02098  conserved hypothetical protein  35.63 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.121229  normal  0.762264 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1480  acylphosphatase  38.1 
 
 		 94 aa  55.1  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0319671  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1853  acylphosphatase  34.78 
 
 		 91 aa  55.1  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0372  acylphosphatase  34.48 
 
 		 94 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.404855 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2240  acylphosphatase  40 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1323  acylphosphatase  37.35 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0824  acylphosphatase  34.88 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4339  acylphosphatase  32.58 
 
 		 99 aa  55.1  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0201054  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>