More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1103 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_1103  two-component response regulator  100 
 
 		 221 aa  449  1e-125  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1236  DNA-binding response regulator  72.27 
 
 		 221 aa  295  4e-79  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000188808  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1358  DNA-binding response regulator  72.27 
 
 		 221 aa  295  4e-79  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0519481  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0504  DNA-binding response regulator  70.91 
 
 		 221 aa  288  5.0000000000000004e-77  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000376141  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1280  DNA-binding response regulator  58.26 
 
 		 220 aa  261  6.999999999999999e-69  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000547046  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1324  extracellular solute-binding protein  57.08 
 
 		 220 aa  250  1e-65  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.273971  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0128  two-component response regulator  56.11 
 
 		 228 aa  227  1e-58  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.4797  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0136  transcriptional activator protein CopR  52.29 
 
 		 220 aa  208  7e-53  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0840  transcriptional activator protein CopR  47.27 
 
 		 222 aa  199  1.9999999999999998e-50  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.048163  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0097  response regulator receiver  47.71 
 
 		 222 aa  194  7e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0528  transcriptional activator protein CopR  50.23 
 
 		 220 aa  188  5.999999999999999e-47  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0120  response regulator receiver  43.18 
 
 		 221 aa  177  2e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1365  two component transcriptional regulator  44.5 
 
 		 219 aa  167  8e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00130586  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0257  response regulator receiver  38.14 
 
 		 219 aa  149  2e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1773  two component transcriptional regulator  38.14 
 
 		 217 aa  146  2.0000000000000003e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0258  two component transcriptional regulator  37.67 
 
 		 217 aa  145  4.0000000000000006e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0200742  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1213  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.33 
 
 		 223 aa  141  7e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1806  two-component response regulator  36.74 
 
 		 220 aa  139  1.9999999999999998e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0884  two component transcriptional regulator  36.28 
 
 		 218 aa  139  3e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.68851  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0625  two component transcriptional regulator  37.44 
 
 		 217 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1330  response regulator receiver  33.33 
 
 		 219 aa  135  4e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0998  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.64 
 
 		 223 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  34.26 
 
 		 220 aa  132  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0210  DNA-binding response regulator  34.42 
 
 		 225 aa  132  5e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2296  two component transcriptional regulator  34.09 
 
 		 255 aa  131  9e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398969  normal  0.240289 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0578  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.19 
 
 		 244 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0660  two component transcriptional regulator  32.57 
 
 		 224 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000259813  hitchhiker  0.0000270487 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3444  two component transcriptional regulator  32.41 
 
 		 220 aa  129  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112849  normal  0.384843 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1917  DNA-binding response regulator  33.95 
 
 		 222 aa  129  3e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2384  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.41 
 
 		 219 aa  129  4.0000000000000003e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23421  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31270  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  31.65 
 
 		 221 aa  128  5.0000000000000004e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.014564  normal  0.249814 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1625  DNA-binding response regulator CsrR  34.07 
 
 		 229 aa  128  7.000000000000001e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.137799  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2927  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.15 
 
 		 224 aa  128  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2264  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.22 
 
 		 231 aa  127  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00910741  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4793  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.45 
 
 		 219 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.732153 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3267  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 220 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1619  DNA-binding response regulator  31.19 
 
 		 230 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4078  DNA-binding response regulator  31.19 
 
 		 230 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0729773  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0075  two component transcriptional regulator  31.19 
 
 		 230 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2924  DNA-binding response regulator  31.19 
 
 		 230 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0208  DNA-binding response regulator  31.19 
 
 		 230 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.857207  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3354  two component transcriptional regulator  32.87 
 
 		 220 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.44436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3256  two component transcriptional regulator  31.19 
 
 		 230 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2983  DNA-binding response regulator  31.19 
 
 		 230 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3511  two component transcriptional regulator  32.11 
 
 		 224 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000699106  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3924  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.19 
 
 		 228 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.154255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3386  DNA-binding response regulator  31.19 
 
 		 230 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3339  DNA-binding response regulator  31.19 
 
 		 230 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0008  two component transcriptional regulator  31.19 
 
 		 228 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0074  two component transcriptional regulator  31.19 
 
 		 230 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.948307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0093  two component transcriptional regulator  31.19 
 
 		 230 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.51453 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2980  two component transcriptional regulator  31.19 
 
 		 230 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04130  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  32.88 
 
 		 236 aa  127  2.0000000000000002e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118973  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0066  two component transcriptional regulator  31.19 
 
 		 230 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.530384  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4004  DNA-binding response regulator  31.19 
 
 		 230 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1701  DNA-binding response regulator  33.63 
 
 		 230 aa  126  2.0000000000000002e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00672994  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0075  two component transcriptional regulator  31.19 
 
 		 230 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.280185  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3057  two component transcriptional regulator  31.19 
 
 		 228 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0209  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.78 
 
 		 251 aa  126  3e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4628  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.09 
 
 		 224 aa  126  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000289587 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0575  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.09 
 
 		 224 aa  126  3e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.21251 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1579  response regulator receiver  34.88 
 
 		 225 aa  125  4.0000000000000003e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.410227  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1407  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.03 
 
 		 225 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.440596  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1685  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.03 
 
 		 225 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00118059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1411  response regulator receiver  33.03 
 
 		 225 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.110033 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0386  two component transcriptional regulator  34.26 
 
 		 222 aa  125  5e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2389  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.84 
 
 		 240 aa  125  5e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0687652  decreased coverage  0.0000973314 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5130  OmpR/winged helix family two component transcriptional regulator  31.16 
 
 		 223 aa  125  5e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.76336  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3846  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.94 
 
 		 222 aa  125  5e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2957  two component transcriptional regulator  32.43 
 
 		 223 aa  125  5e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000406961  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1155  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.49 
 
 		 230 aa  125  6e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.560017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1333  response regulator receiver protein  31.39 
 
 		 222 aa  125  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.40527  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2440  two component transcriptional regulator  31.94 
 
 		 222 aa  125  7e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0936231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21090  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  32.89 
 
 		 231 aa  125  7e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.664911  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4798  two component transcriptional regulator  31.25 
 
 		 230 aa  124  8.000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.358461 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3453  two component transcriptional regulator  33.67 
 
 		 224 aa  124  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2223  winged helix family two component transcriptional regulator  32.13 
 
 		 229 aa  124  1e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.335669  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  32.44 
 
 		 224 aa  124  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3061  two component transcriptional regulator  31.9 
 
 		 229 aa  124  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.296421  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1089  DNA-binding response regulator RprY  33.03 
 
 		 245 aa  123  2e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.414682 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2549  response regulator receiver  30.94 
 
 		 222 aa  123  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1358  two component response regulator  32.11 
 
 		 224 aa  123  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0272  response regulator receiver  35.48 
 
 		 223 aa  124  2e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3820  two component transcriptional regulator  31.94 
 
 		 221 aa  123  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0090  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.13 
 
 		 226 aa  123  2e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0311  two component transcriptional regulator  31.98 
 
 		 232 aa  123  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.280613 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0707  winged helix family two component transcriptional regulator  31.39 
 
 		 222 aa  123  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1480  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.64 
 
 		 219 aa  123  2e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000681553  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3651  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.94 
 
 		 228 aa  123  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0435949 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3519  two component transcriptional regulator  32.43 
 
 		 227 aa  122  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.683413  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0583  two component transcriptional regulator  31.19 
 
 		 224 aa  123  3e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0841609  normal  0.467543 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2066  two component transcriptional regulator  31.94 
 
 		 225 aa  123  3e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4436  two component transcriptional regulator  33.03 
 
 		 227 aa  123  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.177006  normal  0.889846 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0124  two component transcriptional regulator  31.19 
 
 		 221 aa  122  3e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08510  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  31.84 
 
 		 227 aa  122  4e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.103906  normal  0.575645 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8879  response regulator receiver protein  32.89 
 
 		 235 aa  122  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1871  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.84 
 
 		 226 aa  122  4e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.105791  normal  0.266081 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6194  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.7 
 
 		 222 aa  122  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0076  two component transcriptional regulator  31.65 
 
 		 223 aa  122  4e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.225452 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4252  two component transcriptional regulator  34.15 
 
 		 228 aa  122  5e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.542635  unclonable  0.0000000142406 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>