239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0126 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0126  uracil-DNA glycosylase  100 
 
 		 229 aa  462  1e-129  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.560482  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0081  uracil-DNA glycosylase  73.13 
 
 		 231 aa  342  2e-93  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.110525  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0121  uracil-DNA glycosylase  72.69 
 
 		 231 aa  340  1e-92  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0093  uracil-DNA glycosylase  72.25 
 
 		 231 aa  337  9.999999999999999e-92  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0112  uracil-DNA glycosylase  63.6 
 
 		 232 aa  300  1e-80  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0347  uracil-DNA glycosylase  63.16 
 
 		 235 aa  293  2e-78  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1822  uracil-DNA glycosylase  62.28 
 
 		 230 aa  292  3e-78  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1111  uracil-DNA glycosylase  62.28 
 
 		 231 aa  285  2.9999999999999996e-76  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2726  uracil-DNA glycosylase  57.21 
 
 		 223 aa  267  1e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4770  uracil-DNA glycosylase  54.71 
 
 		 231 aa  252  3e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.740506  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54590  uracil-DNA glycosylase  54.71 
 
 		 231 aa  252  3e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000185097  normal  0.0296541 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2992  uracil-DNA glycosylase  51.13 
 
 		 235 aa  251  8.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13610  uracil-DNA glycosylase  51.32 
 
 		 232 aa  250  1e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4397  uracil-DNA glycosylase  52.91 
 
 		 230 aa  246  2e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3241  uracil-DNA glycosylase  51.13 
 
 		 233 aa  246  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0198  uracil-DNA glycosylase  53.18 
 
 		 221 aa  244  6.999999999999999e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.495889  normal  0.174961 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1058  uracil-DNA glycosylase  55.05 
 
 		 225 aa  244  8e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1413  uracil-DNA glycosylase  52.02 
 
 		 230 aa  243  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1381  uracil-DNA glycosylase  52.47 
 
 		 229 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.541157  normal  0.225249 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4308  uracil-DNA glycosylase  52.02 
 
 		 230 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0951  uracil-DNA glycosylase  55.5 
 
 		 225 aa  242  3e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1054  uracil-DNA glycosylase  51.57 
 
 		 230 aa  240  1e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4236  uracil-DNA glycosylase  52.02 
 
 		 230 aa  239  2e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0808  uracil-DNA glycosylase  51.11 
 
 		 231 aa  238  4e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3970  uracil-DNA glycosylase  52.02 
 
 		 230 aa  238  5.999999999999999e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.439338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1349  uracil-DNA glycosylase  50.67 
 
 		 231 aa  238  6.999999999999999e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0400  hypothetical protein  51.36 
 
 		 220 aa  238  8e-62  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2796  uracil-DNA glycosylase  51.14 
 
 		 228 aa  237  1e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.416019  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2820  uracil-DNA glycosylase  47.96 
 
 		 241 aa  237  1e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.840691 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1193  uracil-DNA glycosylase  52.51 
 
 		 228 aa  236  2e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00106549  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3082  uracil-DNA glycosylase  52.05 
 
 		 228 aa  236  3e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0349858  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1057  uracil-DNA glycosylase  51.63 
 
 		 228 aa  235  4e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0610651  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1676  uracil-DNA glycosylase  50 
 
 		 245 aa  234  8e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0536187  normal  0.595891 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1084  uracil-DNA glycosylase  52.09 
 
 		 240 aa  232  3e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000321985  hitchhiker  0.00000000131635 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3560  uracil-DNA glycosylase  48.42 
 
 		 233 aa  232  4.0000000000000004e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3454  uracil-DNA glycosylase  50.67 
 
 		 229 aa  232  5e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0594128 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2586  uracil-DNA glycosylase  50.68 
 
 		 222 aa  230  1e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1556  uracil-DNA glycosylase  50.22 
 
 		 225 aa  231  1e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.478183 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1590  uracil-DNA glycosylase  49.78 
 
 		 269 aa  230  1e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000051966  hitchhiker  0.00000589305 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1088  uracil-DNA glycosylase  50.23 
 
 		 229 aa  229  3e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0467841  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2737  uracil-DNA glycosylase  50.23 
 
 		 229 aa  229  3e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000100069  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1097  uracil-DNA glycosylase  50.23 
 
 		 229 aa  229  3e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00580941  normal  0.146724 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2956  uracil-DNA glycosylase  50.23 
 
 		 229 aa  229  3e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0497126  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02474  uracil-DNA glycosylase  50.23 
 
 		 229 aa  228  5e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.386825  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0237  uracil-DNA glycosylase  48.88 
 
 		 222 aa  228  5e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3683  uracil-DNA glycosylase  50.7 
 
 		 227 aa  228  5e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000721221  normal  0.0564802 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02438  hypothetical protein  50.23 
 
 		 229 aa  228  5e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.372619  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2733  uracil-DNA glycosylase  49.77 
 
 		 229 aa  227  1e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00800854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03712  uracil-DNA glycosylase  48.65 
 
 		 241 aa  227  1e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2867  uracil-DNA glycosylase  49.77 
 
 		 229 aa  227  1e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0155178  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3817  uracil-DNA glycosylase  49.77 
 
 		 229 aa  227  1e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.01333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3065  uracil-DNA glycosylase  50.23 
 
 		 229 aa  225  4e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.550581  hitchhiker  0.000204445 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1497  uracil-DNA glycosylase  48.7 
 
 		 247 aa  225  5.0000000000000005e-58  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0754216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2551  uracil-DNA glycosylase  50.69 
 
 		 224 aa  224  8e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2757  uracil-DNA glycosylase  48.42 
 
 		 229 aa  224  9e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00257883  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1173  uracil-DNA glycosylase  51.6 
 
 		 228 aa  224  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0255291  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0009  uracil-DNA glycosylase  51.58 
 
 		 224 aa  224  1e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3595  uracil-DNA glycosylase  51.6 
 
 		 228 aa  224  1e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2863  uracil-DNA glycosylase  47.96 
 
 		 229 aa  223  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.466868  normal  0.345403 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1218  uracil-DNA glycosylase  50.24 
 
 		 218 aa  223  2e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.145482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3670  uracil-DNA glycosylase  49.32 
 
 		 237 aa  223  2e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.769625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2859  uracil-DNA glycosylase  47.96 
 
 		 229 aa  223  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.721357  normal  0.53223 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2841  uracil-DNA glycosylase  47.96 
 
 		 229 aa  223  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.619436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2288  uracil-DNA glycosylase  50.68 
 
 		 223 aa  223  2e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.4813e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1938  uracil-DNA glycosylase  49.32 
 
 		 226 aa  223  2e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104572  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004450  uracil-DNA glycosylase  48.4 
 
 		 226 aa  223  2e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0252327  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2975  uracil-DNA glycosylase  47.96 
 
 		 229 aa  223  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1121  uracil-DNA glycosylase  51.6 
 
 		 228 aa  223  3e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0977602  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0465  uracil-DNA glycosylase  48.21 
 
 		 226 aa  222  3e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.878798  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2269  uracil-DNA glycosylase  46.64 
 
 		 243 aa  222  3e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3206  uracil-DNA glycosylase  48 
 
 		 261 aa  222  4.9999999999999996e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.240216 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0965  uracil-DNA glycosylase  46.12 
 
 		 221 aa  221  7e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0201981  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1283  uracil-DNA glycosylase  49.3 
 
 		 216 aa  221  8e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0138995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1067  uracil-DNA glycosylase  45.66 
 
 		 221 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000655251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03325  uracil-DNA glycosylase  50.23 
 
 		 221 aa  219  1.9999999999999999e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.100053  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5297  uracil-DNA glycosylase  47.25 
 
 		 225 aa  219  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.355342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2059  uracil-DNA glycosylase  47.2 
 
 		 245 aa  219  1.9999999999999999e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.963745 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3577  uracil-DNA glycosylase  47.93 
 
 		 222 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1034  uracil-DNA glycosylase  45.66 
 
 		 221 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000379797  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0246  uracil-DNA glycosylase  46.36 
 
 		 221 aa  219  3.9999999999999997e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00388102 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0613  uracil-DNA glycosylase  50.7 
 
 		 222 aa  218  3.9999999999999997e-56  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2152  uracil-DNA glycosylase  46.19 
 
 		 253 aa  219  3.9999999999999997e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.957234  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0054  uracil-DNA glycosylase  51.34 
 
 		 223 aa  218  5e-56  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3325  uracil-DNA glycosylase  45.66 
 
 		 221 aa  218  7e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00364236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2241  uracil-DNA glycosylase  45.74 
 
 		 253 aa  218  7e-56  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12267  predicted protein  45.95 
 
 		 227 aa  217  1e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3073  uracil-DNA glycosylase  45.83 
 
 		 222 aa  217  1e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.906111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0481  uracil-DNA glycosylase  48.39 
 
 		 223 aa  216  2e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0802006  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2912  uracil-DNA glycosylase  47.27 
 
 		 221 aa  216  2e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0496469  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0397  uracil-DNA glycosylase  49.77 
 
 		 229 aa  216  2e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.359974  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_94976  predicted protein  47.49 
 
 		 244 aa  216  2e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.978497 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00945  uracil-DNA glycosylase  47.93 
 
 		 226 aa  215  5.9999999999999996e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1229  putative uracil-DNA glycosylase  48.61 
 
 		 218 aa  214  5.9999999999999996e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2096  uracil-DNA glycosylase  46.79 
 
 		 229 aa  214  8e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1562  uracil-DNA glycosylase  48.87 
 
 		 223 aa  213  9.999999999999999e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.118173  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10973  putative uracil-DNA glycosylase  48.18 
 
 		 221 aa  214  9.999999999999999e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3318  uracil-DNA glycosylase  48.13 
 
 		 228 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0407603  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3221  uracil-DNA glycosylase  44.7 
 
 		 221 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00088309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2929  uracil-DNA glycosylase  47.73 
 
 		 219 aa  211  4.9999999999999996e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000416129  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3484  uracil-DNA glycosylase  46.58 
 
 		 229 aa  211  7.999999999999999e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>