194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0033 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_0033  conserved hypothetical protein, putative MoxR/RavA-like ATPase  100 
 
 
560 aa  1133  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.836793  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2809  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  49.35 
 
 
526 aa  290  5e-77  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.30011e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0964  Pyrrolo-quinoline quinone  50 
 
 
543 aa  284  4e-75  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2515  ATPase associated with various cellular activities  51.4 
 
 
530 aa  277  4e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.152961  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0059  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  43.57 
 
 
528 aa  265  1e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.94981e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4243  regulatory ATPase RavA  44.04 
 
 
499 aa  249  1e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4533  regulatory ATPase RavA  43.79 
 
 
499 aa  249  1e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.991021  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4180  regulatory ATPase RavA  44.12 
 
 
498 aa  246  8e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4903  regulatory ATPase RavA  44.52 
 
 
523 aa  246  1e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.036099  hitchhiker  0.000827592 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4212  regulatory ATPase RavA  45.14 
 
 
512 aa  244  4e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0005  regulatory ATPase RavA  45.14 
 
 
512 aa  243  4e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0005  regulatory ATPase RavA  45.14 
 
 
512 aa  244  4e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.016355  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4114  regulatory ATPase RavA  42.42 
 
 
498 aa  241  2e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.972847  normal  0.113412 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5182  regulatory ATPase RavA  42.42 
 
 
498 aa  241  2e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0691971  normal  0.286822 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3962  regulatory ATPase RavA  42.76 
 
 
506 aa  241  3e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4221  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  42.76 
 
 
498 aa  241  3e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4248  regulatory ATPase RavA  42.76 
 
 
498 aa  241  4e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0104649 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03630  fused predicted transcriptional regulator: sigma54 activator protein/conserved protein  42.76 
 
 
498 aa  241  4e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0583  hypothetical protein  41.91 
 
 
546 aa  240  4e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.998789  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4262  regulatory ATPase RavA  42.76 
 
 
498 aa  240  4e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.966973  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4091  regulatory ATPase RavA  44.41 
 
 
498 aa  240  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03574  hypothetical protein  42.76 
 
 
498 aa  241  4e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4106  regulatory ATPase RavA  44.41 
 
 
498 aa  241  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0538365  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0704  hypothetical protein  42.67 
 
 
552 aa  240  4e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4162  regulatory ATPase RavA  44.06 
 
 
498 aa  239  7e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.598382  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4212  regulatory ATPase RavA  44.06 
 
 
498 aa  239  9e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.390449  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4271  regulatory ATPase RavA  44.06 
 
 
498 aa  239  9e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.64828  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4118  regulatory ATPase RavA  43.75 
 
 
498 aa  237  3e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.428574  normal  0.0179625 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3980  regulatory ATPase RavA  41.29 
 
 
499 aa  234  2e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000048  putative regulator protein  42.76 
 
 
553 aa  234  5e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.59899  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05670  hypothetical protein  42.86 
 
 
553 aa  229  1e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4175  regulatory ATPase RavA  42.7 
 
 
468 aa  226  9e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1237  putative regulatory protein  37.54 
 
 
506 aa  218  3e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2921  ATPase  37.5 
 
 
489 aa  210  6e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.794922  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1702  ATPase  37.22 
 
 
509 aa  204  4e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.383642  normal  0.0523367 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1812  ATPase  36.89 
 
 
509 aa  202  2e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0331126 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0230  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  37.71 
 
 
375 aa  196  6e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1893  ATPase  37.54 
 
 
464 aa  191  2e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.103077 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33673  predicted protein  35.37 
 
 
547 aa  188  2e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.229173  normal  0.12598 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3266  ATPase AAA-5  35.96 
 
 
382 aa  185  1e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.580466  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3329  MoxR-related protein  35.16 
 
 
498 aa  182  1e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.271862  normal  0.0441564 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3511  MoxR-like ATPase  33.74 
 
 
466 aa  181  2e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0100798  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1120  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  34.71 
 
 
389 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0040  lipoprotein  56.25 
 
 
898 aa  155  2e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0943  lipoprotein  54.41 
 
 
754 aa  155  3e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  2.09151e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2706  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  33.12 
 
 
477 aa  154  5e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.055583  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1695  ATPase  33.55 
 
 
376 aa  153  7e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.122813  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1378  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  34.04 
 
 
436 aa  153  9e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4815  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.48 
 
 
407 aa  151  3e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.498459  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0815  lipoprotein  50 
 
 
762 aa  148  3e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.315298  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0175  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  35.48 
 
 
382 aa  142  1e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0942  lipoprotein  53.68 
 
 
741 aa  143  1e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00629705  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2784  lipoprotein  55.81 
 
 
486 aa  142  2e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.91799e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0193  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.71 
 
 
387 aa  141  3e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0944  lipoprotein  49.1 
 
 
609 aa  141  4e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.528122  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0668  ATPase  33.79 
 
 
390 aa  139  1e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00327947 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2788  lipoprotein  45.96 
 
 
800 aa  139  1e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5828  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.74 
 
 
383 aa  134  4e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.205285  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2790  lipoprotein  46.2 
 
 
862 aa  133  1e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2442  lipoprotein  49.26 
 
 
789 aa  132  1e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  5.31268e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2789  lipoprotein  52.7 
 
 
395 aa  132  2e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0262  conserved hypothetical protein (DUF285 domain protein)  48.89 
 
 
200 aa  131  3e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0047  conserved hypothetical protein (DUF285 domain protein)  50 
 
 
204 aa  130  7e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2786  lipoprotein  42.69 
 
 
857 aa  130  7e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.28029e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0226  conserved hypothetical protein (DUF285 domain protein)  50.77 
 
 
219 aa  129  2e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.713864  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2783  lipoprotein  54.69 
 
 
180 aa  128  2e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.40646e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0718  lipoprotein  42.24 
 
 
774 aa  121  3e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0814  lipoprotein  45.03 
 
 
166 aa  118  4e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0458839  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1758  lipoprotein  45.53 
 
 
933 aa  112  2e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.25404 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2787  lipoprotein  47.41 
 
 
862 aa  109  1e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.22963e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0309  hypothetical protein  47.37 
 
 
309 aa  107  5e-22  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0291  hypothetical protein  50.51 
 
 
182 aa  104  3e-21  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0186  hypothetical protein  43.52 
 
 
913 aa  104  4e-21  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0170  hypothetical protein  53.33 
 
 
250 aa  104  4e-21  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0310  hypothetical protein  47.11 
 
 
300 aa  102  1e-20  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1823  ATPase  36.9 
 
 
368 aa  102  2e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0297  ATPase  40.14 
 
 
368 aa  102  2e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0360  ATPase  35.71 
 
 
368 aa  100  7e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0981  ATPase  34.13 
 
 
368 aa  99.8  1e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  1.55224e-07 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1853  lipoprotein  44.76 
 
 
558 aa  100  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0367597  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0289  hypothetical protein  43.52 
 
 
226 aa  99  2e-19  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_89715  predicted protein  40.31 
 
 
3060 aa  99.4  2e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.288694 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0302  hypothetical protein  45.22 
 
 
226 aa  99  2e-19  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.36288  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0311  hypothetical protein  45.05 
 
 
323 aa  98.2  3e-19  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1906  lipoprotein  45.45 
 
 
647 aa  97.8  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0287  putative lipoprotein  43.33 
 
 
272 aa  97.4  7e-19  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0300  hypothetical protein  41.73 
 
 
497 aa  97.1  8e-19  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.39136  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0622  hypothetical protein  40.74 
 
 
509 aa  96.3  1e-18  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0735448  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1867  lipoprotein  39.44 
 
 
634 aa  96.3  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0288  hypothetical protein  48 
 
 
190 aa  95.5  2e-18  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0720  putative lipoprotein  43.75 
 
 
405 aa  94.7  3e-18  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.298254  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1086  ATPase  35.66 
 
 
379 aa  94.7  3e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.631223  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0276  hypothetical protein  40 
 
 
173 aa  94  7e-18  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.455861  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12591  hypothetical protein  44.35 
 
 
1214 aa  93.6  9e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0293  hypothetical protein  47.25 
 
 
251 aa  92  2e-17  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.72575  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119405  Lipoprotein Q-related gene  35.25 
 
 
2415 aa  92  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0370764  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0312  putative lipoprotein  38.94 
 
 
371 aa  90.5  7e-17  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.386247  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1298  putative lipoprotein  43.4 
 
 
288 aa  90.5  8e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0292  hypothetical protein  46.15 
 
 
250 aa  89.7  1e-16  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.997759  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0721  putative lipoprotein  37.5 
 
 
414 aa  90.1  1e-16  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.327009  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>