More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2476 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2476  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 110 aa  223  9e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3223  ArsR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 123 aa  120  6e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.675106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4302  ArsR family transcriptional regulator  60.64 
 
 		 106 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3721  ArsR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 104 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0645821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4701  regulatory protein, ArsR  49.02 
 
 		 106 aa  113  7.999999999999999e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.593544  normal  0.304994 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4201  regulatory protein, ArsR  54.29 
 
 		 106 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.541615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1211  transcriptional regulator, ArsR family  49.09 
 
 		 113 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48910  ArsR family regulatory protein  55.43 
 
 		 107 aa  100  7e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.316349  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0234  ArsR family transcriptional regulator  47.52 
 
 		 112 aa  98.6  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3459  ArsR family transcriptional regulator  50.53 
 
 		 112 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0333  ArsR family transcriptional regulator  50.54 
 
 		 104 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6240  ArsR family transcriptional regulator  50.55 
 
 		 94 aa  94.7  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.668362  normal  0.873171 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1609  regulatory protein ArsR  49.48 
 
 		 110 aa  93.2  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.020188  normal  0.119159 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2615  ArsR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 119 aa  92.4  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.237547  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6792  ArsR family transcriptional regulator  55.13 
 
 		 108 aa  91.3  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.439051  normal  0.0283932 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1543  transcription regulator protein  45.92 
 
 		 121 aa  89  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0436972 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0961  regulatory protein, ArsR  47.42 
 
 		 135 aa  88.6  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2014  transcriptional regulator, ArsR family  47.25 
 
 		 121 aa  88.6  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.413816  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1706  transcriptional regulator, ArsR family  47.25 
 
 		 121 aa  88.2  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.09956  normal  0.924299 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2727  regulatory protein, ArsR  43.43 
 
 		 98 aa  87.8  4e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000369896  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0576  transcriptional activator HlyU  40.22 
 
 		 103 aa  87.8  5e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000103894  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5676  ArsR family transcriptional regulator  47.31 
 
 		 106 aa  87.4  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2894  transcriptional regulator, ArsR family protein  40.4 
 
 		 98 aa  87.4  6e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0578791  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1410  transcriptional regulator, ArsR family  45.65 
 
 		 107 aa  87  8e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2435  ArsR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 107 aa  87  8e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.285599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004423  transcriptional activator HlyU  42.42 
 
 		 100 aa  86.3  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000188739  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0210  transcriptional activator HlyU  46.91 
 
 		 85 aa  86.7  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000976206  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00976  hypothetical protein  43 
 
 		 101 aa  86.3  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0037  ArsR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 102 aa  85.5  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.139091 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3554  ArsR family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 116 aa  85.1  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4035  ArsR family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 116 aa  85.1  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.137887 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3538  transcriptional regulator HlyU  40.4 
 
 		 98 aa  84.3  4e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0025  ArsR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 101 aa  84.7  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1117  regulatory protein ArsR  40.4 
 
 		 98 aa  84.3  4e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000362609  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1884  ArsR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 116 aa  84.7  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.172075 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1050  regulatory protein, ArsR  40.4 
 
 		 98 aa  84.3  4e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000242354  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1151  ArsR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 98 aa  84.3  4e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000355977  normal  0.185077 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2961  ArsR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 98 aa  84.3  4e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000318119  normal  0.703465 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3043  ArsR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 98 aa  84.3  4e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000176438  normal  0.676383 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3239  transcriptional regulator, ArsR family  40.4 
 
 		 98 aa  84.3  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00078895  normal  0.52452 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1055  regulatory protein, ArsR  40.4 
 
 		 98 aa  84.3  4e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.584265  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3141  ArsR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 98 aa  84.3  4e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000177762  normal  0.988511 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1079  ArsR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 104 aa  84.3  5e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000795282  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1569  transcriptional regulator ArsR family  42.11 
 
 		 114 aa  84  6e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4153  transcriptional regulator, ArsR family  48.35 
 
 		 119 aa  84.3  6e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0920  transcriptional regulator HlyU  39.39 
 
 		 98 aa  84  6e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000331953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1095  ArsR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 98 aa  83.6  8e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000620503  normal  0.070685 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1617  ArsR family transcriptional regulator  45.98 
 
 		 115 aa  83.6  8e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.755746  normal  0.662554 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2367  regulatory protein ArsR  44.83 
 
 		 97 aa  83.6  9e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.74667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4659  regulatory protein ArsR  44.57 
 
 		 115 aa  83.6  9e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0363  regulatory protein, ArsR  43.88 
 
 		 111 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000621973 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1287  ArsR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 98 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000165957  normal  0.329148 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2074  ArsR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 114 aa  82  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.362278  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2896  regulatory protein ArsR  51.16 
 
 		 146 aa  82.4  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.669424 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0456  ArsR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 107 aa  81.6  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1717  ArsR family transcriptional regulator  44.21 
 
 		 122 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.805435  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0396  ArsR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 107 aa  82  0.000000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1190  ArsR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 98 aa  82  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00010661  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0026  ArsR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 102 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1996  ArsR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 114 aa  81.6  0.000000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.422542  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0024  ArsR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 101 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000555304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0026  ArsR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 101 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.849172  normal  0.018094 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1683  ArsR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 113 aa  80.5  0.000000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0029  ArsR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 102 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000481298  hitchhiker  0.000000745632 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0020  regulatory protein, ArsR  39.33 
 
 		 101 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4146  regulatory protein, ArsR  46.15 
 
 		 113 aa  80.1  0.000000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.962591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0060  transcription regulator ArsR  46.07 
 
 		 227 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0028  regulatory protein, ArsR  37.63 
 
 		 102 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000136281  normal  0.0492639 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2812  transcriptional regulator  44.21 
 
 		 111 aa  79.7  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.158239 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3369  ArsR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 116 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.176859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2105  ArsR family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 100 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0205  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 104 aa  79.7  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0854  regulatory protein, ArsR  40.82 
 
 		 133 aa  80.1  0.00000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229848 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0021  regulatory protein ArsR  37.37 
 
 		 102 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00282375  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0025  ArsR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 102 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00398711  normal  0.0110166 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3285  transcriptional regulator ArsR family  44.83 
 
 		 105 aa  79.3  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0026  regulatory protein, ArsR  37.37 
 
 		 102 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000871967  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0023  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 102 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000124872  hitchhiker  0.000733869 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0021  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 102 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000364753  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1306  ArsR family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 109 aa  79.3  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.680406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0025  transcriptional regulator, ArsR family  37.37 
 
 		 102 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.111257  hitchhiker  0.00000153005 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1236  ArsR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 101 aa  78.6  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118736  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1917  regulatory protein, ArsR  43.62 
 
 		 117 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.984874 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1050  ArsR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 141 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1877  ArsR family transcriptional regulator  43.53 
 
 		 103 aa  78.6  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.42284  hitchhiker  0.00584724 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1937  ArsR family transcriptional regulator  45.88 
 
 		 107 aa  78.6  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01281  transcriptional regulator, ArsR family protein  42.35 
 
 		 87 aa  78.6  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000457227  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1425  regulatory protein, ArsR  50.67 
 
 		 119 aa  78.6  0.00000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0793  regulatory protein, ArsR  38.46 
 
 		 105 aa  78.6  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0018  transcriptional regulator, ArsR family protein  39.33 
 
 		 101 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.591177  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2570  transcriptional regulator, ArsR family  45.12 
 
 		 116 aa  78.2  0.00000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.525775 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0018  regulatory protein, ArsR  36.73 
 
 		 102 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.413678  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1791  ArsR family transcriptional regulator  43.02 
 
 		 96 aa  77.8  0.00000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2068  ArsR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 96 aa  77.8  0.00000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.887596  normal  0.21575 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3331  regulatory protein ArsR  41.3 
 
 		 116 aa  77  0.00000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277588  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0586  ArsR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 105 aa  77.4  0.00000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0937  ArsR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 115 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1900  ArsR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 115 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.428282  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1814  ArsR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 115 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.978602  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0445  ArsR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 115 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>