More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0153 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0153  ybaK/ebsC protein  100 
 
 		 157 aa  310  4.999999999999999e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.548766  normal  0.0477422 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1120  hypothetical protein  73.03 
 
 		 157 aa  224  3e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4290  ybaK/ebsC protein  71.9 
 
 		 157 aa  218  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.780598 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2425  ybaK/ebsC protein  71.63 
 
 		 157 aa  217  6e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2421  ybaK/ebsC protein  71.52 
 
 		 157 aa  216  7.999999999999999e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.332084 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3507  ybaK/ebsC protein  73.94 
 
 		 157 aa  216  8.999999999999998e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4554  ybaK/ebsC protein  72.34 
 
 		 157 aa  211  4.9999999999999996e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0136  hypothetical protein  69.01 
 
 		 157 aa  209  9e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4093  hypothetical protein  71.05 
 
 		 157 aa  203  9e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.889047 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1012  ybaK/ebsC protein  64.52 
 
 		 157 aa  202  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3668  hypothetical protein  65.81 
 
 		 157 aa  201  3e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1328  hypothetical protein  66 
 
 		 158 aa  185  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0917031  normal  0.183333 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4777  ybaK/ebsC protein  65.79 
 
 		 158 aa  182  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.339025  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3462  ybaK/ebsC protein  62.58 
 
 		 157 aa  180  5.0000000000000004e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00996809 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2876  ybaK/ebsC protein  63.57 
 
 		 166 aa  179  1e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.10674 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3407  ybaK/ebsC protein  59.87 
 
 		 158 aa  174  5e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4083  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  56.95 
 
 		 165 aa  169  9e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0122906 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1391  ybaK/ebsC protein  62.16 
 
 		 166 aa  165  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167107  normal  0.20271 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04560  YbaK/ebsC protein  57.55 
 
 		 157 aa  157  7e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.647549  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10900  ybaK/ebsC protein  53.96 
 
 		 170 aa  147  6e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.882195 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5733  ybaK/ebsC protein  52.17 
 
 		 165 aa  143  8.000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3047  ybaK/ebsC protein  53.28 
 
 		 163 aa  123  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.326078  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4234  ybaK/ebsC protein  44.44 
 
 		 160 aa  120  5e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.253359  normal  0.089415 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3844  ybaK/ebsC protein  43.87 
 
 		 160 aa  120  6e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0012  ybaK/ebsC protein  42.11 
 
 		 157 aa  119  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0187594 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1593  hypothetical protein  46.98 
 
 		 163 aa  119  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0228  hypothetical protein  44.23 
 
 		 169 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.822642  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1664  ybaK/ebsC protein  50.7 
 
 		 170 aa  119  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.773078  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2376  ybaK/ebsC protein  51.45 
 
 		 169 aa  119  1.9999999999999998e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1077  ybaK/ebsC protein  46.98 
 
 		 163 aa  118  3e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.3293  normal  0.584525 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1201  ybaK/ebsC protein  45.32 
 
 		 155 aa  117  3.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00297582  hitchhiker  0.00069795 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2545  hypothetical protein  46.62 
 
 		 163 aa  117  4.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6293  ybaK/ebsC protein  51.09 
 
 		 160 aa  116  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2906  YbaK/EbsC protein  45.99 
 
 		 166 aa  115  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334796  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1181  ybaK/ebsC protein  44.87 
 
 		 166 aa  114  3.9999999999999997e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0675087  normal  0.344163 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1105  ybaK/ebsC protein  45.11 
 
 		 162 aa  114  3.9999999999999997e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1431  ybaK/ebsC protein  45.26 
 
 		 164 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.867561 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2416  ybaK/ebsC protein  45.95 
 
 		 163 aa  114  6e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2899  ybaK/ebsC protein  47.45 
 
 		 164 aa  113  7.999999999999999e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000923134  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2822  ybaK/ebsC protein  45.27 
 
 		 163 aa  113  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.556121 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3773  ybaK/ebsC protein  44.9 
 
 		 163 aa  114  7.999999999999999e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4790  ybaK/ebsC protein  44.9 
 
 		 164 aa  113  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.170167  normal  0.9261 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3147  ybaK/ebsC protein  44.52 
 
 		 160 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.317224  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1850  ybaK/ebsC protein  46.76 
 
 		 167 aa  112  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3210  ybaK/ebsC protein  40.26 
 
 		 163 aa  111  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.489164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3248  ybaK/ebsC protein  43.84 
 
 		 160 aa  111  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0893105  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0752  hypothetical protein  39.61 
 
 		 163 aa  111  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0146  hypothetical protein  38.36 
 
 		 162 aa  112  3e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2761  hypothetical protein  44.59 
 
 		 187 aa  111  3e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0135  hypothetical protein  37.74 
 
 		 162 aa  111  4.0000000000000004e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.248182 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3049  hypothetical protein  45.32 
 
 		 160 aa  111  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1696  ybaK/ebsC protein  41.5 
 
 		 168 aa  111  5e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0180556 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2065  ybaK/ebsC protein  42.75 
 
 		 154 aa  110  6e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2754  ybaK/ebsC protein  46.62 
 
 		 166 aa  110  6e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.591195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2696  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated protein  42.86 
 
 		 161 aa  110  9e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2244  ybaK/ebsC protein  45.58 
 
 		 166 aa  110  9e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.639833  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3039  hypothetical protein  43.23 
 
 		 156 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.499163  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2605  ybaK/ebsC protein  42.21 
 
 		 163 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0021  YbaK/EbsC protein  41.43 
 
 		 155 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000866016 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0531  YbaK/EbsC protein  41.29 
 
 		 157 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.969939  normal  0.0653141 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3222  hypothetical protein  39.35 
 
 		 159 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0785  ybaK/ebsC protein  40.79 
 
 		 157 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2585  ybaK/ebsC protein  47.48 
 
 		 166 aa  108  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0115756 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0470  YbaK/ebsC protein  39.49 
 
 		 166 aa  109  2.0000000000000002e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2476  ybaK/ebsC protein  42.21 
 
 		 163 aa  108  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0283203 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0518  hypothetical protein  44.59 
 
 		 163 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0591601  normal  0.512075 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0912  ybaK/ebsC protein  41.18 
 
 		 160 aa  107  5e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0961985  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3088  YbaK/EbsC protein  44.14 
 
 		 160 aa  107  8.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1148  hypothetical protein  41.3 
 
 		 159 aa  107  8.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0654966  hitchhiker  0.000000339512 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3903  hypothetical protein  42.03 
 
 		 156 aa  106  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.531772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0576  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  43.33 
 
 		 163 aa  106  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128455  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0525  ybaK/ebsC protein  40.65 
 
 		 175 aa  106  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.661143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5889  hypothetical protein  42.21 
 
 		 163 aa  106  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.158473 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0113  ybaK/ebsC protein  41.3 
 
 		 155 aa  106  1e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14060  ybaK/ebsC protein  43.45 
 
 		 163 aa  106  1e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00161017  normal  0.469226 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0525  hypothetical protein  39.86 
 
 		 159 aa  105  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4166  ybaK/ebsC protein  42.65 
 
 		 156 aa  106  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2973  ybaK/ebsC protein  39.01 
 
 		 158 aa  105  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4530  hypothetical protein  43.48 
 
 		 156 aa  105  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.666338  normal  0.145065 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30720  ybaK/ebsC protein  46.05 
 
 		 158 aa  105  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.685744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01257  hypothetical protein  41.84 
 
 		 157 aa  106  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2581  ybaK/ebsC protein  41.56 
 
 		 163 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.635431  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1093  hypothetical protein  38.06 
 
 		 159 aa  105  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0573  hypothetical protein  39.13 
 
 		 159 aa  105  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3195  ybaK/ebsC protein  45.77 
 
 		 161 aa  104  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.827708  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3090  ybaK/ebsC protein  37.41 
 
 		 155 aa  104  4e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00342065  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1741  ybaK/ebsC protein  42.14 
 
 		 160 aa  104  4e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.542392 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0602  hypothetical protein  37.42 
 
 		 159 aa  104  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000350431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0548  hypothetical protein  37.42 
 
 		 159 aa  104  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0135035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0558  hypothetical protein  37.42 
 
 		 159 aa  104  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.743946  normal  0.562407 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0416  hypothetical protein  39.13 
 
 		 159 aa  104  5e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0541  hypothetical protein  37.42 
 
 		 159 aa  104  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0543  hypothetical protein  37.42 
 
 		 159 aa  104  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.243871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2557  ybaK/ebsC protein  40.91 
 
 		 163 aa  104  5e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004197  transcriptional regulator  41.13 
 
 		 157 aa  103  6e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.136904  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00432  hypothetical protein  39.13 
 
 		 159 aa  103  7e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.362307  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3129  ybaK/ebsC protein  39.13 
 
 		 159 aa  103  7e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.393401  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3135  hypothetical protein  39.13 
 
 		 159 aa  103  7e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.215151  unclonable  0.0000000116633 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00437  hypothetical protein  39.13 
 
 		 159 aa  103  7e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.34185  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0558  hypothetical protein  39.13 
 
 		 159 aa  103  7e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>