242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0019 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0019  scaffold protein Nfu/NifU  100 
 
 		 189 aa  389  1e-107  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.01661  normal  0.743316 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1823  scaffold protein Nfu/NifU  59.89 
 
 		 186 aa  223  9e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.266684  normal  0.103304 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3611  scaffold protein Nfu/NifU  60.64 
 
 		 201 aa  219  9.999999999999999e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2380  scaffold protein Nfu/NifU-like protein  57.98 
 
 		 192 aa  216  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0531  NifU domain-containing protein  57.53 
 
 		 184 aa  216  2e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0040  putative nifU protein  56.61 
 
 		 189 aa  215  2.9999999999999998e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15873  normal  0.567558 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4037  nitrogen-fixing NifU-like  57.89 
 
 		 189 aa  215  4e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3091  nitrogen-fixing NifU-like  55.08 
 
 		 187 aa  213  9.999999999999999e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.758224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3028  NifU domain-containing protein  55.08 
 
 		 187 aa  213  9.999999999999999e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0865  nitrogen-fixing NifU-like  57.22 
 
 		 187 aa  212  1.9999999999999998e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0779261 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2839  hypothetical protein  55.08 
 
 		 187 aa  212  2.9999999999999995e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0061746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0889  NifU domain-containing protein  56.99 
 
 		 186 aa  211  4.9999999999999996e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0368383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3531  nitrogen-fixing NifU-like  54.5 
 
 		 183 aa  210  1e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2071  nitrogen-fixing NifU-like protein  55.79 
 
 		 190 aa  209  1e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0389413  normal  0.471165 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1170  NifU family protein  55.5 
 
 		 192 aa  209  1e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.841091  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0153  scaffold protein Nfu/NifU  55.73 
 
 		 190 aa  209  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0430  hypothetical protein  56.15 
 
 		 186 aa  206  1e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.255854  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0140  NifU-related protein  56.25 
 
 		 190 aa  206  2e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0134  NifU-related protein  56.25 
 
 		 190 aa  206  2e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00825478  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3394  Scaffold protein Nfu/NifU  55.32 
 
 		 188 aa  205  4e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0024  Scaffold protein Nfu/NifU  54.79 
 
 		 188 aa  205  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.419851 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0036  Scaffold protein Nfu/NifU  53.72 
 
 		 188 aa  204  5e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.231277 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0036  scaffold protein Nfu/NifU  55.56 
 
 		 188 aa  204  8e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0881083  hitchhiker  0.0000181724 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4429  Scaffold protein Nfu/NifU  54.55 
 
 		 187 aa  203  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.021918  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2214  nitrogen-fixing NifU  57.22 
 
 		 186 aa  202  2e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.731458  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3522  Scaffold protein Nfu/NifU  53.72 
 
 		 188 aa  201  4e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.128195  normal  0.0920185 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3198  scaffold protein Nfu/NifU  53.72 
 
 		 188 aa  201  4e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.113842  normal  0.941743 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30771  predicted protein  54.5 
 
 		 206 aa  201  6e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.777457  normal  0.560204 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2279  NifU domain-containing protein  57.53 
 
 		 186 aa  201  7e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.473385  normal  0.588083 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0988  nitrogen-fixing NifU-like  54.45 
 
 		 195 aa  200  9.999999999999999e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0009  nitrogen-fixing NifU  53.85 
 
 		 190 aa  198  3e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.964123  normal  0.198527 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2900  Scaffold protein Nfu/NifU  53.72 
 
 		 187 aa  197  7.999999999999999e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.25177 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1775  NifU domain-containing protein  58.42 
 
 		 185 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.126577  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0463  nitrogen-fixing NifU-like  52.66 
 
 		 188 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0247  nitrogen-fixing NifU-like  53.89 
 
 		 188 aa  194  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3394  scaffold protein Nfu/NifU  53.48 
 
 		 187 aa  193  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.252706 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0457  Scaffold protein Nfu/NifU  54.44 
 
 		 188 aa  190  1e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0016  nitrogen-fixing NifU-like  51.09 
 
 		 191 aa  189  2e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00443934  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1075  NifU domain-containing protein  49.47 
 
 		 191 aa  188  4e-47  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.152457  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0585  nitrogen-fixing NifU-like  53.59 
 
 		 188 aa  186  1e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0644  scaffold protein Nfu/NifU  54.97 
 
 		 188 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.728561 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2095  Scaffold protein Nfu/NifU  54.21 
 
 		 187 aa  181  4.0000000000000006e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.724202  normal  0.959854 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1051  scaffold protein Nfu/NifU  55.56 
 
 		 187 aa  180  9.000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.906453  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00447  NifU-related protein (AFU_orthologue; AFUA_1G04680)  44.61 
 
 		 326 aa  164  5e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.215741  normal  0.563754 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0202  NifU domain-containing protein  44.44 
 
 		 186 aa  164  6.9999999999999995e-40  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.419863  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0817  NifU-like domain-containing protein  42.19 
 
 		 180 aa  163  1.0000000000000001e-39  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.946784  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01900  iron ion homeostasis-related protein, putative  47.62 
 
 		 309 aa  160  8.000000000000001e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16693  predicted protein  47.15 
 
 		 195 aa  157  1e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0800  nitrogen-fixing NifU, C-terminal  42.49 
 
 		 186 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0365  thioredoxin-related protein  43.72 
 
 		 191 aa  153  2e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.299726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82838  predicted protein  41.58 
 
 		 254 aa  152  2.9999999999999998e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0133189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76567  predicted protein  41.03 
 
 		 242 aa  137  7e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.000975228 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4882  nitrogen-fixing NifU domain protein  38.95 
 
 		 198 aa  132  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.436115  normal  0.113106 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2934  nitrogen-fixing NifU domain protein  40.86 
 
 		 183 aa  131  5e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0974289 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2479  nitrogen-fixing NifU domain protein  39.47 
 
 		 200 aa  126  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40084  normal  0.245689 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01075  NifU-like domain protein  35.48 
 
 		 305 aa  123  2e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1676  NifU domain-containing protein  37.89 
 
 		 299 aa  122  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.663631  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1955  nitrogen-fixing NifU domain protein  37.16 
 
 		 299 aa  122  3e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0722  nitrogen-fixing NifU domain protein  35.29 
 
 		 198 aa  118  6e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0513742 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0701  nitrogen-fixing NifU-like  30.98 
 
 		 186 aa  82.4  0.000000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1865  nitrogen-fixing NifU-like  32.07 
 
 		 186 aa  73.6  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0962  nitrogen-fixing NifU domain protein  40.85 
 
 		 81 aa  65.5  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.626846  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1070  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.25 
 
 		 76 aa  65.5  0.0000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1466  nitrogen-fixing NifU domain protein  43.06 
 
 		 73 aa  65.5  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0260  NifU domain-containing protein  40.62 
 
 		 74 aa  64.3  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2023  nitrogen-fixing NifU domain protein  40.85 
 
 		 81 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03110  nitrogen-fixing NifU domain protein  40 
 
 		 74 aa  62.8  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3554  NifU domain-containing protein  41.77 
 
 		 78 aa  62.4  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3484  nitrogen-fixing NifU domain protein  36 
 
 		 74 aa  62.4  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000024465  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5086  NifU domain-containing protein  41.77 
 
 		 78 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4821  NifU domain-containing protein  41.77 
 
 		 78 aa  62.4  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4659  NifU domain-containing protein  41.77 
 
 		 78 aa  62.4  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4678  NifU domain-containing protein  41.77 
 
 		 78 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5056  nifU domain protein  41.77 
 
 		 78 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0148  nifU domain protein  41.77 
 
 		 78 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5092  nifU domain protein  41.77 
 
 		 78 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5186  NifU domain-containing protein  41.77 
 
 		 78 aa  62.4  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5094  nifU domain protein  41.77 
 
 		 78 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4771  NifU domain-containing protein  41.77 
 
 		 78 aa  62.4  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0522  NifU domain-containing protein  47.69 
 
 		 80 aa  61.6  0.000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2988  nitrogen-fixing NifU domain protein  24.23 
 
 		 202 aa  62  0.000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0695  NifU domain-containing protein  47.54 
 
 		 75 aa  61.6  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.219318 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3614  nitrogen-fixing NifU domain protein  45.31 
 
 		 73 aa  61.2  0.000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187737  normal  0.20097 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0889  nitrogen-fixing NifU domain protein  46.77 
 
 		 72 aa  61.2  0.000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000213557  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0074  nitrogen-fixing NifU domain protein  45.95 
 
 		 87 aa  61.2  0.000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2034  nitrogen-fixing NifU domain protein  38.89 
 
 		 76 aa  60.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0936  NifU domain-containing protein  47.69 
 
 		 80 aa  61.2  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00633324  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0955  NifU domain-containing protein  47.69 
 
 		 80 aa  61.2  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.283464  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3402  nitrogen-fixing NifU-like  42.19 
 
 		 80 aa  60.5  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.168954 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0997  nitrogen-fixing NifU domain protein  48.39 
 
 		 77 aa  60.1  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.997138 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0723  NifU domain-containing protein  42.86 
 
 		 76 aa  59.7  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.603746 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1148  nitrogen-fixing NifU domain protein  38.89 
 
 		 79 aa  59.3  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.52272 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4246  Fe-S cluster assembly protein NifU  42.11 
 
 		 309 aa  59.3  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.451507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1119  nitrogen-fixing NifU domain protein  38.89 
 
 		 79 aa  59.3  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2284  NifU domain-containing protein  43.48 
 
 		 74 aa  59.3  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000278833  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3080  nitrogen-fixing NifU-like  44.44 
 
 		 74 aa  58.9  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1107  nitrogen-fixing NifU domain protein  48.33 
 
 		 77 aa  58.9  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0162394  hitchhiker  0.0000000000000133842 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2331  NifU-like protein  40.24 
 
 		 103 aa  58.9  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00196281  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04711  NifU-like protein  35.37 
 
 		 81 aa  58.2  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.265709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04381  NifU-like protein  37.5 
 
 		 81 aa  58.2  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.725479  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>