More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8355 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_8355  Methyltransferase type 11  100 
 
 
254 aa  517  1e-146  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0474  UbiE/COQ5 methyltransferase  41.41 
 
 
265 aa  168  7e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.715311 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6142  methyltransferase type 11  39.06 
 
 
261 aa  155  6e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.338244  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3409  type 11 methyltransferase  38.82 
 
 
263 aa  151  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.321771  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13375  methyltransferase  38.53 
 
 
243 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.352692 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1206  methyltransferase type 11  38.36 
 
 
239 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1223  methyltransferase type 11  38.36 
 
 
239 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.762545 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1233  methyltransferase type 11  38.36 
 
 
239 aa  119  6e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0606  Methyltransferase type 11  35.62 
 
 
254 aa  115  5e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0138058  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4877  methyltransferase type 11  37.34 
 
 
246 aa  115  6e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0888131 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1552  methyltransferase type 11  35.5 
 
 
242 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.093627 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2657  methyltransferase type 11  37.56 
 
 
257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1204  Methyltransferase type 11  33.47 
 
 
247 aa  110  3e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4965  hypothetical protein  34.22 
 
 
255 aa  105  7e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1050  methyltransferase type 11  42.57 
 
 
271 aa  105  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00394704 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0078  methyltransferase type 11  38.51 
 
 
259 aa  104  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4140  putative methyltransferase  35 
 
 
255 aa  103  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0454  Methyltransferase type 11  40 
 
 
243 aa  103  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.427949  normal  0.218232 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3523  Methyltransferase type 11  32.02 
 
 
257 aa  100  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2883  hypothetical protein  39.51 
 
 
257 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.369338  normal  0.369961 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2361  Methyltransferase type 11  35.08 
 
 
256 aa  96.3  5e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.775693  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2996  methyltransferase type 11  30.53 
 
 
273 aa  95.9  5e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0692  methyltransferase type 11  36.31 
 
 
252 aa  95.9  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2390  Methyltransferase type 11  45.39 
 
 
252 aa  94.7  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000447535 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1362  hypothetical protein  37.41 
 
 
251 aa  94  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.40676e-29 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8065  Methyltransferase type 11  44.2 
 
 
256 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.365468  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1326  hypothetical protein  37.41 
 
 
251 aa  92.8  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4001  Methyltransferase type 11  33.94 
 
 
248 aa  92  7e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0328  Methyltransferase type 11  36.71 
 
 
259 aa  92  9e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.729406  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1428  hypothetical protein  36.73 
 
 
251 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.097485  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6308  Methyltransferase type 11  35.37 
 
 
263 aa  91.7  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1725  Methyltransferase type 11  30.8 
 
 
256 aa  91.7  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.873166  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1188  hypothetical protein  36.05 
 
 
251 aa  90.5  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.304723  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1167  methyltransferase  36.05 
 
 
251 aa  90.5  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1169  methyltransferase  36.05 
 
 
251 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.374772  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1282  hypothetical protein  36.05 
 
 
251 aa  90.5  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.522123  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5097  methyltransferase type 11  36.02 
 
 
260 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.715377  normal  0.3355 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0618  Methyltransferase type 11  36.99 
 
 
249 aa  89.7  4e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.269288  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27240  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  31.84 
 
 
308 aa  88.6  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2163  Methyltransferase type 11  40.88 
 
 
284 aa  85.9  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.669447  normal  0.0704024 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3543  Methyltransferase type 11  31.23 
 
 
261 aa  85.1  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.535977 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0360  methyltransferase type 11  38.67 
 
 
275 aa  84.7  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00809  hypothetical protein  29.92 
 
 
242 aa  85.1  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.721636  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2364  Methyltransferase type 11  29.18 
 
 
245 aa  84.3  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.695358  decreased coverage  0.00329401 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0017  Methyltransferase type 11  39.13 
 
 
254 aa  82.8  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0407189 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2692  Methyltransferase type 11  42.4 
 
 
270 aa  81.3  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79255  normal  0.0821355 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3567  Methyltransferase type 11  37.33 
 
 
242 aa  77  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.197641  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07260  hypothetical protein  37.23 
 
 
255 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0663  hypothetical protein  36.5 
 
 
255 aa  75.5  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.323405  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4134  methyltransferase type 11  34.62 
 
 
267 aa  74.7  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5511  methyltransferase  30.95 
 
 
249 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.139687  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1418  putative methyltransferase  28.82 
 
 
259 aa  74.3  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.282901  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07070  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  39.47 
 
 
280 aa  72.8  0.000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.76501  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13690  putative methyltransferase  30 
 
 
249 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.784995  normal  0.84173 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0383  Methyltransferase type 11  31.16 
 
 
277 aa  72  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1533  Methyltransferase type 12  29.25 
 
 
259 aa  71.2  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295316  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1471  Methyltransferase type 11  33.58 
 
 
256 aa  71.2  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.240552 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0313  putative methyltransferase  29.07 
 
 
257 aa  70.5  0.00000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.459942  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2174  Methyltransferase type 11  32.61 
 
 
276 aa  70.1  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0827328  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  35.37 
 
 
268 aa  70.1  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  35.25 
 
 
268 aa  69.7  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2869  Methyltransferase type 11  36.5 
 
 
275 aa  69.7  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0457955  normal  0.647677 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  42.86 
 
 
312 aa  69.3  0.00000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1752  putative methyltransferase  28.24 
 
 
253 aa  69.3  0.00000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.610135  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0164  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.85 
 
 
207 aa  69.3  0.00000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1760  type 11 methyltransferase  36.29 
 
 
275 aa  68.9  0.00000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1518  methyltransferase type 11  33 
 
 
254 aa  68.9  0.00000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349113  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0132  Methyltransferase type 11  36.64 
 
 
256 aa  67.8  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0563  Methyltransferase type 11  35.61 
 
 
253 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.267542  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6503  Methyltransferase type 11  36.15 
 
 
255 aa  67  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1748  hypothetical protein  32.84 
 
 
253 aa  67.4  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.707104 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1987  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33 
 
 
254 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.199411  hitchhiker  0.00854034 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21420  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  41.59 
 
 
233 aa  67  0.0000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0478514  hitchhiker  0.0000156795 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0410  Methyltransferase type 11  31.21 
 
 
264 aa  67  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.371089 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48660  Methyltransferase type 11 protein  38.93 
 
 
254 aa  66.6  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.302894  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3418  methyltransferase type 11  36.18 
 
 
254 aa  66.2  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.268365  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0168  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.11 
 
 
207 aa  66.2  0.0000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1128  biotin synthesis protein BioC  44.44 
 
 
275 aa  65.5  0.0000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1198  SAM-dependent methyltransferase  40.86 
 
 
206 aa  65.5  0.0000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3772  methyltransferase type 11  32.51 
 
 
254 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2733  Methyltransferase type 11  30 
 
 
256 aa  65.5  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1629  hypothetical protein  28.65 
 
 
258 aa  65.5  0.0000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3369  Methyltransferase type 11  30 
 
 
256 aa  65.5  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.209889  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2718  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  41.88 
 
 
230 aa  65.1  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.566379 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1226  hypothetical protein  31.34 
 
 
249 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2169  hypothetical protein  30.46 
 
 
248 aa  65.1  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0210043 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29451  hypothetical protein  31.43 
 
 
249 aa  65.1  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1550  methyltransferase type 11  37.5 
 
 
254 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.326399 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1167  methyltransferase type 11  34.85 
 
 
256 aa  63.9  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.548943 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2918  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
264 aa  63.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.984998  hitchhiker  0.00373911 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2792  hypothetical protein  35.19 
 
 
250 aa  63.2  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3007  methyltransferase type 11  32.54 
 
 
246 aa  63.5  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.036599  normal  0.761462 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4465  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  42.72 
 
 
235 aa  63.5  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101456  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0395  biotin biosynthesis protein BioC  41.82 
 
 
272 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0883344  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4560  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.67 
 
 
258 aa  63.2  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2850  methylase  30.28 
 
 
235 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00782865  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5336  hypothetical protein  33.58 
 
 
274 aa  62.8  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0671975  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2809  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  30.3 
 
 
235 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2382  Methyltransferase type 11  36.03 
 
 
495 aa  62.8  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.571429  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.28 
 
 
236 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>