82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7613 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7613  hypothetical protein  100 
 
 
144 aa  293  5e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4591  hypothetical protein  38.93 
 
 
139 aa  79  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0395893  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2092  hypothetical protein  31.58 
 
 
160 aa  71.6  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.134179 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3789  hypothetical protein  39.53 
 
 
156 aa  71.2  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.267305  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4267  hypothetical protein  36.51 
 
 
133 aa  71.2  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.456235 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0033  hypothetical protein  35 
 
 
135 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.97728  normal  0.143375 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1988  hypothetical protein  33.58 
 
 
140 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.550562  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2053  hypothetical protein  33.58 
 
 
140 aa  62.8  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2007  hypothetical protein  33.58 
 
 
140 aa  62.8  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.30425  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0052  hypothetical protein  34.17 
 
 
135 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0337638  normal  0.0407808 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0043  hypothetical protein  34.17 
 
 
135 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3326  hypothetical protein  30 
 
 
146 aa  62  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0846911  hitchhiker  0.00213956 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3714  hypothetical protein  32.54 
 
 
153 aa  60.5  0.000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00025325  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3278  hypothetical protein  31.34 
 
 
141 aa  58.2  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.208875 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4369  hypothetical protein  31.51 
 
 
146 aa  57.4  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2379  hypothetical protein  33.9 
 
 
137 aa  57  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.748484  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1490  hypothetical protein  31.2 
 
 
148 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.318534 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3368  hypothetical protein  29.05 
 
 
157 aa  55.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.522403  normal  0.300179 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12924  hypothetical protein  34.17 
 
 
147 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.935917  normal  0.85717 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5494  gamma-BHC dehydrochlorinase  30.95 
 
 
182 aa  55.1  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.766656  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5490  hypothetical protein  31.25 
 
 
150 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.974909 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4599  hypothetical protein  26.95 
 
 
143 aa  54.3  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3626  hypothetical protein  31.25 
 
 
158 aa  54.3  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448566  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4928  hypothetical protein  31.01 
 
 
145 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4919  hypothetical protein  31.15 
 
 
185 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.263996  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4120  hypothetical protein  32.59 
 
 
143 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5008  hypothetical protein  31.15 
 
 
185 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.440663  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0863  hypothetical protein  34.11 
 
 
146 aa  53.1  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5301  hypothetical protein  31.15 
 
 
185 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31558  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0326  hypothetical protein  28.12 
 
 
190 aa  51.6  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000907903  normal  0.166315 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2185  hypothetical protein  29.84 
 
 
152 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0461451  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1268  hypothetical protein  29.51 
 
 
184 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0254023 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1296  hypothetical protein  30.22 
 
 
165 aa  50.4  0.000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0735417  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6973  hypothetical protein  32.82 
 
 
146 aa  50.4  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3299  hypothetical protein  29.03 
 
 
185 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3538  hypothetical protein  32.82 
 
 
144 aa  48.9  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3220  hypothetical protein  32.19 
 
 
143 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2225  hypothetical protein  29.71 
 
 
142 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.882088  normal  0.159368 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0309  hypothetical protein  32.28 
 
 
152 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.130933 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1484  hypothetical protein  26.12 
 
 
158 aa  48.5  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3527  hypothetical protein  28.03 
 
 
135 aa  48.5  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0257277  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1943  hypothetical protein  30.65 
 
 
136 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0278614  normal  0.939013 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6762  hypothetical protein  26.12 
 
 
151 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.785476 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1963  hypothetical protein  30.65 
 
 
141 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.739506  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5242  hypothetical protein  30.83 
 
 
139 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.766001  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2009  hypothetical protein  30.65 
 
 
141 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.456841 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5153  hypothetical protein  30.83 
 
 
139 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5534  hypothetical protein  30.83 
 
 
139 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.940856 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7153  hypothetical protein  28.46 
 
 
168 aa  47.8  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0228295  decreased coverage  0.00640549 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0906  hypothetical protein  22.6 
 
 
178 aa  47  0.00008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1169  hypothetical protein  30.43 
 
 
155 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.351825 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1152  hypothetical protein  30.43 
 
 
155 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.703942  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1179  hypothetical protein  31.3 
 
 
155 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0264278 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4178  hypothetical protein  27.78 
 
 
141 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3722  hypothetical protein  32.28 
 
 
166 aa  44.7  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.877907  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4109  hypothetical protein  31.97 
 
 
138 aa  44.7  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3330  hypothetical protein  26.77 
 
 
181 aa  44.7  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.662137  hitchhiker  0.00232953 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3839  hypothetical protein  26.79 
 
 
145 aa  44.3  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0386  hypothetical protein  30.16 
 
 
168 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.184767 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1984  hypothetical protein  28.35 
 
 
159 aa  43.9  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0518  hypothetical protein  24.39 
 
 
185 aa  43.9  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1550  hypothetical protein  30.25 
 
 
139 aa  43.9  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4383  putative bile acid 7-alpha dehydratase  30.83 
 
 
154 aa  43.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3815  hypothetical protein  26.83 
 
 
138 aa  43.5  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2736  aromatic ring hydroxylating dioxygenase beta subunit  30.88 
 
 
145 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37373  normal  0.0713641 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0432  hypothetical protein  29.13 
 
 
159 aa  43.5  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1978  hypothetical protein  28.68 
 
 
156 aa  43.5  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.335296  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4529  hypothetical protein  32.58 
 
 
163 aa  42.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7088  hypothetical protein  27.5 
 
 
185 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1681  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  30.14 
 
 
166 aa  42.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2721  hypothetical protein  33.33 
 
 
134 aa  41.6  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2917  hypothetical protein  29.29 
 
 
150 aa  42  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4910  hypothetical protein  24.24 
 
 
158 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1771  hypothetical protein  26.95 
 
 
154 aa  41.6  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2029  hypothetical protein  28.47 
 
 
168 aa  41.2  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2408  hypothetical protein  26.36 
 
 
130 aa  40.8  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5694  hypothetical protein  23.44 
 
 
152 aa  40.4  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.614955 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3809  hypothetical protein  27.05 
 
 
150 aa  40.4  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1359  hypothetical protein  27.13 
 
 
141 aa  40.4  0.008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.17438  normal  0.585219 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3526  hypothetical protein  29.46 
 
 
178 aa  40.4  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0212562  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13509  hypothetical protein  28.45 
 
 
168 aa  40  0.01  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10315  hypothetical protein  32.8 
 
 
163 aa  40  0.01  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.793118 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>