52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7179 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7179  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  100 
 
 		 173 aa  348  2e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0359047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8468  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  64.34 
 
 		 245 aa  159  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319959 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3110  putative PAS/PAC sensor protein  36.45 
 
 		 697 aa  57  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.63551  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4276  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 180 aa  55.1  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0915518  normal  0.326932 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2074  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.38 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148055  normal  0.91426 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2295  hypothetical protein  34.68 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.147419  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8758  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.59 
 
 		 192 aa  52.4  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4080  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  39.45 
 
 		 738 aa  52  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.32388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3501  putative PAS/PAC sensor protein  39.33 
 
 		 1225 aa  52  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.480314  normal  0.404449 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1752  protein phosphatase 2C-like  31.9 
 
 		 591 aa  51.6  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2966  protein serine/threonine phosphatase  32.32 
 
 		 716 aa  51.6  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.451872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7300  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  33.04 
 
 		 573 aa  51.2  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0156  putative signal transduction histidine kinase  35.25 
 
 		 132 aa  50.8  0.000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.888783  normal  0.296506 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1739  PAS/protein phosphatase 2C-like  34.74 
 
 		 817 aa  50.4  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4098  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  35.14 
 
 		 1045 aa  49.7  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.108116 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8305  putative PAS/PAC sensor protein  35.71 
 
 		 528 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.817018 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4668  ATP-binding region ATPase domain protein  33.63 
 
 		 148 aa  49.7  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6225  putative PAS/PAC sensor protein  30.61 
 
 		 713 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0192  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.21 
 
 		 177 aa  50.1  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.513716 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0097  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.67 
 
 		 155 aa  50.1  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0115417  normal  0.062689 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0207  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.2 
 
 		 613 aa  49.7  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00647646 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0777  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.51 
 
 		 130 aa  49.3  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0574046  hitchhiker  0.00140169 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4348  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.14 
 
 		 119 aa  48.5  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00391365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35220  PAS domain S-box  30.3 
 
 		 771 aa  48.1  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2086  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35 
 
 		 134 aa  48.1  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.019454  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6480  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 134 aa  47.8  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.903724  normal  0.217215 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2138  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  37.31 
 
 		 155 aa  47  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0220396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  38.39 
 
 		 616 aa  46.6  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.697266  normal  0.4865 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3140  protein serine/threonine phosphatase  29.29 
 
 		 745 aa  46.2  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.444013  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0121  putative PAS/PAC sensor protein  33.64 
 
 		 470 aa  45.8  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.660456  normal  0.370084 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0743  putative PAS/PAC sensor protein  29.32 
 
 		 855 aa  45.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3278  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.38 
 
 		 775 aa  45.4  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.771244  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1989  putative PAS/PAC sensor protein  31.18 
 
 		 722 aa  44.7  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.965966  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4034  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.43 
 
 		 129 aa  44.7  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3632  ATP-binding region ATPase domain protein  36.17 
 
 		 161 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4122  Stage II sporulation E family protein  27.48 
 
 		 805 aa  43.9  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.530219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4499  ATP-binding region ATPase domain protein  38.37 
 
 		 365 aa  43.5  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000991404  normal  0.031146 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2776  hypothetical protein  29.51 
 
 		 137 aa  43.5  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0586  signal transduction histidine kinase, LytS  31.78 
 
 		 123 aa  42.7  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0183303  hitchhiker  0.00998812 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.68 
 
 		 549 aa  43.1  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00204881 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3148  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.78 
 
 		 146 aa  43.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00947281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7237  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.88 
 
 		 579 aa  42.4  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1009  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  26.67 
 
 		 743 aa  42.4  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2418  protein serine/threonine phosphatase  31.58 
 
 		 746 aa  42.4  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.724517 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4163  putative PAS/PAC sensor protein  32.08 
 
 		 1039 aa  42  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0226672 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0250  PAS containing protein phosphatase 2C-like  26.06 
 
 		 753 aa  42  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.337993  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4051  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  32.1 
 
 		 281 aa  42  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.932154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0346  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 122 aa  42  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.108962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6671  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.25 
 
 		 357 aa  41.6  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.314942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1570  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.59 
 
 		 135 aa  41.6  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.196284  normal  0.153025 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4166  putative PAS/PAC sensor protein  39.34 
 
 		 765 aa  41.2  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.299427  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0531  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  28.67 
 
 		 207 aa  40.8  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.111836  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>