85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7118 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7118  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 180 aa  363  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4088  putative transcriptional regulator protein, ArsR family  56.52 
 
 		 213 aa  205  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1322  transcriptional regulator, ArsR family  41.3 
 
 		 210 aa  121  5e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.302064  normal  0.0955096 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4753  transcriptional regulator, ArsR family  39.78 
 
 		 206 aa  121  6e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1822  regulatory protein, ArsR  39.89 
 
 		 198 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00289732  normal  0.850355 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1813  ArsR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 198 aa  112  3e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0789444  hitchhiker  0.0000651262 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5019  transcriptional regulator, ArsR family  37.16 
 
 		 227 aa  102  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02100  predicted transcriptional regulator  38.73 
 
 		 192 aa  95.5  3e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08060  ArsR family regulatory protein  33.15 
 
 		 232 aa  94  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.365451  normal  0.146174 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2681  transcriptional regulator, ArsR family  33.51 
 
 		 214 aa  91.3  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2358  transcriptional regulator, ArsR family  33.15 
 
 		 216 aa  91.3  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.276644  normal  0.13645 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1441  transcriptional regulator, ArsR family  33.87 
 
 		 192 aa  90.9  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2852  ArsR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 230 aa  89  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.260551  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18080  predicted transcriptional regulator  38.46 
 
 		 211 aa  86.3  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.493664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7390  hypothetical protein  35.79 
 
 		 196 aa  84.7  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2961  putative transcriptional regulator, ArsR family  37.75 
 
 		 213 aa  84.7  6e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.878538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4545  ArsR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 187 aa  84.3  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0707495  normal  0.191523 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2302  regulatory protein, ArsR  34.04 
 
 		 201 aa  83.2  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.71264  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2909  putative transcriptional regulator, ArsR family  53.52 
 
 		 243 aa  82.8  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0487501  normal  0.155618 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4497  regulatory protein, ArsR  32.35 
 
 		 224 aa  82.8  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.175286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1862  putative transcriptional regulator, ArsR family  35 
 
 		 213 aa  82.4  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0267319 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2755  regulatory protein, ArsR  33.33 
 
 		 225 aa  82  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.083885  normal  0.132738 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2503  transcriptional regulator, MarR family  34.04 
 
 		 182 aa  80.5  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.118338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2257  transcriptional regulator, ArsR family  50.65 
 
 		 183 aa  80.1  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.587807  normal  0.865774 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36740  ArsR family regulatory protein  44.57 
 
 		 230 aa  75.9  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.929416  normal  0.251119 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2040  regulatory protein ArsR  35.12 
 
 		 201 aa  73.2  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4924  transcriptional regulator, ArsR family  35.52 
 
 		 193 aa  72.4  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.864535  normal  0.0286248 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1225  transcriptional regulator, ArsR family  33.9 
 
 		 193 aa  72.4  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.233594 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20540  ArsR family regulatory protein  37.2 
 
 		 187 aa  71.2  0.000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.614505 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1338  putative transcriptional regulator  34.48 
 
 		 230 aa  69.7  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1212  transcriptional regulator, ArsR family  29.48 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.838465 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0075  regulatory protein ArsR  40.86 
 
 		 197 aa  67.4  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.493033  normal  0.853303 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1779  putative transcriptional regulator  56.41 
 
 		 206 aa  67.4  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.304494  normal  0.74945 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0521  putative transcriptional regulator  30.98 
 
 		 191 aa  63.2  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4321  ArsR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 200 aa  57.8  0.00000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.120832  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0321  transcriptional regulator, ArsR family  31.46 
 
 		 195 aa  57  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.322661  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27290  hypothetical protein  33.12 
 
 		 212 aa  53.9  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.109442  normal  0.290934 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1047  transcriptional regulator, ArsR family  38.75 
 
 		 194 aa  51.2  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0265584 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1965  transcriptional regulator, ArsR family  38.61 
 
 		 102 aa  50.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.891597 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3654  transcriptional regulator, ArsR family  44.64 
 
 		 226 aa  47.8  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.162067 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0142  ArsR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 98 aa  47.8  0.00009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2967  transcriptional regulator, ArsR family  27.78 
 
 		 183 aa  47  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.048308 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4382  ArsR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 107 aa  47.4  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1726  transcriptional regulator, ArsR family  51.06 
 
 		 167 aa  45.8  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0364777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3356  ArsR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 186 aa  46.2  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2919  ArsR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 93 aa  45.8  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.808168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2878  transcriptional regulator, MarR family  45.45 
 
 		 112 aa  45.4  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4095  putative transcriptional regulator  36.59 
 
 		 196 aa  45.1  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.475604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1723  transcriptional regulator  29.27 
 
 		 95 aa  44.7  0.0006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000132397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0866  transcriptional regulator, ArsR family  41.94 
 
 		 104 aa  44.7  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.980203 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  36.07 
 
 		 112 aa  44.3  0.0008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1905  putative transcriptional regulator  36.59 
 
 		 176 aa  44.7  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0592557  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  36.07 
 
 		 112 aa  44.3  0.0008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05590  hypothetical protein  25.88 
 
 		 197 aa  44.3  0.0009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.604639  normal  0.83451 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30700  Regulatory protein, ArsR family  44.64 
 
 		 113 aa  43.9  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.263428  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0466  regulatory protein, ArsR  38.98 
 
 		 108 aa  43.9  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2627  ArsR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 102 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.8267  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2808  transcriptional regulator, ArsR family  41.27 
 
 		 101 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.598578  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2071  regulatory protein, ArsR  29.85 
 
 		 107 aa  43.9  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.3776  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1324  regulatory protein, ArsR  29.85 
 
 		 107 aa  43.9  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4453  ArsR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 233 aa  43.5  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2886  transcriptional regulator, TrmB  36.07 
 
 		 114 aa  43.1  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2022  transcriptional regulator, ArsR family  37.74 
 
 		 111 aa  42.7  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0259  transcriptional regulator, ArsR family  38.81 
 
 		 171 aa  42.4  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.792172  normal  0.339898 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3347  transcriptional regulator, ArsR family  34.29 
 
 		 120 aa  42.7  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2809  hypothetical protein  34.21 
 
 		 249 aa  42.4  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0329  ArsR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 88 aa  42.4  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0217385  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2987  regulatory protein, ArsR  35.09 
 
 		 109 aa  42.7  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3286  putative transcriptional regulator, ArsR family  37.74 
 
 		 106 aa  42.4  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0270  transcriptional regulator, TrmB  39.62 
 
 		 102 aa  42.4  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3375  transcriptional regulator, ArsR family  33.68 
 
 		 129 aa  42  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.00373778 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2713  transcriptional regulator, ArsR family  41.27 
 
 		 102 aa  42.4  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1544  transcriptional regulator, ArsR family  38.89 
 
 		 109 aa  42.4  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.411749  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0610  ArsR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 98 aa  42.4  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3526  transcriptional regulator, ArsR family  41.79 
 
 		 110 aa  42  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0231153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1513  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 108 aa  41.6  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.313082  normal  0.361188 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1797  transcriptional regulator, ArsR family  31.82 
 
 		 98 aa  41.6  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00267488  normal  0.189807 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0870  transcriptional regulator, ArsR family  29.52 
 
 		 171 aa  41.6  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.680607 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1280  ArsR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 120 aa  41.6  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.514491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4445  ArsR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 125 aa  41.6  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.586673  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0425  ArsR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 127 aa  41.6  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2830  putative transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 108 aa  41.6  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2001  ArsR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 387 aa  41.2  0.007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1962  putative transcriptional regulator, ArsR family  38.98 
 
 		 105 aa  41.2  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.166956  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2317  transcriptional regulator, ArsR family  39.71 
 
 		 115 aa  41.2  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.161195 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>