49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2852 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2852  phage major capsid protein, HK97 family  100 
 
 		 466 aa  956    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107077  normal  0.025439 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1985  phage major capsid protein, HK97  35.73 
 
 		 423 aa  218  1e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2866  phage major capsid protein, HK97  35.73 
 
 		 437 aa  218  2e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2848  phage major capsid protein, HK97  35.45 
 
 		 437 aa  215  1.9999999999999998e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1719  HK97 family phage major capsid protein  34.71 
 
 		 429 aa  185  1.0000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3666  major capsid protein HK97  33.97 
 
 		 337 aa  183  6e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.017941  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2474  major capsid protein HK97  34.18 
 
 		 483 aa  169  8e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.690827  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7144  HK97 family phage major capsid protein  30.48 
 
 		 434 aa  150  5e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00647338 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1998  phage major capsid protein, HK97 family  30.53 
 
 		 438 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2834  phage major capsid protein, HK97 family  26.48 
 
 		 397 aa  92.4  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.174812  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0852  major capsid protein, HK97 family  27.97 
 
 		 386 aa  90.9  4e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0590991  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0400  HK97 family phage major capsid protein  25.89 
 
 		 397 aa  90.5  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1628  HK97 family phage major capsid protein  24.77 
 
 		 400 aa  87.8  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1254  HK97 family phage major capsid protein  26.58 
 
 		 399 aa  86.7  8e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1485  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  29.25 
 
 		 392 aa  81.6  0.00000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2358  phage phi-C31 gp36-like protein /HK97 family major capsid protein  28.52 
 
 		 420 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.172606  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1085  HK97 family major capsid protein  23.67 
 
 		 405 aa  79.7  0.00000000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1458  HK97 family major capsid protein  25.95 
 
 		 388 aa  77.4  0.0000000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.90039  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1466  HK97 family phage major capsid protein  25.91 
 
 		 312 aa  73.9  0.000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000392324  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1895  HK97 family phage major capsid protein  25.09 
 
 		 389 aa  71.6  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1022  phage major capsid protein, HK97 family  25.95 
 
 		 411 aa  67  0.0000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3970  HK97 family phage major capsid protein  25.89 
 
 		 413 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.33538 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3980  phage major capsid protein, HK97 family  23.21 
 
 		 382 aa  64.7  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1625  Phage major capsid protein, HK97  25.62 
 
 		 385 aa  62  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.490763  normal  0.450118 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1482  Phage major capsid protein, HK97  25.62 
 
 		 385 aa  62  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.353157 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1719  phage major capsid protein, HK97  24.62 
 
 		 384 aa  60.1  0.00000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2025  phage major capsid protein, HK97  23.28 
 
 		 382 aa  58.2  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.848367  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0337  phage major capsid protein, HK97  23.28 
 
 		 382 aa  58.2  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.139658  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5467  hypothetical protein  25.52 
 
 		 386 aa  58.5  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1619  HK97 family phage major capsid protein  24.14 
 
 		 437 aa  57.8  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.314426 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7329  phage major capsid protein, HK97 family  25.08 
 
 		 417 aa  57.4  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0277  HK97 family phage major capsid protein  23.93 
 
 		 385 aa  57  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3877  hypothetical protein  26.15 
 
 		 490 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0282142 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3313  phage major capsid protein, HK97 family  21.12 
 
 		 562 aa  52  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000533544 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1359  HK97 family phage major capsid protein  23.86 
 
 		 385 aa  52.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.504084  normal  0.308637 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1753  phage major capsid protein, HK97  25.57 
 
 		 435 aa  49.7  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.357661 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1078  HK97 family phage major capsid protein  25.44 
 
 		 387 aa  49.7  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.506947 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0861  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  24.3 
 
 		 403 aa  49.3  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.456659  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1622  hypothetical protein  25.74 
 
 		 439 aa  49.3  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.264122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0951  HK97 family phage major capsid protein  23.29 
 
 		 389 aa  49.3  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2174  putative phage major capsid protein  23.15 
 
 		 405 aa  48.9  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1086  HK97 family phage major capsid protein  21.4 
 
 		 400 aa  46.6  0.0009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2471  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  25.37 
 
 		 398 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1133  HK97 family phage major capsid protein  25.37 
 
 		 387 aa  45.8  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1190  HK97 family phage major capsid protein  24.44 
 
 		 401 aa  45.1  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000012399 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4965  HK97 family phage major capsid protein  23.74 
 
 		 430 aa  45.1  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154569 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2489  phage major capsid protein, HK97  23.79 
 
 		 390 aa  44.3  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3122  phage major capsid protein, HK97  22.26 
 
 		 380 aa  43.5  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5150  putative phage-related protein  28.95 
 
 		 409 aa  43.5  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.788402  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>