More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1906 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1906  cytochrome b561 family protein  100 
 
 		 183 aa  368  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1056  cytochrome B561  38.29 
 
 		 181 aa  119  3e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.52465  normal  0.404456 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1861  cytochrome B561  38.76 
 
 		 178 aa  117  7e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.846018  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4185  cytochrome B561  35.03 
 
 		 189 aa  114  6e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3997  putative cytochrome b-561 membrane protein  34.46 
 
 		 186 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50922  normal  0.334764 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5858  cytochrome B561  33.71 
 
 		 184 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1636  hypothetical protein  35.23 
 
 		 184 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0965469  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0706  cytochrome B561  34.46 
 
 		 186 aa  108  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.794115 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2064  putative cytochrome b-561 membrane protein  33.33 
 
 		 184 aa  105  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.913396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2549  cytochrome B561  37.58 
 
 		 182 aa  105  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481387  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0459  cytochrome B561  34.52 
 
 		 189 aa  103  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1538  hypothetical protein  32.97 
 
 		 182 aa  101  5e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1445  hypothetical protein  32.42 
 
 		 182 aa  101  7e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2061  cytochrome B561  36.26 
 
 		 187 aa  100  9e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0605  cytochrome B561  33.33 
 
 		 186 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  32.2 
 
 		 186 aa  99.4  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0629  cytochrome B561  33.33 
 
 		 186 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3682  cytochrome B561  30.94 
 
 		 188 aa  99.8  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.388705  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  32.39 
 
 		 182 aa  99.8  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2731  cytochrome B561  40.98 
 
 		 188 aa  99.8  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.578795  normal  0.080966 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0714  cytochrome B561  33.53 
 
 		 186 aa  98.6  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0681  cytochrome B561  33.53 
 
 		 186 aa  98.6  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400799  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2553  cytochrome B561  33.33 
 
 		 193 aa  98.6  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.411403 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0230  cytochrome B561  33.53 
 
 		 186 aa  98.6  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2719  putative cytochrome B-561 transmembrane protein  33.33 
 
 		 195 aa  97.4  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2963  cytochrome B561  32.76 
 
 		 193 aa  97.4  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1169  cytochrome b561, putative  30.51 
 
 		 173 aa  95.1  5e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.840411  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1617  hypothetical protein  36.57 
 
 		 176 aa  95.1  5e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3152  cytochrome B561  34.13 
 
 		 197 aa  95.1  5e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159258  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1571  cytochrome B561  31.98 
 
 		 192 aa  95.1  6e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.896883 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2671  cytochrome B561  32.95 
 
 		 186 aa  94.7  7e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3507  cytochrome B561  29.28 
 
 		 185 aa  93.6  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563423 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1738  hypothetical protein  32.61 
 
 		 186 aa  94  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0392514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0073  cytochrome b561, putative  32.93 
 
 		 175 aa  92.8  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.475436  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2465  putative cytochrome b561  34.94 
 
 		 188 aa  93.6  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.104825 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0086  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  33.53 
 
 		 175 aa  92.8  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.083674  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1612  hypothetical protein  36 
 
 		 176 aa  92.4  3e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0086  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  33.53 
 
 		 175 aa  92.4  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2794  cytochrome B561  37.36 
 
 		 174 aa  92  5e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0296  cytochrome B561  33.33 
 
 		 174 aa  91.7  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000303628  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3195  cytochrome B561  33.54 
 
 		 176 aa  90.9  8e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000000038673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1216  cytochrome b561  34.46 
 
 		 183 aa  90.9  9e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000559854  normal  0.299312 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2073  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  32.18 
 
 		 213 aa  90.5  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.636056  normal  0.331643 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2228  cytochrome B561  29.51 
 
 		 197 aa  89  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000575966  hitchhiker  0.00851734 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1026  cytochrome B561  29.89 
 
 		 188 aa  88.6  4e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2322  cytochrome B561  33.33 
 
 		 203 aa  88.2  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0009  cytochrome B561  32.91 
 
 		 176 aa  88.2  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000000853372  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1554  cytochrome B561  36.36 
 
 		 183 aa  88.2  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3506  putative cytochrome b-561 membrane protein  32.96 
 
 		 186 aa  88.2  6e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.456908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0062  cytochrome B561  32.91 
 
 		 176 aa  88.2  6e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000272347  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0006  cytochrome B561  33.54 
 
 		 176 aa  87.8  7e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000161036  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1225  YceJ  34.09 
 
 		 190 aa  87.8  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.307715  normal  0.414708 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0967  cytochrome B561  33.33 
 
 		 181 aa  87.4  1e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0483  cytochrome B561  29.52 
 
 		 183 aa  87  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0030  cytochrome B561  32.91 
 
 		 177 aa  87.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000693928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7083  cytochrome B561  34.04 
 
 		 199 aa  87  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.280542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0005  cytochrome B561  32.91 
 
 		 177 aa  87.4  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0183044 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2565  putative cytochrome b561  35.26 
 
 		 187 aa  86.7  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1120  cytochrome B561  34.64 
 
 		 184 aa  86.7  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000137011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1436  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  31.03 
 
 		 188 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.887549  normal  0.160518 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4982  cytochrome B561  30.17 
 
 		 183 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1669  hypothetical protein  83.33 
 
 		 49 aa  86.3  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.609737  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2380  cytochrome b561, putative  35.26 
 
 		 187 aa  86.7  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1157  putative cytochrome b561  35.26 
 
 		 187 aa  86.7  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05500  hypothetical protein  30.3 
 
 		 189 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2271  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  31.03 
 
 		 188 aa  86.7  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3379  cytochrome B561  35.26 
 
 		 187 aa  86.7  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2543  cytochrome B561  31.03 
 
 		 188 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.210551  normal  0.464909 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3370  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  35.26 
 
 		 187 aa  86.7  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0014  cytochrome B561  33.54 
 
 		 176 aa  86.7  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1179  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  31.03 
 
 		 188 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4855  cytochrome B561  30.17 
 
 		 183 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745808  normal  0.0891705 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0201  putative cytochrome b-561 protein  34.21 
 
 		 222 aa  86.7  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0295  putative cytochrome b561  35.26 
 
 		 187 aa  86.7  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3336  cytochrome B561  35.26 
 
 		 187 aa  86.7  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1180  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  31.03 
 
 		 188 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.901054  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01053  predicted cytochrome b561  30.46 
 
 		 188 aa  85.5  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.580116  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2589  cytochrome B561  30.46 
 
 		 188 aa  85.5  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.806134  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01061  hypothetical protein  30.46 
 
 		 188 aa  85.5  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.649815  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0522  hypothetical protein  29.7 
 
 		 189 aa  85.9  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.336315  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0259  cytochrome B561  32.53 
 
 		 178 aa  85.9  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2532  cytochrome B561  31.21 
 
 		 206 aa  85.1  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4984  cytochrome B561  29.34 
 
 		 179 aa  85.5  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0448124 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5031  cytochrome B561  30.73 
 
 		 183 aa  85.1  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.416621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7458  cytochrome B561  31.29 
 
 		 210 aa  84.7  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.669252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1271  cytochrome b561, putative  34.5 
 
 		 187 aa  84.3  8e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0980  putative cytochrome b561  32.93 
 
 		 177 aa  84  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1178  cytochrome B561  31.9 
 
 		 183 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000103692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3000  cytochrome B561  34.27 
 
 		 188 aa  84  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.426718  normal  0.0305282 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1313  cytochrome B561  31.79 
 
 		 184 aa  83.6  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.169075  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3599  cytochrome b561 family protein  31.49 
 
 		 189 aa  83.2  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.206371  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2818  cytochrome B561  31.64 
 
 		 183 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0932  cytochrome b561 family protein  30.49 
 
 		 173 aa  83.6  0.000000000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1177  cytochrome B561  31.29 
 
 		 183 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000321845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1272  cytochrome B561  29.63 
 
 		 190 aa  82.8  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.0192884 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5285  cytochrome B561  29.61 
 
 		 183 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621373  normal  0.806427 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3478  cytochrome B561  27.68 
 
 		 180 aa  82.8  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.579466  hitchhiker  0.000371098 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0508  cytochrome B561  29.24 
 
 		 191 aa  82.4  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1248  cytochrome B561  31.29 
 
 		 183 aa  82.4  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00191634  normal  0.790409 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2031  YceJ  34.66 
 
 		 192 aa  82  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>