More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0852 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_0861  alanine racemase  98.7 
 
 
386 aa  777  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0852  alanine racemase  100 
 
 
386 aa  785  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2926  alanine racemase  52.89 
 
 
389 aa  424  1e-117  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.839244  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2697  alanine racemase  50.52 
 
 
391 aa  414  1e-115  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2167  alanine racemase  52.57 
 
 
373 aa  408  1e-113  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  1.96511e-08  decreased coverage  1.76162e-05 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0758  alanine racemase  52.85 
 
 
373 aa  400  1e-110  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0063  alanine racemase  53.12 
 
 
373 aa  399  1e-110  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.131019  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0964  alanine racemase  51.44 
 
 
388 aa  399  1e-110  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1160  alanine racemase  53.66 
 
 
373 aa  400  1e-110  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2865  alanine racemase  51.09 
 
 
370 aa  397  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000333192  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1882  alanine racemase  49.73 
 
 
377 aa  394  1e-108  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1903  alanine racemase  51.44 
 
 
390 aa  385  1e-106  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0696204  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0824  alanine racemase  49.07 
 
 
380 aa  383  1e-105  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.664033  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0307  alanine racemase  48.43 
 
 
390 aa  373  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3770  alanine racemase  48.36 
 
 
373 aa  365  1e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646539  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1484  alanine racemase  46.05 
 
 
390 aa  361  1e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.770988  hitchhiker  8.45672e-07 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0171  alanine racemase  47.7 
 
 
371 aa  358  8e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01680  alanine racemase  48.65 
 
 
379 aa  347  1e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0472  alanine racemase  45.82 
 
 
380 aa  337  1e-91  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1931  alanine racemase  47.24 
 
 
408 aa  337  2e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0176201  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0905  alanine racemase  44.44 
 
 
389 aa  335  6e-91  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00165979  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2070  alanine racemase  47.4 
 
 
391 aa  335  7e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.773595  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1884  alanine racemase  47.14 
 
 
391 aa  335  8e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0057  alanine racemase  42.25 
 
 
390 aa  334  1e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2178  alanine racemase  46.88 
 
 
391 aa  334  2e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1894  alanine racemase  47.14 
 
 
391 aa  334  2e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.695419  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2163  alanine racemase  46.46 
 
 
391 aa  333  3e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2110  alanine racemase  46.88 
 
 
391 aa  332  1e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1932  alanine racemase  46.61 
 
 
391 aa  331  2e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2079  alanine racemase  46.61 
 
 
391 aa  331  2e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3236  alanine racemase  46.61 
 
 
391 aa  330  2e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.560123  normal  0.143826 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1563  alanine racemase  45.31 
 
 
392 aa  327  2e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.985538  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1342  alanine racemase  45.41 
 
 
370 aa  326  4e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0650824  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1758  alanine racemase  41.85 
 
 
369 aa  313  2e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4765  alanine racemase  44.54 
 
 
851 aa  308  1e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2170  alanine racemase  43.42 
 
 
398 aa  303  2e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.598884  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1547  alanine racemase  43.34 
 
 
388 aa  288  1e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0014745  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1132  alanine racemase  40.97 
 
 
380 aa  286  4e-76  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3427  alanine racemase  38.48 
 
 
395 aa  285  1e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.764084  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3576  alanine racemase  38.48 
 
 
395 aa  282  7e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3508  alanine racemase  38.22 
 
 
395 aa  282  9e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0975  alanine racemase  42.22 
 
 
373 aa  271  2e-71  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.585584  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0230  alanine racemase  41.13 
 
 
389 aa  270  4e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1095  alanine racemase  43.09 
 
 
379 aa  269  5e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.885061  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3487  alanine racemase  38.2 
 
 
393 aa  268  1e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1025  alanine racemase  41.4 
 
 
364 aa  267  2e-70  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2520  alanine racemase  40.71 
 
 
811 aa  267  3e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0226  alanine racemase  41.13 
 
 
389 aa  266  5e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0562  alanine racemase  39.28 
 
 
375 aa  265  7e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.629716  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0264  alanine racemase  41.13 
 
 
389 aa  265  9e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0224  alanine racemase  41.13 
 
 
389 aa  265  9e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0272  alanine racemase  41.13 
 
 
389 aa  265  1e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2594  alanine racemase  39.79 
 
 
433 aa  265  1e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.127753  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0238  alanine racemase  41.24 
 
 
389 aa  264  2e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0286  alanine racemase  41.13 
 
 
389 aa  264  2e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5058  alanine racemase  40.05 
 
 
389 aa  264  2e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2234  alanine racemase  39.08 
 
 
378 aa  264  2e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0252  alanine racemase  40.87 
 
 
389 aa  263  4e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0238  alanine racemase  40.87 
 
 
389 aa  263  4e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0267  alanine racemase  40.05 
 
 
389 aa  263  5e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.386935  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1091  alanine racemase  39.18 
 
 
384 aa  261  1e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0210  alanine racemase  39.23 
 
 
387 aa  261  1e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.584138  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0897  alanine racemase  36.43 
 
 
403 aa  255  7e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07700  alanine racemase  36.13 
 
 
434 aa  253  5e-66  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.282075 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2785  alanine racemase  37.37 
 
 
441 aa  252  6e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0448051 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0923  alanine racemase  36.27 
 
 
403 aa  253  6e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0365906  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2762  alanine racemase  38.99 
 
 
380 aa  251  1e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00587004  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0606  alanine racemase  37.87 
 
 
382 aa  252  1e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3850  alanine racemase  38.87 
 
 
384 aa  251  1e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0255  alanine racemase  39.84 
 
 
375 aa  251  1e-65  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000231066  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0412  alanine racemase  36.68 
 
 
395 aa  249  5e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.650932  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2908  alanine racemase  37.87 
 
 
379 aa  249  6e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.184968  normal  0.271691 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2201  alanine racemase  36.24 
 
 
406 aa  248  1e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.419731 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0862  alanine racemase  36.41 
 
 
403 aa  246  4e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1646  alanine racemase  40.32 
 
 
374 aa  245  8e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.064552  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2084  alanine racemase  37.98 
 
 
375 aa  243  5e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.261095 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0390  alanine racemase  35.14 
 
 
395 aa  243  5e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.185126  normal  0.667441 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01510  alanine racemase  36.87 
 
 
421 aa  242  7e-63  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0441968 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1898  alanine racemase  39.78 
 
 
849 aa  242  7e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0368912 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1812  alanine racemase  39.3 
 
 
373 aa  240  2e-62  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000273885  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2284  alanine racemase  38.86 
 
 
376 aa  238  2e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2981  alanine racemase  39.62 
 
 
844 aa  237  3e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2145  alanine racemase  39.52 
 
 
382 aa  236  4e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2107  alanine racemase  39.52 
 
 
382 aa  236  4e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1173  alanine racemase  35.68 
 
 
383 aa  236  7e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49691  normal  0.0522528 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1146  alanine racemase  35.68 
 
 
383 aa  236  7e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1163  alanine racemase  35.68 
 
 
383 aa  236  7e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.434451 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0326  alanine racemase  36.51 
 
 
369 aa  234  1e-60  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.442092  normal  0.535526 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0990  alanine racemase  34.64 
 
 
397 aa  233  3e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.876046  hitchhiker  0.00306709 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0681  alanine racemase  34.64 
 
 
387 aa  233  5e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00412928  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1885  alanine racemase  35.46 
 
 
397 aa  232  7e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.849261  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1026  alanine racemase  38.99 
 
 
364 aa  232  8e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.43119  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0934  alanine racemase  36.51 
 
 
376 aa  231  1e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1684  alanine racemase  37.8 
 
 
366 aa  229  6e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.531054  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1701  alanine racemase  39.02 
 
 
367 aa  229  7e-59  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0994  alanine racemase  34.55 
 
 
382 aa  228  1e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2128  alanine racemase  36.96 
 
 
374 aa  228  2e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4221  alanine racemase  34.72 
 
 
411 aa  225  8e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.53018  normal  0.063385 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3527  alanine racemase  38.95 
 
 
379 aa  225  9e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1583  alanine racemase  35.17 
 
 
395 aa  225  1e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.545163 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>