More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1070 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1070  ribosomal protein L22  100 
 
 
199 aa  402  1e-111  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0819  DedA family protein  68.34 
 
 
202 aa  278  4e-74  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1078  DedA family protein  61.42 
 
 
195 aa  239  2e-62  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1084  DedA-like protein  56.12 
 
 
201 aa  228  6e-59  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.672419  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1302  DedA family protein  60.24 
 
 
212 aa  221  7e-57  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.262932  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1183  DedA family protein  59.64 
 
 
200 aa  220  9.999999999999999e-57  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2081  putative integral membrane protein dedA-like protein  53.03 
 
 
202 aa  215  4e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.253435  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2976  DedA family protein  51.76 
 
 
198 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.819904  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1314  SNARE associated Golgi protein-related protein  54 
 
 
201 aa  196  2.0000000000000003e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.38918  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1806  hypothetical protein  46 
 
 
203 aa  192  3e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.87635  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0601  SNARE associated Golgi protein-related protein  47.5 
 
 
205 aa  192  4e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0707  hypothetical protein  50.5 
 
 
210 aa  191  7e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0652069  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0611  SNARE associated Golgi protein  49.75 
 
 
208 aa  187  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0502  hypothetical protein  55.42 
 
 
207 aa  187  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.773661  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0282  DedA family protein  47.74 
 
 
202 aa  185  5e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0625  SNARE associated Golgi protein  49.75 
 
 
203 aa  184  8e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.21493e-35 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0339  SNARE associated Golgi protein  46.46 
 
 
206 aa  164  5e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000282866  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2737  SNARE associated Golgi protein  40.2 
 
 
206 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.388255  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0191  alkaline phosphatase  38.86 
 
 
209 aa  141  8e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0996912 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1693  SNARE associated Golgi protein  37.5 
 
 
203 aa  138  6e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1836  SNARE associated Golgi protein  45.51 
 
 
208 aa  135  4e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1749  hypothetical protein  39.5 
 
 
212 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.17424 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1977  SNARE associated Golgi protein  38.69 
 
 
201 aa  131  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.669435 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1081  putative alkaline phosphatase  42.14 
 
 
198 aa  130  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46140  DedA family membrane-associated protein  37.44 
 
 
202 aa  129  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0874332  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0619  hypothetical protein  40.24 
 
 
211 aa  127  8.000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.512378  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2412  SNARE associated Golgi protein  38.01 
 
 
202 aa  125  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000349657  normal  0.38034 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0095  DedA family protein  35.12 
 
 
205 aa  125  4.0000000000000003e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3867  DedA family protein  33.87 
 
 
198 aa  125  5e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0665  SNARE associated Golgi protein  36.76 
 
 
212 aa  125  6e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.267065  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4718  SNARE associated Golgi protein-like protein  33.33 
 
 
207 aa  123  1e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.517829  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0719  hypothetical protein  34.85 
 
 
208 aa  123  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000531966  normal  0.139707 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1601  hypothetical protein  37.35 
 
 
202 aa  123  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.851852  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1959  hypothetical protein  34.92 
 
 
211 aa  123  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2975  SNARE associated Golgi protein  40.35 
 
 
216 aa  123  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0123855  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5727  SNARE associated Golgi protein-related protein  37.97 
 
 
206 aa  122  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.196886  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1404  SNARE associated Golgi protein  39.39 
 
 
218 aa  122  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2364  hypothetical protein  36.68 
 
 
205 aa  122  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000112613  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1303  SNARE associated Golgi protein  39.39 
 
 
218 aa  122  3e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0280885  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3002  SNARE associated Golgi protein  36.27 
 
 
205 aa  122  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2546  hypothetical protein  38.18 
 
 
218 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1030  SNARE associated Golgi protein-like protein  36.53 
 
 
203 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2291  SNARE associated Golgi protein  33 
 
 
202 aa  118  6e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1401  hypothetical protein  36.97 
 
 
200 aa  117  7.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2135  DedA family protein  32.5 
 
 
202 aa  117  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3743  SNARE associated Golgi protein  35.44 
 
 
215 aa  117  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.362202  normal  0.890971 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0514  alkaline phosphatase  33.53 
 
 
206 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0105  SNARE associated Golgi protein  32.61 
 
 
208 aa  116  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17501  DedA family alkaline phosphatase-like protein  36 
 
 
220 aa  115  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0722  SNARE associated Golgi protein  33.83 
 
 
201 aa  116  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000026283  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1952  DedA family protein  36.79 
 
 
215 aa  115  3.9999999999999997e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0454  hypothetical protein  34.33 
 
 
213 aa  114  8.999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.62301 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0103  putative alkaline phosphatase-like protein  37.5 
 
 
219 aa  114  1.0000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0147  putative alkaline phosphatase-like protein  35.2 
 
 
219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.629007  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2053  SNARE associated Golgi protein  32.99 
 
 
216 aa  112  4.0000000000000004e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0902  dedA family protein  32.34 
 
 
201 aa  112  5e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.209208  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4471  dedA family protein  32.34 
 
 
201 aa  112  5e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.238489 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0975  dedA family protein  32.34 
 
 
201 aa  112  5e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365515  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06150  uncharacterized membrane-associated protein  31.34 
 
 
205 aa  111  7.000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.430266  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20761  DedA family alkaline phosphatase-like protein  34.74 
 
 
218 aa  110  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.167528  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1053  SNARE associated Golgi protein-related protein  33.14 
 
 
222 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1349  SNARE associated Golgi protein-like protein  40.61 
 
 
241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0759  SNARE associated Golgi protein  39.16 
 
 
202 aa  109  3e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.259781  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0773  DedA family protein  39.86 
 
 
201 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000448539  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0721  dedA family protein; alkaline phosphatase-like protein  39.86 
 
 
201 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.223536  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0810  DedA family protein  39.86 
 
 
201 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.621407  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2561  hypothetical protein  33.73 
 
 
209 aa  108  4.0000000000000004e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0906  dedA family protein  39.86 
 
 
201 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.29745e-42 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0708  dedA family protein; alkaline phosphatase-like protein  39.86 
 
 
201 aa  108  5e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0751539  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0865  dedA family protein  39.86 
 
 
201 aa  108  5e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2342  SNARE associated Golgi protein-like protein  34.95 
 
 
228 aa  107  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.43138  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0082  SNARE associated Golgi protein-related protein  32.93 
 
 
221 aa  107  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1043  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 
197 aa  106  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9346  alkaline phosphatase  35.15 
 
 
205 aa  106  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.965489  normal  0.785405 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0260  alkaline phosphatase-like protein  34.15 
 
 
202 aa  105  3e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.894036  normal  0.360147 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2075  DedA family protein  31.58 
 
 
204 aa  105  4e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.190236  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1201  DedA family alkaline phosphatase-like protein  35.4 
 
 
218 aa  105  4e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2080  hypothetical protein  35 
 
 
199 aa  105  4e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0320169  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0747  alkaline phosphatase  33.85 
 
 
214 aa  105  4e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0119068  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25760  uncharacterized membrane-associated protein  32.51 
 
 
228 aa  104  7e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1027  SNARE associated Golgi protein  34.94 
 
 
325 aa  103  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.649143  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03490  uncharacterized membrane-associated protein  32.5 
 
 
216 aa  103  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4049  alkaline phosphatase  34 
 
 
213 aa  102  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.257312  hitchhiker  0.00220744 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0402  SNARE associated Golgi protein  30.61 
 
 
198 aa  102  5e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1046  SNARE associated Golgi protein-related protein  31.34 
 
 
202 aa  101  6e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1898  SNARE associated Golgi protein  34.21 
 
 
200 aa  101  9e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0195021  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1901  dedA family protein  32.51 
 
 
200 aa  100  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.351211  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1864  DedA family integral membrane protein  32.51 
 
 
200 aa  100  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0968517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1854  DedA family integral membrane protein  32.51 
 
 
200 aa  100  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.359684  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2048  DedA family protein  32.51 
 
 
200 aa  100  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2066  hypothetical protein  33.52 
 
 
199 aa  100  1e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2080  dedA family protein  32.02 
 
 
200 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0604  SNARE associated Golgi protein-like protein  35.1 
 
 
194 aa  99.4  3e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00110976  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2038  dedA family protein  32.51 
 
 
200 aa  99.4  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0574  SNARE associated Golgi protein  31.05 
 
 
199 aa  99.8  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.24948  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0984  SNARE associated Golgi protein-related protein  32.34 
 
 
203 aa  99  4e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2381  SNARE associated Golgi protein  29.65 
 
 
224 aa  99  4e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.273471 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1525  SNARE associated Golgi protein  33.79 
 
 
228 aa  99  4e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.365911  hitchhiker  0.00841691 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0606  SNARE associated Golgi protein-related protein  32.53 
 
 
231 aa  99  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1772  SNARE associated Golgi protein  31.22 
 
 
208 aa  98.6  5e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>