More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1016 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1016  30S ribosomal protein S5  100 
 
 		 147 aa  290  4e-78  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000116786  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1759  30S ribosomal protein S5  97.28 
 
 		 147 aa  285  1e-76  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00134618  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0076  30S ribosomal protein S5  90.41 
 
 		 158 aa  267  2.9999999999999997e-71  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.504275  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0051  30S ribosomal protein S5  89.04 
 
 		 147 aa  266  5.9999999999999995e-71  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.546505  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1858  30S ribosomal protein S5  89.73 
 
 		 147 aa  265  2e-70  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2064  30S ribosomal protein S5  89.73 
 
 		 147 aa  265  2e-70  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1687  30S ribosomal protein S5  89.73 
 
 		 147 aa  265  2e-70  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1951  ribosomal protein S5  84.35 
 
 		 147 aa  257  4e-68  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0101  30S ribosomal protein S5  84.14 
 
 		 146 aa  251  3e-66  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0303  30S ribosomal protein S5  74.65 
 
 		 146 aa  219  9.999999999999999e-57  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.924443  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0128  30S ribosomal protein S5  64.08 
 
 		 166 aa  181  4.0000000000000006e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0127  30S ribosomal protein S5  64.03 
 
 		 166 aa  179  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00181316  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0127  30S ribosomal protein S5  64.03 
 
 		 166 aa  179  1e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000033601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0123  30S ribosomal protein S5  64.03 
 
 		 166 aa  179  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000320585  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0121  30S ribosomal protein S5  64.03 
 
 		 166 aa  179  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000828927  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0148  30S ribosomal protein S5  64.03 
 
 		 166 aa  179  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000129671  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0127  30S ribosomal protein S5  64.03 
 
 		 166 aa  179  1e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0304335  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0139  30S ribosomal protein S5  64.03 
 
 		 166 aa  179  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.93712e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0158  30S ribosomal protein S5  64.03 
 
 		 166 aa  179  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000826666  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4931  ribosomal protein S5  60.53 
 
 		 182 aa  179  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.023543  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5178  30S ribosomal protein S5  64.03 
 
 		 166 aa  179  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000595354  unclonable  1.58877e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0122  30S ribosomal protein S5  63.31 
 
 		 166 aa  178  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00008348  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0121  30S ribosomal protein S5  63.31 
 
 		 166 aa  178  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0124  30S ribosomal protein S5  63.38 
 
 		 166 aa  176  7e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1853  ribosomal protein S5  58.9 
 
 		 172 aa  175  1e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152788  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2920  30S ribosomal protein S5  62.86 
 
 		 166 aa  172  9.999999999999999e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000379873  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0242  ribosomal protein S5  62.24 
 
 		 168 aa  172  1.9999999999999998e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.529563  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1728  30S ribosomal protein S5  61.15 
 
 		 168 aa  171  1.9999999999999998e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000123427  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0303  30S ribosomal protein S5  61.54 
 
 		 166 aa  171  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000149284  normal  0.159424 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1168  30S ribosomal protein S5  60 
 
 		 180 aa  170  5.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0459782  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0775  30S ribosomal protein S5  60.71 
 
 		 167 aa  169  9e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000409593  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0718  30S ribosomal protein S5  60.14 
 
 		 163 aa  169  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.160468  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl140  30S ribosomal protein S5  54.79 
 
 		 206 aa  166  7e-41  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4009  30S ribosomal protein S5  59.29 
 
 		 180 aa  166  8e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000876107  hitchhiker  0.0000786108 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0232  30S ribosomal protein S5  59.29 
 
 		 166 aa  166  8e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010623  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1507  ribosomal protein S5  62.59 
 
 		 173 aa  166  1e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.360692  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0211  SSU ribosomal protein S5P  59.44 
 
 		 168 aa  166  1e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.102513  normal  0.321891 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01340  ribosomal protein S5  57.34 
 
 		 166 aa  166  1e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.162816  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0611  SSU ribosomal protein S5P  60.43 
 
 		 165 aa  166  1e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0764806  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2697  30S ribosomal protein S5  56.43 
 
 		 165 aa  163  5.9999999999999996e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2382  30S ribosomal protein S5  56.43 
 
 		 165 aa  163  5.9999999999999996e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3007  30S ribosomal protein S5  58.57 
 
 		 179 aa  163  9e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.137174  hitchhiker  0.00889655 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2694  ribosomal protein S5  58.45 
 
 		 164 aa  163  9e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1339  30S ribosomal protein S5  55.63 
 
 		 225 aa  159  8.000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000696393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0439  30S ribosomal protein S5  57.75 
 
 		 166 aa  159  9e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10735  30S ribosomal protein S5  58.62 
 
 		 220 aa  159  9e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000927793  normal  0.43056 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1632  ribosomal protein S5  58.99 
 
 		 172 aa  159  9e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0618  ribosomal protein S5  50.68 
 
 		 169 aa  159  1e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0732  ribosomal protein S5  53.9 
 
 		 190 aa  159  1e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2959  30S ribosomal protein S5  58.16 
 
 		 236 aa  159  1e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0103501  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf423  ribosomal protein S5  55.71 
 
 		 234 aa  158  2e-38  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5030  30S ribosomal protein S5  56.55 
 
 		 222 aa  158  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00000382419  normal  0.598493 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3400  ribosomal protein S5  56.55 
 
 		 215 aa  157  4e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.608039  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2316  ribosomal protein S5  60.71 
 
 		 167 aa  157  4e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00562795  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00955  30S ribosomal protein S5  52.86 
 
 		 166 aa  157  5e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.136647  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1061  30S ribosomal protein S5  56.74 
 
 		 223 aa  157  5e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.000257421  normal  0.422171 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2671  30S ribosomal protein S5  57.45 
 
 		 238 aa  157  5e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0438  30S ribosomal protein S5  53.57 
 
 		 166 aa  157  5e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0839334  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1032  30S ribosomal protein S5  56.74 
 
 		 223 aa  157  5e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00000681641  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1049  30S ribosomal protein S5  56.74 
 
 		 223 aa  157  5e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00405345  normal  0.132345 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0884  30S ribosomal protein S5  55.17 
 
 		 167 aa  156  7e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.560186  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0209  ribosomal protein S5  57.35 
 
 		 153 aa  156  9e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3988  ribosomal protein S5  56.55 
 
 		 166 aa  156  9e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0501123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2240  30S ribosomal protein S5  56.93 
 
 		 163 aa  156  9e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.109311  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2890  ribosomal protein S5  55 
 
 		 163 aa  156  1e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0248  30S ribosomal protein S5  48.3 
 
 		 167 aa  155  1e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3978  ribosomal protein S5  54.93 
 
 		 168 aa  156  1e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4673  30S ribosomal protein S5  50.34 
 
 		 168 aa  155  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000106514  unclonable  0.00000000908127 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0216  30S ribosomal protein S5  48.3 
 
 		 167 aa  155  1e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000901319  unclonable  0.0000000000154128 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0211  30S ribosomal protein S5  48.3 
 
 		 167 aa  155  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0010203  hitchhiker  0.00711343 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0216  30S ribosomal protein S5  48.3 
 
 		 167 aa  155  1e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000281151  hitchhiker  0.00000000127878 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4300  30S ribosomal protein S5  50.34 
 
 		 167 aa  155  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000220088  unclonable  0.0000000000604487 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1814  30S ribosomal protein S5  57.78 
 
 		 166 aa  155  2e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0175  30S ribosomal protein S5  50.34 
 
 		 167 aa  155  2e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000490298  decreased coverage  0.0000558993 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1202  30S ribosomal protein S5  59.56 
 
 		 208 aa  155  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.672112  normal  0.0445875 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2443  30S ribosomal protein S5  58.27 
 
 		 166 aa  155  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.995236 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1929  30S ribosomal protein S5  55.24 
 
 		 169 aa  155  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3742  30S ribosomal protein S5  47.62 
 
 		 167 aa  155  2e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000003426  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1006  30S ribosomal protein S5  49.66 
 
 		 167 aa  155  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00241211  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1928  30S ribosomal protein S5  55.94 
 
 		 168 aa  155  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.69161 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2035  30S ribosomal protein S5  55.24 
 
 		 169 aa  155  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34488  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3689  ribosomal protein S5  57.35 
 
 		 215 aa  154  3e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  0.000000541133  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2301  30S ribosomal protein S5  57.78 
 
 		 166 aa  154  3e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.186174  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0679  30S ribosomal protein S5  56.16 
 
 		 254 aa  154  3e-37  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2260  30S ribosomal protein S5  57.78 
 
 		 166 aa  154  3e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00378829  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0201  30S ribosomal protein S5  49.66 
 
 		 168 aa  154  3e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000549797  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0422  30S ribosomal protein S5  52.86 
 
 		 166 aa  154  3e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0728588  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1950  30S ribosomal protein S5  55.24 
 
 		 169 aa  155  3e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0323  SSU ribosomal protein S5P  57.64 
 
 		 199 aa  154  3e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179129 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0230  30S ribosomal protein S5  48.28 
 
 		 168 aa  154  3e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000259388  unclonable  0.00000856318 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2629  30S ribosomal protein S5  59.85 
 
 		 200 aa  154  5.0000000000000005e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.192925  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09830  SSU ribosomal protein S5P  56.03 
 
 		 173 aa  154  5.0000000000000005e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0111363  hitchhiker  0.0000146915 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0187  30S ribosomal protein S5  46.94 
 
 		 167 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000820766  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0165  30S ribosomal protein S5  46.94 
 
 		 167 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000786846  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1357  ribosomal protein S5  56.83 
 
 		 197 aa  153  6e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0715  30S ribosomal protein S5  58.09 
 
 		 189 aa  153  6e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.128922  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3805  30S ribosomal protein S5  52.14 
 
 		 166 aa  153  7e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000511085  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3984  30S ribosomal protein S5  52.14 
 
 		 166 aa  153  7e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.183647  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0077  30S ribosomal protein S5  52.14 
 
 		 166 aa  153  8e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0793538  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3888  SSU ribosomal protein S5P  55.24 
 
 		 205 aa  153  8e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.361  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>